Titre :	Etude éco-bactériologique et enzymatique de quelques zones humides classées en convention internationale de Ramsar de la région biogéographique d’Oran (Lac Télamine et Lagune du Macta) et de Bechar (Barrage de Djorf torba)
Type de document :	texte imprimé
Auteurs :	ZIRI Mohammed Abderrahmane, Auteur
Année de publication :	2015
Format :	A4
Accompagnement :	CD
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biotechnologie :Productions végétales et microbiennes
Mots-clés :	Zones humides,bactéries aquatiques, Activité enzymatique, Resistance aux antibiotiques, Plasmides bactériens wetlands, aquatic Bacteria, enzyme activity, againstbiotic resistance, Bacterial plasmid
Résumé :	Ce travail préliminaire qui a fait l’objet d’une étude « éco-bactériologique et enzymatique de quelques zones humides classées en convention internationale de Ramsar de la région biogéographique d’Oran (Lac Télamine et Lagune du Macta) et de Bechar (Barrage de Djorf torba) » nous a permis d’isoler et de cribler environ 35 souches bactériennes appartenant aux différentes familles celles d’entre eux doté d’une activité enzymatique polysaccharolytique « Amylolytique, Cellulolytique, Pectinolytique » assez distinctives. Les mesures des paramètres physico-chimique comme la T°, pH, CE, MES ont été élaboré durant toute l’année de l’étude répartis en quatre prélèvements réguliers et cela pour un suivi permanent des changements ainsi pour l’évaluation théorique de la prolifération bactérienne et l’activité enzymatique polysaccharolytique,ces paramètres ont montrés des T° saisoniales,une neutralité qui tends défois vers l’acidité,une salinité remarquable surtout à Télamine et des quantités considérables de MES par la suite on a pu faire une énumération des coliformes totaux, fécaux ,streptocoques fécaux et les germes totaux pour l’estimation du degré de pollution bactériologique affectant ces milieux,la zone de Télamine a été fortement contaminé alors que les autres viennent dans l’ordre décroissant. La caractérisation bactériologique ainsi la confirmation de la pureté des souche isolées ont été contrôlé en se basant sur leur caractères morphologiques (aspect coloniale) ainsi que les examens microscopiques classiques « examen à l’état frais » et « coloration de gram »en suite ils ont été identifiées par des tests biochimiques « test oxydase et test catalase » sans négliger l’aspect colonial sur milieu sélectif avec un test supplémentaire pour atteindre le stade espèce de certain souche qui a été réalisé par les galerie biochimique system Api 20 E. En outre l’activité enzymatique de ces souches aquatique issues de ces zones humides a été recherché envers les trois polysaccharides « Amidon, Cellulose, Pectine »sur les milieux améliorés à base de ces derniers l’activité enzymatique totale de chaque zone humide envers un polysaccharide par fermentation sur milieu liquide a été estimé ,l’activité pectinolytique etAmylolytique ont été assez abondante chez la pluparts de ces souches, tandis que l’activité cellulolytique a été modérément remarquée les Bacillaceae et Pseudomonaceae ont montré une activité polysaccharolytique envers les 3 substrat par contre la famille des Enterobactereaceae a prouvée l’absence totale de cette activité. Le choix des ATB pour l’antibiogramme a été fait en fonction des 3 familles bactériennes Enterobactereaceae, Bacillaceae et Pseudomonaceae selon les recommandations de Louis : Pour les souches des Enterobactereaceae ont montré une résistance envers les ATB de la famille des B-Lactamine certains d’entre eux pour autres, par contre les souches des Bacillaceae ont montré une résistance commune envers les ATB (P, OX) et les souches des Pseudomonaceae ont montré une résistance commune envers les ATB (AMX, AM). Pour une étude bien approfondie et comparative l’ADN plasmidique des souches de la famille des Bacillaceae et Pseudomonaceae qui se sont montrés plus actives et celles non actives des Enterobactereaceae a été extrait par les techniques classiques de l’extraction des plasmides « Méthode de mini-préparation » puis mis en évidence par le processus électro phorétique, les résultats ont été satisfaisants car toutes les souches appartenant à ces trois familles ont montré un contenu plasmidique assez important sauf pour la souche T8. This preliminary work which has been subject of a study "eco- bacteriological and enzymatic of some wetlands classified in convention international of Ramsar of biogeographical region of Oran (Télamine Lake and the Macta Lagoon) and Bechar (Djorf torba Dame) has allowed us to isolate and screen about 35 bacterial strains belonging to different families, those of them with a activities polysaccharolytic " amylolytic, celluolytic, pectinolytic "quite distinctive. The measurements of physic- chemical parameters such as T°, pH, EC, MES were made throughout the year of the study divided into four regular sampling and that for a continuous monitoring of changes and for the theoretical evaluation of the bacterial growth and activity polysaccharolytic, later we could make a counting of total coliforms, fecal, fecal streptococci and total bacteria to estimate the degree of bacterial pollution in these areas. Bacteriological characterization and confirmation of the purity of the isolated strain were controlled based on their morphological (colonial appearance) together with conventional microscopic examination " fresh examination " and " Gram stain " then have identified by biochemical tests "oxidize and catalase test " without neglecting the cultural aspect of selective medium with an additional test case to reach the level species of some strain has been realized by a biochemical gallery system Api 20 E. We have also investigated the activity enzymatic of these aquatic strains from these wetlands towards three polysaccharides " Starch, Cellulose and Pectin " above the improved medium a on based of these ,we estimated the total enzymatic activity of each wetland towards a polysaccharide by fermentation liquid medium , amylolytic and pectinolytic activity were quite abundant in the most of these strains , while the celluolytic activity was moderately noticed in the Bacillaceae and Pseudomonaceae showed activity towards tree substrates while the family Enterobactereaceae has proven the total absence of this activity. The choice of againstbiotic was done according to the three bacterial families Enterobactereaceae, Bacillaceae and Pseudomonaceae as recommended by Louis: For Enterobactereaceae strains showed resistance to the ATB family of B -lactam some of them to others, against Bacillaceae strains showed a common resistance to the ATB (P, OX) and Pseudomonaceae strains showed a common resistance to the ATB ( AMX , AM). For a very thorough and comparative study of plasmid DNA, strains of the family Bacillaceae and Pseudomonaceae who were more active and those inactive for Enterobactereaceae was extracted by conventional techniques of extraction of the plasmids' mini-preparation method " and highlighted by the electro phoretic process, the results were satisfactory for all strains belonging to these three families showed a relatively large plasmid content except for T8 strain.
Directeur de thèse :	Cheba Ben amar

Etude éco-bactériologique et enzymatique de quelques zones humides classées en convention internationale de Ramsar de la région biogéographique d’Oran (Lac Télamine et Lagune du Macta) et de Bechar (Barrage de Djorf torba) [texte imprimé] / ZIRI Mohammed Abderrahmane, Auteur . - 2015 . -  ; A4 + CD.
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biotechnologie :Productions végétales et microbiennes
Mots-clés :	Zones humides,bactéries aquatiques, Activité enzymatique, Resistance aux antibiotiques, Plasmides bactériens wetlands, aquatic Bacteria, enzyme activity, againstbiotic resistance, Bacterial plasmid
Résumé :	Ce travail préliminaire qui a fait l’objet d’une étude « éco-bactériologique et enzymatique de quelques zones humides classées en convention internationale de Ramsar de la région biogéographique d’Oran (Lac Télamine et Lagune du Macta) et de Bechar (Barrage de Djorf torba) » nous a permis d’isoler et de cribler environ 35 souches bactériennes appartenant aux différentes familles celles d’entre eux doté d’une activité enzymatique polysaccharolytique « Amylolytique, Cellulolytique, Pectinolytique » assez distinctives. Les mesures des paramètres physico-chimique comme la T°, pH, CE, MES ont été élaboré durant toute l’année de l’étude répartis en quatre prélèvements réguliers et cela pour un suivi permanent des changements ainsi pour l’évaluation théorique de la prolifération bactérienne et l’activité enzymatique polysaccharolytique,ces paramètres ont montrés des T° saisoniales,une neutralité qui tends défois vers l’acidité,une salinité remarquable surtout à Télamine et des quantités considérables de MES par la suite on a pu faire une énumération des coliformes totaux, fécaux ,streptocoques fécaux et les germes totaux pour l’estimation du degré de pollution bactériologique affectant ces milieux,la zone de Télamine a été fortement contaminé alors que les autres viennent dans l’ordre décroissant. La caractérisation bactériologique ainsi la confirmation de la pureté des souche isolées ont été contrôlé en se basant sur leur caractères morphologiques (aspect coloniale) ainsi que les examens microscopiques classiques « examen à l’état frais » et « coloration de gram »en suite ils ont été identifiées par des tests biochimiques « test oxydase et test catalase » sans négliger l’aspect colonial sur milieu sélectif avec un test supplémentaire pour atteindre le stade espèce de certain souche qui a été réalisé par les galerie biochimique system Api 20 E. En outre l’activité enzymatique de ces souches aquatique issues de ces zones humides a été recherché envers les trois polysaccharides « Amidon, Cellulose, Pectine »sur les milieux améliorés à base de ces derniers l’activité enzymatique totale de chaque zone humide envers un polysaccharide par fermentation sur milieu liquide a été estimé ,l’activité pectinolytique etAmylolytique ont été assez abondante chez la pluparts de ces souches, tandis que l’activité cellulolytique a été modérément remarquée les Bacillaceae et Pseudomonaceae ont montré une activité polysaccharolytique envers les 3 substrat par contre la famille des Enterobactereaceae a prouvée l’absence totale de cette activité. Le choix des ATB pour l’antibiogramme a été fait en fonction des 3 familles bactériennes Enterobactereaceae, Bacillaceae et Pseudomonaceae selon les recommandations de Louis : Pour les souches des Enterobactereaceae ont montré une résistance envers les ATB de la famille des B-Lactamine certains d’entre eux pour autres, par contre les souches des Bacillaceae ont montré une résistance commune envers les ATB (P, OX) et les souches des Pseudomonaceae ont montré une résistance commune envers les ATB (AMX, AM). Pour une étude bien approfondie et comparative l’ADN plasmidique des souches de la famille des Bacillaceae et Pseudomonaceae qui se sont montrés plus actives et celles non actives des Enterobactereaceae a été extrait par les techniques classiques de l’extraction des plasmides « Méthode de mini-préparation » puis mis en évidence par le processus électro phorétique, les résultats ont été satisfaisants car toutes les souches appartenant à ces trois familles ont montré un contenu plasmidique assez important sauf pour la souche T8. This preliminary work which has been subject of a study "eco- bacteriological and enzymatic of some wetlands classified in convention international of Ramsar of biogeographical region of Oran (Télamine Lake and the Macta Lagoon) and Bechar (Djorf torba Dame) has allowed us to isolate and screen about 35 bacterial strains belonging to different families, those of them with a activities polysaccharolytic " amylolytic, celluolytic, pectinolytic "quite distinctive. The measurements of physic- chemical parameters such as T°, pH, EC, MES were made throughout the year of the study divided into four regular sampling and that for a continuous monitoring of changes and for the theoretical evaluation of the bacterial growth and activity polysaccharolytic, later we could make a counting of total coliforms, fecal, fecal streptococci and total bacteria to estimate the degree of bacterial pollution in these areas. Bacteriological characterization and confirmation of the purity of the isolated strain were controlled based on their morphological (colonial appearance) together with conventional microscopic examination " fresh examination " and " Gram stain " then have identified by biochemical tests "oxidize and catalase test " without neglecting the cultural aspect of selective medium with an additional test case to reach the level species of some strain has been realized by a biochemical gallery system Api 20 E. We have also investigated the activity enzymatic of these aquatic strains from these wetlands towards three polysaccharides " Starch, Cellulose and Pectin " above the improved medium a on based of these ,we estimated the total enzymatic activity of each wetland towards a polysaccharide by fermentation liquid medium , amylolytic and pectinolytic activity were quite abundant in the most of these strains , while the celluolytic activity was moderately noticed in the Bacillaceae and Pseudomonaceae showed activity towards tree substrates while the family Enterobactereaceae has proven the total absence of this activity. The choice of againstbiotic was done according to the three bacterial families Enterobactereaceae, Bacillaceae and Pseudomonaceae as recommended by Louis: For Enterobactereaceae strains showed resistance to the ATB family of B -lactam some of them to others, against Bacillaceae strains showed a common resistance to the ATB (P, OX) and Pseudomonaceae strains showed a common resistance to the ATB ( AMX , AM). For a very thorough and comparative study of plasmid DNA, strains of the family Bacillaceae and Pseudomonaceae who were more active and those inactive for Enterobactereaceae was extracted by conventional techniques of extraction of the plasmids' mini-preparation method " and highlighted by the electro phoretic process, the results were satisfactory for all strains belonging to these three families showed a relatively large plasmid content except for T8 strain.
Directeur de thèse :	Cheba Ben amar