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Etude génétique de la mucoviscidose dans un échantillon de la population Algérienne / Fatima Zohra SEDIKI

Public ISBD Titre : Etude génétique de la mucoviscidose dans un échantillon de la population Algérienne Type de document : document électronique Auteurs : Fatima Zohra SEDIKI, Auteur Année de publication : 2015 Importance : 150 p Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :biologie moléculaire Mots-clés : Mucoviscidose, gène CFTR, mutations, PCR, PCR/ARMS, séquençage, étude in silico. Résumé : La mucoviscidose est la maladie autosomique récessive grave la plus fréquente dans la population d’origine caucasienne. Elle est due à des anomalies du gène CFTR, dont les multiples mutations décrites rendent compte en partie de la grande variabilité phénotypique. Loin d’être une pathologie européenne la mucoviscidose est présente en Algérie. A l’heure du développement de thérapies ciblées selon les mutations portées par les patients, la caractérisation de ces dernières est plus qu’indispensable. La première partie de ce travail est focalisée sur la recherche des anomalies du gène CFTR responsable de la mucoviscidose dans un échantillon de 24 patients appartenant à 24 familles non apparentées. L’exploration des mutations est réalisée par différentes techniques de biologie moléculaire (PCR, PCR/ARMS, séquençage), 14 mutations différentes ont pu être identifiées. Dans la deuxième partie de cette thèse nous nous sommes intéressés à trois mutations qui de par la littérature semblent spécifiques à la population Algérienne : c.680T>G (L227R), c.3907A>C (N1303H), c.422C>A (A141D). Les effets délétères de ces mutations ont été étudiés par le biais d’une combinaison de logiciels d’étude in silico et de modélisation moléculaire tridimensionnelle (3D). La mutation c.680T>G (L227R) a été prédite comme altérant les relations hydrophobes au cœur même de la protéine ou avec les lipides formant la membrane. D’autre part, la c.3907A>C (N1303H) a été prédite comme délétère altérant la structure et la fonction du canal CFTR, les changements physicochimiques entre les acides aminés natifs et mutés perturbent fortement la stabilité de la protéine. Enfin, la mutation c.422C>A (A141D) est prédite comme délétère et semble perturber les interactions ioniques, mais aussi les interactions au sein des différents segments formant le pore du canal CFTR. Les résultats obtenus au terme de ce travail auraient pour but de contribuer à moyen terme à la mise en place d’un programme de diagnostic génétique, et à la mise à disposition de conseil génétique pour les familles à risque. A long terme, ces résultats pourraient aider à une meilleure compréhension des mécanismes moléculaire à l’origine de cette pathologie. Directeur de thèse : BOUDJEMA ,Abdallah Etude génétique de la mucoviscidose dans un échantillon de la population Algérienne [document électronique] / Fatima Zohra SEDIKI, Auteur . - 2015 . - 150 p + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :biologie moléculaire Mots-clés : Mucoviscidose, gène CFTR, mutations, PCR, PCR/ARMS, séquençage, étude in silico. Résumé : La mucoviscidose est la maladie autosomique récessive grave la plus fréquente dans la population d’origine caucasienne. Elle est due à des anomalies du gène CFTR, dont les multiples mutations décrites rendent compte en partie de la grande variabilité phénotypique. Loin d’être une pathologie européenne la mucoviscidose est présente en Algérie. A l’heure du développement de thérapies ciblées selon les mutations portées par les patients, la caractérisation de ces dernières est plus qu’indispensable. La première partie de ce travail est focalisée sur la recherche des anomalies du gène CFTR responsable de la mucoviscidose dans un échantillon de 24 patients appartenant à 24 familles non apparentées. L’exploration des mutations est réalisée par différentes techniques de biologie moléculaire (PCR, PCR/ARMS, séquençage), 14 mutations différentes ont pu être identifiées. Dans la deuxième partie de cette thèse nous nous sommes intéressés à trois mutations qui de par la littérature semblent spécifiques à la population Algérienne : c.680T>G (L227R), c.3907A>C (N1303H), c.422C>A (A141D). Les effets délétères de ces mutations ont été étudiés par le biais d’une combinaison de logiciels d’étude in silico et de modélisation moléculaire tridimensionnelle (3D). La mutation c.680T>G (L227R) a été prédite comme altérant les relations hydrophobes au cœur même de la protéine ou avec les lipides formant la membrane. D’autre part, la c.3907A>C (N1303H) a été prédite comme délétère altérant la structure et la fonction du canal CFTR, les changements physicochimiques entre les acides aminés natifs et mutés perturbent fortement la stabilité de la protéine. Enfin, la mutation c.422C>A (A141D) est prédite comme délétère et semble perturber les interactions ioniques, mais aussi les interactions au sein des différents segments formant le pore du canal CFTR. Les résultats obtenus au terme de ce travail auraient pour but de contribuer à moyen terme à la mise en place d’un programme de diagnostic génétique, et à la mise à disposition de conseil génétique pour les familles à risque. A long terme, ces résultats pourraient aider à une meilleure compréhension des mécanismes moléculaire à l’origine de cette pathologie. Directeur de thèse : BOUDJEMA ,Abdallah

Exemplaires

Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
4642	02-34-67	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt