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Etude des Associations Symbiotiques de Retama monosperma / SELAMI Nawel 

Public ISBD Titre : Etude des Associations Symbiotiques de Retama monosperma : Approches Morphologique, Anatomique et Ultrastructurale, Caractérisation Moléculaire des Isolats Type de document : document électronique Auteurs : SELAMI Nawel, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse Année de publication : 2015 Importance : 77 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Production et valorisation végétale Mots-clés : Retama monosperma.Association symbiotique. Microscopie. Bradyrhizobium . Bacteries endophytes. Résumé : R. monosperma est une légumineuse arbustive capable d’établir une symbiose fixatrice d'azote avec des bactéries du sol, Rhizobia. Cette interaction aboutit à la formation de nodules au niveau du système racinaire de la plante. Comme l’étude de l’interaction symbiotique entre R. monosperma et les Rhizobia n’a pas été largement étudiée et Compte tenu du rôle primordial que joue cette espèce dans la bio-fertilisation et la stabilisation des dunes mobiles, nous nous sommes proposés dans la présente thèse d’établir la première étude détaillée de la morphologie et l’anatomie des nodules de R. monosperma. En effet, des nodules sauvages collectés des dunes côtières d’Oran, ont fait l’objet d’une (i) étude anatomique et ultrastructurale par microscopie photonique et électronique ; (ii) analyse génétique des microsymbiotes basée sur les séquences de gènes ARNr 16S, atpD, glnII et recA ; (iii) analyse de l’endoréduplication chez R. monosperma par cytométrie en flux. La caractérisation génétique des microsymbiotes de R. monosperma, indique que ces bactéries sont taxonomiquement très proche, voir identique aux microsymbiotes de R. sphaerocarpa récemment identifiés par Guerrouj et al. (2013), et nommée Bradyrhizobium retamae. L’étude anatomique et ultrastructurale révéle que les nodules de R. monosperma sont à croissance indéterminée, de type genistoide. Le cordon d’infection typique de la majorité des legumineuses est absent dans les nodules de R. monosperma et la diffusion de l’infection est assurée par la division des cellules nouvellement infectées. La zone fixatrice d’azote est homogène aux cellules complètement infectées et le réseau de cellules non envahi commun à la plupart des légumineuses est absent. De plus, le taux d’endoréduplication indispensable pour la différenciation des bactéroïdes dans les nodules indéterminés est trop faible voir nul dans les nodules de R. monosperma. En outre, plusieurs bactéries bénéfiques comme Methylobacterium et Pseudomonas koreensis ont été isolées à partir de nodules racinaires de R. monosperma. Dans cette étude, les premiers stades du processus de colonisation par Methylobacterium sp et P. koreensis, sont visualisés conjointement au microscope photonique et électronique. Des résultats préliminaires, témoignent clairement que P. koreensis et Methylobacterium sp se comportent comme bactéries endophytes associatives, qui peuvent nicher à l’intérieur des tissus de R. monosperma, sans lui induire de maladies symptomatiques. Etude des Associations Symbiotiques de Retama monosperma : Approches Morphologique, Anatomique et Ultrastructurale, Caractérisation Moléculaire des Isolats [document électronique] / SELAMI Nawel, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse . - 2015 . - 77 p. + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Production et valorisation végétale Mots-clés : Retama monosperma.Association symbiotique. Microscopie. Bradyrhizobium . Bacteries endophytes. Résumé : R. monosperma est une légumineuse arbustive capable d’établir une symbiose fixatrice d'azote avec des bactéries du sol, Rhizobia. Cette interaction aboutit à la formation de nodules au niveau du système racinaire de la plante. Comme l’étude de l’interaction symbiotique entre R. monosperma et les Rhizobia n’a pas été largement étudiée et Compte tenu du rôle primordial que joue cette espèce dans la bio-fertilisation et la stabilisation des dunes mobiles, nous nous sommes proposés dans la présente thèse d’établir la première étude détaillée de la morphologie et l’anatomie des nodules de R. monosperma. En effet, des nodules sauvages collectés des dunes côtières d’Oran, ont fait l’objet d’une (i) étude anatomique et ultrastructurale par microscopie photonique et électronique ; (ii) analyse génétique des microsymbiotes basée sur les séquences de gènes ARNr 16S, atpD, glnII et recA ; (iii) analyse de l’endoréduplication chez R. monosperma par cytométrie en flux. La caractérisation génétique des microsymbiotes de R. monosperma, indique que ces bactéries sont taxonomiquement très proche, voir identique aux microsymbiotes de R. sphaerocarpa récemment identifiés par Guerrouj et al. (2013), et nommée Bradyrhizobium retamae. L’étude anatomique et ultrastructurale révéle que les nodules de R. monosperma sont à croissance indéterminée, de type genistoide. Le cordon d’infection typique de la majorité des legumineuses est absent dans les nodules de R. monosperma et la diffusion de l’infection est assurée par la division des cellules nouvellement infectées. La zone fixatrice d’azote est homogène aux cellules complètement infectées et le réseau de cellules non envahi commun à la plupart des légumineuses est absent. De plus, le taux d’endoréduplication indispensable pour la différenciation des bactéroïdes dans les nodules indéterminés est trop faible voir nul dans les nodules de R. monosperma. En outre, plusieurs bactéries bénéfiques comme Methylobacterium et Pseudomonas koreensis ont été isolées à partir de nodules racinaires de R. monosperma. Dans cette étude, les premiers stades du processus de colonisation par Methylobacterium sp et P. koreensis, sont visualisés conjointement au microscope photonique et électronique. Des résultats préliminaires, témoignent clairement que P. koreensis et Methylobacterium sp se comportent comme bactéries endophytes associatives, qui peuvent nicher à l’intérieur des tissus de R. monosperma, sans lui induire de maladies symptomatiques.

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4635	02-34-74	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

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Etude histologique de la graine d'Arganier(Argania spinosa(L.)Skeels)et métabolique et transcriptomique des lipides / ERROUANE Kheira 

Public ISBD Titre : Etude histologique de la graine d'Arganier(Argania spinosa(L.)Skeels)et métabolique et transcriptomique des lipides Type de document : document électronique Auteurs : ERROUANE Kheira, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse Année de publication : 2016 Importance : 331 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Production et valorisation végétale Mots-clés : Argania spinosa, lipides, graine, embryon, albumen, acides gras, tocophérols, desméthylstérols, alcools triterpéniques, transcriptome. Résumé : La composition lipidique dans les tissus de la graine d'Arganier (Argania spinosa (L. Skeels)), leur anatomie et leur niveau de ploïdie ont été étudiés en utilisant un modèle expérimental comprenant deux sites en Algérie (Stidia et Tindouf). L’étude de la biosynthèse des lipides a été effectuée au cours du développement de la graine de Stidia. Par l’utilisation de la cytométrie en flux, nous avons déterminé que la graine est constituée de deux tissus bien développés, l'embryon et l'albumen (120 mg contre 156 mg, au stade mature). La teneur en lipides dans l'embryon est supérieure à celle de l'albumen à partir du stade 7 (environ 66 % contre 54 %, au stade mature) mais les deux tissus contribuent de manière équivalente au rendement d’huile (environ 80 mg). Des différences considérables dans la composition en acides gras ont été observées entre ces deux organes. En particulier, dans l'albumen où le pourcentage de l’acide C18: 2 est deux fois plus élevé que dans l'embryon. La teneur en tocophérols est également nettement supérieure dans l’albumen. En revanche, ils présentent un contenu et des compositions similaires de desméthylstérols et des alcools triterpéniques, au stade mature. Durant leur développement, l’évolution des acides gras montre que la teneur en C18:1 augmente contrairement au C18:2 qui décroît. Cette approche biochimique a été couplée à une analyse transcriptomique. Un travail de bioanalyse a permis de construire les voies de biosynthèse des lipides dans l’albumen et l’embryon. Ces deux tissus emploient les mêmes paralogues pour la majorité des étapes de synthèse des acides gras et l’assemblage de triacylglycérols. Le cœur du déterminisme de la composition en acides gras semble se situer au niveau de l’échange d’acides gras polyinsaturés (C18:2) entre le pool des phospholipides et la voie de Kennedy, effectué par les enzymes phospholipide:diacylglycérol acyltransférase et phosphatidylcholine diacylglycérol cholinephosphotransférase. Nos résultats suggèrent que la production d’une huile riche en linoléique dans l’albumen est principalement gouvernée par la surexpression des gènes codants pour ces deux enzymes. Nous supposons aussi qu’il pourrait exister une relation quantitative entre le niveau de transcription du gène codant pour le facteur de transcription AsWRI1 et la quantité d’huile accumulée. ________________________________________ Etude histologique de la graine d'Arganier(Argania spinosa(L.)Skeels)et métabolique et transcriptomique des lipides [document électronique] / ERROUANE Kheira, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse . - 2016 . - 331 p. + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Production et valorisation végétale Mots-clés : Argania spinosa, lipides, graine, embryon, albumen, acides gras, tocophérols, desméthylstérols, alcools triterpéniques, transcriptome. Résumé : La composition lipidique dans les tissus de la graine d'Arganier (Argania spinosa (L. Skeels)), leur anatomie et leur niveau de ploïdie ont été étudiés en utilisant un modèle expérimental comprenant deux sites en Algérie (Stidia et Tindouf). L’étude de la biosynthèse des lipides a été effectuée au cours du développement de la graine de Stidia. Par l’utilisation de la cytométrie en flux, nous avons déterminé que la graine est constituée de deux tissus bien développés, l'embryon et l'albumen (120 mg contre 156 mg, au stade mature). La teneur en lipides dans l'embryon est supérieure à celle de l'albumen à partir du stade 7 (environ 66 % contre 54 %, au stade mature) mais les deux tissus contribuent de manière équivalente au rendement d’huile (environ 80 mg). Des différences considérables dans la composition en acides gras ont été observées entre ces deux organes. En particulier, dans l'albumen où le pourcentage de l’acide C18: 2 est deux fois plus élevé que dans l'embryon. La teneur en tocophérols est également nettement supérieure dans l’albumen. En revanche, ils présentent un contenu et des compositions similaires de desméthylstérols et des alcools triterpéniques, au stade mature. Durant leur développement, l’évolution des acides gras montre que la teneur en C18:1 augmente contrairement au C18:2 qui décroît. Cette approche biochimique a été couplée à une analyse transcriptomique. Un travail de bioanalyse a permis de construire les voies de biosynthèse des lipides dans l’albumen et l’embryon. Ces deux tissus emploient les mêmes paralogues pour la majorité des étapes de synthèse des acides gras et l’assemblage de triacylglycérols. Le cœur du déterminisme de la composition en acides gras semble se situer au niveau de l’échange d’acides gras polyinsaturés (C18:2) entre le pool des phospholipides et la voie de Kennedy, effectué par les enzymes phospholipide:diacylglycérol acyltransférase et phosphatidylcholine diacylglycérol cholinephosphotransférase. Nos résultats suggèrent que la production d’une huile riche en linoléique dans l’albumen est principalement gouvernée par la surexpression des gènes codants pour ces deux enzymes. Nous supposons aussi qu’il pourrait exister une relation quantitative entre le niveau de transcription du gène codant pour le facteur de transcription AsWRI1 et la quantité d’huile accumulée. ________________________________________

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4630	02-34-79	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

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Extraction, caractérisation morphologique, physico-chimique et mécanique des fibres caulinaires de Retama monosperma L.Boiss / Djamel Eddine AIZI 

Public ISBD Titre : Extraction, caractérisation morphologique, physico-chimique et mécanique des fibres caulinaires de Retama monosperma L.Boiss Type de document : document électronique Auteurs : Djamel Eddine AIZI, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse Année de publication : 2016 Importance : 125 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie végétale Mots-clés : Retama monosperma, fibres, extraction, caractérisation, valorisation Retama monosperma, fibers, extraction, characterization, valuation. .R.monosperma الألياف, الاستخلاص, تحديد الخصائص, تثمين. Résumé : R. monosperma, Arbuste vivace, de la famille des légumineuses, originaire de l’Afrique du nord, très abondante dans le littoral Algérien. R. monosperma joue un rôle très important dans la bio-fertilisation et la stabilisation des dunes mobiles. Dans cette étude nous nous sommes intéressés aux fibres de R. monosperma. Pour cela, en premier lieu (i), il y eu l’établissement d’un procédé d’extraction des fibres longues à partir des tiges. Une fois les fibres ont été obtenues et l’extraction à réussi, (ii) une étape de caractérisation succède par l’utilisation de différentes techniques : DRX, IRTF, L’angle de contacte, TGA, MEB et le test de traction. Après la caractérisation, (iii) l’amélioration des propriétés des fibres a eu lieu en utilisant des traitements chimiques, physique et biologique. (iv) En dernier, les fibres ont été utilisées comme renfort dans des briques de plâtre. Les résultats obtenus nous ont permis de confirmer la faisabilité de l’extraction des fibres longues dont la caractérisation a révélé une résistance à la traction de 110 MPa, une élasticité de 4.7 %, une densité de 1.3 g/cm3, une composition polysaccharidique de la paroi dominée par une forte présence de cellulose avec un taux de 86% et un indice de cristallinité de 82.5%. Les différents traitements ont permis surtout d’améliorer l’indice de cristallinité de la cellulose fibrillaire, d’amélioré la stabilité thermique et la résistance mécanique. Toutes ces caractéristiques nous renseignent sur la qualité des fibres obtenues, l’amélioration de ces propriétés a été réalisée avec succès par le biais des traitements de la surface des fibres. L’utilisation des fibres de Retama monosperma dans le renforcement des briques de plâtre s’avère possible. R. monosperma, perennial shrub of the legume family, native to North Africa, is very abundant in Algeria. R. monosperma play a central role for dune stabilization and bio-fertilizer of mobiles dunes. In this study we focused on R. monosperma long fibers. For this, first, (i) there was the establishment of an extracting procedure of long fibers from the stems. After the fibers have been obtained and extraction succeeded, (ii) a characterization step succeeds by using different techniques: XRD, FTIR, contact angle, TGA, SEM and the tensile test. After characterization, (iii) improved fiber properties succeed using chemical, physical and biological treatments. (Iv) Finally, the fibers were valued as reinforcement in plaster bricks. The results allowed us to confirm the feasibility of extracting long fibers which characterization showed a tensile strength of 110 Mpa, an elasticity of 4.7%, a density of 1.3 g / cm3, a polysaccharide composition of the wall dominated by a strong presence of cellulose with a rate of 86% and a crystallinity index of 82.5%. The various treatments have largely improve the crystallinity index of cellulose fibril, improve the thermal stability and mechanical strength. All these characteristics give us information about the quality of the fibers obtained; improving these properties has been successfully achieved through the fiber surface treatment. Also, the results show that the use of Retama monosperma fibers in building plaster bricks proves possible. R.monosperma شجيرة من عائلة البقوليات, موطنها لأصلي شمال إفريقيا وهي موجدة بكثرة في الجزائر. رغم وفرتها والمساحة الشاسعة التي تحتلها فهي لم تثمن بعد في آيي مجال من مجلات البيوتكنولوجيا في الجزائر. في هده الأطروحة تطرقنا إلي دراسة الألياف الطويلة ل :R. monosperma (i) في الأول قمنا بتحديد الطريقة المثالية لاستخلاص الألياف انطلاقا من السيقان, (ii) بعدما تمت عملية الاستخلاص بنجاح باستعمال الصودا ( (NaOHبتركيز 14% لمدة 8 ساعات, قمنا بدراسة الخصائص الفيزيائية, الميكانيكية و البيوكيميائية لتلك الألياف باستعمال الأشعة السينية , (DRX) الشد الميكانيكي, المقاومة للحرارة (TGA) , المجهر الالكتروني, الأشعة مافوق الحمراء(IRTF) , الانعكاس الضوئي و كدالك التكوين البيوكميائي للألياف. النتائج المتحصل عليها أثبتت إمكانية استخلاص الألياف, و التي تتمثل أهم مميزاتها في : قوة شد بقدرة 110 مقا باسكال, كثافة 1.3 غ/سم3 , و تكوين بيوكميائي تطغوا عليه السيليلوز بنسبة 86%, وهي ذات مؤشر تبلور يقدر ب 82.5 .% (iii) كل هده الخصائص تم تحسينها عن طريق المعالجة الفيزيائية, الكيمائية و البيولوجية للألياف.(iv) كما تم استعمال هده الألياف في تحسين الخصائص الميكانيكية للجص. Extraction, caractérisation morphologique, physico-chimique et mécanique des fibres caulinaires de Retama monosperma L.Boiss [document électronique] / Djamel Eddine AIZI, Auteur ; KAID-HARCHE Meriem, Directeur de thèse . - 2016 . - 125 p. + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie végétale Mots-clés : Retama monosperma, fibres, extraction, caractérisation, valorisation Retama monosperma, fibers, extraction, characterization, valuation. .R.monosperma الألياف, الاستخلاص, تحديد الخصائص, تثمين. Résumé : R. monosperma, Arbuste vivace, de la famille des légumineuses, originaire de l’Afrique du nord, très abondante dans le littoral Algérien. R. monosperma joue un rôle très important dans la bio-fertilisation et la stabilisation des dunes mobiles. Dans cette étude nous nous sommes intéressés aux fibres de R. monosperma. Pour cela, en premier lieu (i), il y eu l’établissement d’un procédé d’extraction des fibres longues à partir des tiges. Une fois les fibres ont été obtenues et l’extraction à réussi, (ii) une étape de caractérisation succède par l’utilisation de différentes techniques : DRX, IRTF, L’angle de contacte, TGA, MEB et le test de traction. Après la caractérisation, (iii) l’amélioration des propriétés des fibres a eu lieu en utilisant des traitements chimiques, physique et biologique. (iv) En dernier, les fibres ont été utilisées comme renfort dans des briques de plâtre. Les résultats obtenus nous ont permis de confirmer la faisabilité de l’extraction des fibres longues dont la caractérisation a révélé une résistance à la traction de 110 MPa, une élasticité de 4.7 %, une densité de 1.3 g/cm3, une composition polysaccharidique de la paroi dominée par une forte présence de cellulose avec un taux de 86% et un indice de cristallinité de 82.5%. Les différents traitements ont permis surtout d’améliorer l’indice de cristallinité de la cellulose fibrillaire, d’amélioré la stabilité thermique et la résistance mécanique. Toutes ces caractéristiques nous renseignent sur la qualité des fibres obtenues, l’amélioration de ces propriétés a été réalisée avec succès par le biais des traitements de la surface des fibres. L’utilisation des fibres de Retama monosperma dans le renforcement des briques de plâtre s’avère possible. R. monosperma, perennial shrub of the legume family, native to North Africa, is very abundant in Algeria. R. monosperma play a central role for dune stabilization and bio-fertilizer of mobiles dunes. In this study we focused on R. monosperma long fibers. For this, first, (i) there was the establishment of an extracting procedure of long fibers from the stems. After the fibers have been obtained and extraction succeeded, (ii) a characterization step succeeds by using different techniques: XRD, FTIR, contact angle, TGA, SEM and the tensile test. After characterization, (iii) improved fiber properties succeed using chemical, physical and biological treatments. (Iv) Finally, the fibers were valued as reinforcement in plaster bricks. The results allowed us to confirm the feasibility of extracting long fibers which characterization showed a tensile strength of 110 Mpa, an elasticity of 4.7%, a density of 1.3 g / cm3, a polysaccharide composition of the wall dominated by a strong presence of cellulose with a rate of 86% and a crystallinity index of 82.5%. The various treatments have largely improve the crystallinity index of cellulose fibril, improve the thermal stability and mechanical strength. All these characteristics give us information about the quality of the fibers obtained; improving these properties has been successfully achieved through the fiber surface treatment. Also, the results show that the use of Retama monosperma fibers in building plaster bricks proves possible. R.monosperma شجيرة من عائلة البقوليات, موطنها لأصلي شمال إفريقيا وهي موجدة بكثرة في الجزائر. رغم وفرتها والمساحة الشاسعة التي تحتلها فهي لم تثمن بعد في آيي مجال من مجلات البيوتكنولوجيا في الجزائر. في هده الأطروحة تطرقنا إلي دراسة الألياف الطويلة ل :R. monosperma (i) في الأول قمنا بتحديد الطريقة المثالية لاستخلاص الألياف انطلاقا من السيقان, (ii) بعدما تمت عملية الاستخلاص بنجاح باستعمال الصودا ( (NaOHبتركيز 14% لمدة 8 ساعات, قمنا بدراسة الخصائص الفيزيائية, الميكانيكية و البيوكيميائية لتلك الألياف باستعمال الأشعة السينية , (DRX) الشد الميكانيكي, المقاومة للحرارة (TGA) , المجهر الالكتروني, الأشعة مافوق الحمراء(IRTF) , الانعكاس الضوئي و كدالك التكوين البيوكميائي للألياف. النتائج المتحصل عليها أثبتت إمكانية استخلاص الألياف, و التي تتمثل أهم مميزاتها في : قوة شد بقدرة 110 مقا باسكال, كثافة 1.3 غ/سم3 , و تكوين بيوكميائي تطغوا عليه السيليلوز بنسبة 86%, وهي ذات مؤشر تبلور يقدر ب 82.5 .% (iii) كل هده الخصائص تم تحسينها عن طريق المعالجة الفيزيائية, الكيمائية و البيولوجية للألياف.(iv) كما تم استعمال هده الألياف في تحسين الخصائص الميكانيكية للجص.

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1201	02-34-91	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

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