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Etude de l'efficacite de la macromolecule spinosad sur la mineuse de tomate tuta absoluta dans la region de sidi bel abbes. / Karim OUADAH
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Titre : Etude de l'efficacite de la macromolecule spinosad sur la mineuse de tomate tuta absoluta dans la region de sidi bel abbes. : contribution de la modelisation moleculaire. Type de document : document électronique Auteurs : Karim OUADAH, Auteur ; TCHOUAR, Noureddine, Directeur de thèse Année de publication : 2012 Importance : 80 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Productions végétales et microbiennes Mots-clés : Tomate, Tuta absoluta, Spinosad, efficacité, ADF, Accelrys, Spartan plus, étude structurale, chiralité, étude électronique, étude spectrale. Résumé : La mineuse de la tomate Tuta absoluta Meyrick est devenue le ravageur de la tomate le plus important en Algérie. Elle ne cesse de causer des dégâts spectaculaires depuis son introduction en 2008. La lutte contre cet insecte nécessite la recherche de plusieurs méthodes de lutte dont la complémentarité doit résoudre le problème.
Le travail expérimental a été porté sur la dynamique des populations de Tuta absoluta sur une culture de tomate en plein champ, installée dans une ferme à proximité de la commune de Hassi Abed de la wilaya de Sidi Bel-Abbès.
L’essai a montré un niveau d’infestation progressif par Tuta absoluta de mars à juin 2010. Des traitements effectués sur le terrain avec des insecticides différents (Abamectine, Indoxacarb et le Téflubenzuron) ont montré des contrôles hétérogènes, l’une par rapport à l’autre. Une efficacité assez élevée sur les stades larvaires (mortalité proche de 87 %) a été constaté avec l’application du spinosad.
Le spinosad est une substance active de produit phytosanitaire (ou produit phytopharmaceutique, ou pesticide), qui présente un effet insecticide. C'est un produit fermenté d'origine biologique dérivé du mélange de deux toxines (spinosyne A et D) sécrétées par une bactérie vivant dans le sol, Saccharopolyspora spinosa.
Un travail théorique a été consacré pour cette macromolécule afin de pouvoir comprendre sa stabilité. Nous avons utilisé les outils informatiques (« ADF, Accelrys et Spartan plus ») pour mettre en évidence ces différentes propriétés, entre les deux formes de la spinosyne A et D.
L’étude structurale nous a confirmé des différences dans certaines distances et angles dièdres, spécifique au site actif (cyclohexène) des deux formes A et D.
Enfin, en ce qui concerne l’étude électronique, les HOMO et les LUMO des deux formes interviennent remarquablement pour expliquer la stabilité de ces spinosynes Aet D.
L’étude spectrale a révélé aussi la différence entre ces deux macromolécules dans les différentes fréquences de vibrations et une différence dans la chiralité.
L’hydratation du spinosyne A, a montré les probables liaisons hydrogènes avec les molécules d’eau dans les différents sites cycliques du spinosad.Etude de l'efficacite de la macromolecule spinosad sur la mineuse de tomate tuta absoluta dans la region de sidi bel abbes. : contribution de la modelisation moleculaire. [document électronique] / Karim OUADAH, Auteur ; TCHOUAR, Noureddine, Directeur de thèse . - 2012 . - 80 p. + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Productions végétales et microbiennes Mots-clés : Tomate, Tuta absoluta, Spinosad, efficacité, ADF, Accelrys, Spartan plus, étude structurale, chiralité, étude électronique, étude spectrale. Résumé : La mineuse de la tomate Tuta absoluta Meyrick est devenue le ravageur de la tomate le plus important en Algérie. Elle ne cesse de causer des dégâts spectaculaires depuis son introduction en 2008. La lutte contre cet insecte nécessite la recherche de plusieurs méthodes de lutte dont la complémentarité doit résoudre le problème.
Le travail expérimental a été porté sur la dynamique des populations de Tuta absoluta sur une culture de tomate en plein champ, installée dans une ferme à proximité de la commune de Hassi Abed de la wilaya de Sidi Bel-Abbès.
L’essai a montré un niveau d’infestation progressif par Tuta absoluta de mars à juin 2010. Des traitements effectués sur le terrain avec des insecticides différents (Abamectine, Indoxacarb et le Téflubenzuron) ont montré des contrôles hétérogènes, l’une par rapport à l’autre. Une efficacité assez élevée sur les stades larvaires (mortalité proche de 87 %) a été constaté avec l’application du spinosad.
Le spinosad est une substance active de produit phytosanitaire (ou produit phytopharmaceutique, ou pesticide), qui présente un effet insecticide. C'est un produit fermenté d'origine biologique dérivé du mélange de deux toxines (spinosyne A et D) sécrétées par une bactérie vivant dans le sol, Saccharopolyspora spinosa.
Un travail théorique a été consacré pour cette macromolécule afin de pouvoir comprendre sa stabilité. Nous avons utilisé les outils informatiques (« ADF, Accelrys et Spartan plus ») pour mettre en évidence ces différentes propriétés, entre les deux formes de la spinosyne A et D.
L’étude structurale nous a confirmé des différences dans certaines distances et angles dièdres, spécifique au site actif (cyclohexène) des deux formes A et D.
