Titre :	Étude de l’implication des polymorphismes fonctionnels Arg72Pro du gène TP53 et T309G du gène MDM2 dans la survenue du Cancer Colorectal, du Carcinome Basocellulaire et de la Polyarthrite Rhumatoïde dans la population de l’Ouest algérien
Type de document :	document électronique
Auteurs :	Rym Khadidja ABDERRAHMANE ép TAIEB TAMACHA, Auteur
Année de publication :	2016
Importance :	188 p.
Accompagnement :	CD
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biotechnologie :biologie moléculaire
Mots-clés :	Arg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, OArg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, Ouest algérien, Association.uest algérien, Association. Arg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, Ouest algérien, Association
Résumé :	Le paradigme P53-MDM2 représente la relation la plus étudiée entre le gène suppresseur de tumeur TP53 et son régulateur négatif l’oncogène MDM2. En effet, ces deux gènes ont fait depuis longtemps l'objet de très nombreux travaux. Leurs natures polymorphes et leurs rôles centraux dans la régulation du cycle cellulaire et l’apoptose ont mis en évidence leurs potentiels de gènes candidats dans la susceptibilité à la survenue de différents pathologies. Bien que plusieurs polymorphismes aient été étudiés comme facteurs de risque pour différents cancers, les plus largement étudiés sont le polymorphisme Arg72Pro (rs1042522) pour le gène TP53, connu pour ses différentes fonctions biologiques et le SNP 309G/T (rs2279744) pour l'oncogène MDM2. Mais malgré l'importance de ces polymorphismes dans l'évolution tumorale, les résultats restent à l'heure actuelle très controversés et hétérogènes (Cai, X. and M. Yang ; 2012). Notre objetcif est d'explorer la participation du SNP309 du gène MDM2 et le SNP Arg72Pro du gène TP53, dans l’expressivité non seulement de deux types de cancers (CCR et CBC) mais aussi d'une maladie auto immune qui est la Polyarthrite Rhumatoide ( PR) dans la population de l’Ouest Algérien. Afin d’évaluer l’impact du SNP Arg72Pro du gène TP53 et le SNP T309G de l’oncogène MDM2 dans le développement du CCR, du CBC et de la PR, nous avons étudié le déséquilibre de transmission allélique de ces derniers dans une population constituée de 116 malades atteints de CCR, 50 sujets atteints de CBC, de 101 sujets présentant une PR et enfin une population contrôle constituée de 121 individus sains. Ces SNPs ont été explorés par la technique de Biologie Moléculaire PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment Length Polymorphism). Dans cette étude, l’association du marqueur Arg72Pro avec le CBC et avec la PR a montré une augmentation significative de l’allèle Pro chez les malades par rapport aux contrôles. Cet allèle semble apporter un risque très important de développer le CBC et la PR dans notre population. Par ailleurs, les résultats n’ont montré aucune différence significative entre les sujets atteints de CCR et les contôles, ce qui pourrait exclure l’implication du polymorphisme Arg/Pro dans la survenue du CCR dans notre population. D’autre part, nous avons analysé le déséquilibre de transmission allélique du SNP309 chez des témoins et des sujets atteints de CCR et PR afin d’évaluer l’impact de MDM2 sur le développement de ces pathologies. Nos résultats ont montré un résultat contradictoire. En effet, pour la population CCR, un effet protecteur de l’allèle G est rapporté chez les cas et surtout chez les femmes par rapport aux contrôles. Par contre, une association significative est retrouvée entre l’allèle G du SNP309 de MDM2 et les sujets atteints de PR. Malheuresement, le SNP309 du gène MDM2 n’a pas pu être génotypé chez les sujets atteints de CBC. Enfin un protocole in silico utilisant différents logiciels gratuits a été utilisé pour prédire l’effet de ses deux SNP fonctionnels. En conclusion, il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes de la voie P53 afin de caractériser d’une manière plus précise le déterminisme génétique de ces pathologies dans notre population. De plus, des études ultérieures sur l’implication des facteurs environnementaux au sein d’une population à effectif plus large seront nécessaires afin de proposer les stratégies de prévention et éventuellement de réponse au traitement pour les différentes pathologies étudiées. The P53-Mdm2 paradigm represents the most studied relationship between the tumor suppressor gene TP53 and its negative regulator MDM2 oncogene. Indeed, these two genes have long been the subject of numerous studies. Their polymorphic nature and their central roles in regulating the cell cycle and apoptosis have demonstrated their potential candidate genes in the susceptibility to the occurrence of various pathologies. Although several polymorphisms were studied as risk factors for various cancers, the most widely studied are the Arg72Pro polymorphism (rs1042522) in the TP53 gene, known for its various biological functions and SNP 309G / T (rs2279744) for the oncogene MDM2. But despite the importance of these polymorphisms in tumor progression, the results are currently controversial and heterogeneous (Cai, X. and Yang, 2012). Our objetcif is to explore the participation of the MDM2 gene SNP309 and SNP Arg72Pro TP53 gene expression not only in the two types of cancer (CRC and CBC) as well as an auto immune disease is rheumatoid arthritis (PR) in the western Algerian population. To assess the impact of SNP Arg72Pro TP53 gene and SNP T309G MDM2 oncogene in the development of the JRC, the CBC and the PR, we studied the allelic transmission disequilibrium these in a population consisting 116 patients with RCC, 50 patients with CBC, 101 subjects with RA and finally a control population comprised 121 healthy individuals. These SNPs were investigated by the technique of Molecular Biology PCR / RFLP (polymerase chain reaction / restriction fragment length polymorphism). In this study, the combination of Arg72Pro marker with the CBC and with RA showed a significant increase in the Pro allele in patients compared to controls. This allele appears to provide a very high risk of developing RA and CBC in our population. Furthermore, the results showed no significant difference between patients with RCC andcontôles, which could exclude the involvement of the Arg / Pro polymorphism in the development of the JRC in our population. Furthermore, we analyzed the allelic imbalance SNP309 transmission in control and patients with CCR and PR to assess the impact of MDM2 on the development of these pathologies. Our results showed a contradictory result. Indeed, for the JRC population, a protective effect of the G allele is reported in cases and especially in women compared to controls. By cons, a significant association was found between the G allele of SNP309 MDM2 and subjects with RA. Unfortunately, the SNP309 of MDM2 gene could not be genotyped in individuals with CBC. Finally, an in silico protocol using various free software was used to predict the effect of its two functionalSNPs. In conclusion, it would be interesting to explore other gene polymorphisms of the P53 pathway to characterize a more precise genetic determinism of these diseases in our population. In addition, further studies on the involvement of environmental factors within a wider effective population will be required to propose prevention strategies and possibly treatment response for the different pathologies studied.
Directeur de thèse :	SAIDI-MEHTAR Nadhira

Étude de l’implication des polymorphismes fonctionnels Arg72Pro du gène TP53 et T309G du gène MDM2 dans la survenue du Cancer Colorectal, du Carcinome Basocellulaire et de la Polyarthrite Rhumatoïde dans la population de l’Ouest algérien [document électronique] / Rym Khadidja ABDERRAHMANE ép TAIEB TAMACHA, Auteur . - 2016 . - 188 p. + CD.
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biotechnologie :biologie moléculaire
Mots-clés :	Arg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, OArg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, Ouest algérien, Association.uest algérien, Association. Arg72Pro, TP53, T309G, MDM2, CCR, CBC, PR, Ouest algérien, Association
Résumé :	Le paradigme P53-MDM2 représente la relation la plus étudiée entre le gène suppresseur de tumeur TP53 et son régulateur négatif l’oncogène MDM2. En effet, ces deux gènes ont fait depuis longtemps l'objet de très nombreux travaux. Leurs natures polymorphes et leurs rôles centraux dans la régulation du cycle cellulaire et l’apoptose ont mis en évidence leurs potentiels de gènes candidats dans la susceptibilité à la survenue de différents pathologies. Bien que plusieurs polymorphismes aient été étudiés comme facteurs de risque pour différents cancers, les plus largement étudiés sont le polymorphisme Arg72Pro (rs1042522) pour le gène TP53, connu pour ses différentes fonctions biologiques et le SNP 309G/T (rs2279744) pour l'oncogène MDM2. Mais malgré l'importance de ces polymorphismes dans l'évolution tumorale, les résultats restent à l'heure actuelle très controversés et hétérogènes (Cai, X. and M. Yang ; 2012). Notre objetcif est d'explorer la participation du SNP309 du gène MDM2 et le SNP Arg72Pro du gène TP53, dans l’expressivité non seulement de deux types de cancers (CCR et CBC) mais aussi d'une maladie auto immune qui est la Polyarthrite Rhumatoide ( PR) dans la population de l’Ouest Algérien. Afin d’évaluer l’impact du SNP Arg72Pro du gène TP53 et le SNP T309G de l’oncogène MDM2 dans le développement du CCR, du CBC et de la PR, nous avons étudié le déséquilibre de transmission allélique de ces derniers dans une population constituée de 116 malades atteints de CCR, 50 sujets atteints de CBC, de 101 sujets présentant une PR et enfin une population contrôle constituée de 121 individus sains. Ces SNPs ont été explorés par la technique de Biologie Moléculaire PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment Length Polymorphism). Dans cette étude, l’association du marqueur Arg72Pro avec le CBC et avec la PR a montré une augmentation significative de l’allèle Pro chez les malades par rapport aux contrôles. Cet allèle semble apporter un risque très important de développer le CBC et la PR dans notre population. Par ailleurs, les résultats n’ont montré aucune différence significative entre les sujets atteints de CCR et les contôles, ce qui pourrait exclure l’implication du polymorphisme Arg/Pro dans la survenue du CCR dans notre population. D’autre part, nous avons analysé le déséquilibre de transmission allélique du SNP309 chez des témoins et des sujets atteints de CCR et PR afin d’évaluer l’impact de MDM2 sur le développement de ces pathologies. Nos résultats ont montré un résultat contradictoire. En effet, pour la population CCR, un effet protecteur de l’allèle G est rapporté chez les cas et surtout chez les femmes par rapport aux contrôles. Par contre, une association significative est retrouvée entre l’allèle G du SNP309 de MDM2 et les sujets atteints de PR. Malheuresement, le SNP309 du gène MDM2 n’a pas pu être génotypé chez les sujets atteints de CBC. Enfin un protocole in silico utilisant différents logiciels gratuits a été utilisé pour prédire l’effet de ses deux SNP fonctionnels. En conclusion, il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes de la voie P53 afin de caractériser d’une manière plus précise le déterminisme génétique de ces pathologies dans notre population. De plus, des études ultérieures sur l’implication des facteurs environnementaux au sein d’une population à effectif plus large seront nécessaires afin de proposer les stratégies de prévention et éventuellement de réponse au traitement pour les différentes pathologies étudiées. The P53-Mdm2 paradigm represents the most studied relationship between the tumor suppressor gene TP53 and its negative regulator MDM2 oncogene. Indeed, these two genes have long been the subject of numerous studies. Their polymorphic nature and their central roles in regulating the cell cycle and apoptosis have demonstrated their potential candidate genes in the susceptibility to the occurrence of various pathologies. Although several polymorphisms were studied as risk factors for various cancers, the most widely studied are the Arg72Pro polymorphism (rs1042522) in the TP53 gene, known for its various biological functions and SNP 309G / T (rs2279744) for the oncogene MDM2. But despite the importance of these polymorphisms in tumor progression, the results are currently controversial and heterogeneous (Cai, X. and Yang, 2012). Our objetcif is to explore the participation of the MDM2 gene SNP309 and SNP Arg72Pro TP53 gene expression not only in the two types of cancer (CRC and CBC) as well as an auto immune disease is rheumatoid arthritis (PR) in the western Algerian population. To assess the impact of SNP Arg72Pro TP53 gene and SNP T309G MDM2 oncogene in the development of the JRC, the CBC and the PR, we studied the allelic transmission disequilibrium these in a population consisting 116 patients with RCC, 50 patients with CBC, 101 subjects with RA and finally a control population comprised 121 healthy individuals. These SNPs were investigated by the technique of Molecular Biology PCR / RFLP (polymerase chain reaction / restriction fragment length polymorphism). In this study, the combination of Arg72Pro marker with the CBC and with RA showed a significant increase in the Pro allele in patients compared to controls. This allele appears to provide a very high risk of developing RA and CBC in our population. Furthermore, the results showed no significant difference between patients with RCC andcontôles, which could exclude the involvement of the Arg / Pro polymorphism in the development of the JRC in our population. Furthermore, we analyzed the allelic imbalance SNP309 transmission in control and patients with CCR and PR to assess the impact of MDM2 on the development of these pathologies. Our results showed a contradictory result. Indeed, for the JRC population, a protective effect of the G allele is reported in cases and especially in women compared to controls. By cons, a significant association was found between the G allele of SNP309 MDM2 and subjects with RA. Unfortunately, the SNP309 of MDM2 gene could not be genotyped in individuals with CBC. Finally, an in silico protocol using various free software was used to predict the effect of its two functionalSNPs. In conclusion, it would be interesting to explore other gene polymorphisms of the P53 pathway to characterize a more precise genetic determinism of these diseases in our population. In addition, further studies on the involvement of environmental factors within a wider effective population will be required to propose prevention strategies and possibly treatment response for the different pathologies studied.
Directeur de thèse :	SAIDI-MEHTAR Nadhira