Enfin, en ce qui concerne l’étude électronique, les HOMO et les LUMO des deux formes interviennent remarquablement pour expliquer la stabilité de ces spinosynes Aet D.
L’étude spectrale a révélé aussi la différence entre ces deux macromolécules dans les différentes fréquences de vibrations et une différence dans la chiralité.
L’hydratation du spinosyne A, a montré les probables liaisons hydrogènes avec les molécules d’eau dans les différents sites cycliques du spinosad.Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 4673 02-34-36 Version numérique et papier Bibliothèque USTOMB Mémoire de Magister Exclu du prêt Documents numériques
02-34-36Adobe Acrobat PDFSimulation par modélisation moléculaire de l’activité biologique de certains dérivés des Pyrazolones Etude de l’inhibition de l’ALK kinase par la méthode QSAR / Karim OUADAH
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Titre : Simulation par modélisation moléculaire de l’activité biologique de certains dérivés des Pyrazolones Etude de l’inhibition de l’ALK kinase par la méthode QSAR Type de document : document électronique Auteurs : Karim OUADAH, Auteur Année de publication : 2018-2019 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biothechnologie Mots-clés : Modélisation Moléculaire, Activité Biologique, Pyrazolones, ALK inhibition, et QSAR. Résumé : Dans ce travail de recherche, nous présentons une étude théorique de la relation quantitative structure-activité (QSAR) inhibitrice de lymphome Anaplastic kinase (ALK), réalisée à partir des dérivés de la pyrazolone. L’objectif de notre recherche sur ces molécules est de prédire l’activité biologique et d'établir un modèle pharmacophore, pour avoir de nouvelles molécules bioactives.
Une étude qualitative de la relation structure–propriétés/activité, a été effectuée également pour une série bioactive de dérivés de la pyrazolone. La nature des groupements sur le noyau hétérocyclique des molécules étudiées, affecte leurs propriétés physicochimiques et par conséquence sur leurs propriétés pharmacologiques.
L’étude QSAR, a été effectuée sur vingt quatre molécules analogues aux pyrazolones; en conséquence, nous avons utilisé la modélisation moléculaire, telles que les méthodes quantiques (ab-initio) et la mécanique moléculaire (MM). Le choix de ces méthodes, nous amène à déterminer les différents paramètres géométriques, électroniques et énergétiques, associés aux molécules étudiées. A noter, que ces paramètres optimisés obtenus sont en accord avec les valeurs expérimentales, afin d’illustrer les relations quantitatives entre les descripteurs moléculaires et l'activité biologique des dérivés de la pyrazolone.
Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et les valeurs prédites de l’activité inhibitrice de l’ALK kinase, considéré comme un composant dans cette étude. Nos résultats, suggèrent un modèle QSAR, basé sur les descripteurs suivants: S, V, Log P, POL, Réf, HOMO, LUMO,E, μ, HBA, PSA et NRB, ce qui indique la validité et la qualité du modèle QSAR, obtenu à travers la régression linéaire multiple (RLM).
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Simulation par modélisation moléculaire de l’activité biologique de certains dérivés des Pyrazolones Etude de l’inhibition de l’ALK kinase par la méthode QSAR [document électronique] / Karim OUADAH, Auteur . - 2018-2019 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biothechnologie Mots-clés : Modélisation Moléculaire, Activité Biologique, Pyrazolones, ALK inhibition, et QSAR. Résumé : Dans ce travail de recherche, nous présentons une étude théorique de la relation quantitative structure-activité (QSAR) inhibitrice de lymphome Anaplastic kinase (ALK), réalisée à partir des dérivés de la pyrazolone. L’objectif de notre recherche sur ces molécules est de prédire l’activité biologique et d'établir un modèle pharmacophore, pour avoir de nouvelles molécules bioactives.
Une étude qualitative de la relation structure–propriétés/activité, a été effectuée également pour une série bioactive de dérivés de la pyrazolone. La nature des groupements sur le noyau hétérocyclique des molécules étudiées, affecte leurs propriétés physicochimiques et par conséquence sur leurs propriétés pharmacologiques.
L’étude QSAR, a été effectuée sur vingt quatre molécules analogues aux pyrazolones; en conséquence, nous avons utilisé la modélisation moléculaire, telles que les méthodes quantiques (ab-initio) et la mécanique moléculaire (MM). Le choix de ces méthodes, nous amène à déterminer les différents paramètres géométriques, électroniques et énergétiques, associés aux molécules étudiées. A noter, que ces paramètres optimisés obtenus sont en accord avec les valeurs expérimentales, afin d’illustrer les relations quantitatives entre les descripteurs moléculaires et l'activité biologique des dérivés de la pyrazolone.
Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et les valeurs prédites de l’activité inhibitrice de l’ALK kinase, considéré comme un composant dans cette étude. Nos résultats, suggèrent un modèle QSAR, basé sur les descripteurs suivants: S, V, Log P, POL, Réf, HOMO, LUMO,E, μ, HBA, PSA et NRB, ce qui indique la validité et la qualité du modèle QSAR, obtenu à travers la régression linéaire multiple (RLM).
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 1615 02-34-112 Version numérique et papier Bibliothèque USTOMB Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
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