Titre : | Typologie et caractérisation des populations de poules locales dans le Sud-Ouest algérien | Type de document : | document électronique | Auteurs : | BOUDALI Selma Farah, Auteur | Année de publication : | 2020-2021 | Accompagnement : | CD | Langues : | Français (fre) | Catégories : | Biologie Génétique Moléculaire
| Mots-clés : | ADN mitochondrial, caractérisation phénotypique, caractérisation moléculaire, diversité génétique, extraction d’ADN, poules locales. | Résumé : | Le but de ce travail est de contribuer à la caractérisation phénotypique et moléculaire des populations de poules locales algériennes ainsi que de clarifier leur origine maternelle et leurs voies de dispersion.
D’après nos enquêtes sur le terrain réalisées dans trois wilayas du Sud-Ouest algérien, les femmes sont en majeur partie responsables des élevages de poulets en milieu rural (56 %) et elles sont presque toutes illettrées. Ces femmes utilisent le maigre revenu des ventes d’œufs et d’oiseaux pour subvenir aux besoins de leurs familles. Une grande diversité phénotypique a été observée chez les 83 poules locales échantillonnées. Les mensurations corporelles étudiées confirment le dimorphisme sexuel en faveur des mâles. La valeur moyenne du poids corporel est significativement plus élevée chez les coqs (1462 g) que chez les poules (1159 g).
Par la suite, une étude d’optimisation du protocole d’extraction de l’ADN génomique par la technique de NaCl (Salting out) à partir du sang de volailles a été réalisée dans le but d’une amélioration de la qualité et la quantité de l’ADN extrait. Le nouveau protocole proposé permet d’avoir une plus grande quantité d’ADN avec une meilleure pureté et ceci à partir d’un plus petit volume de sang et est applicable pour les différentes espèces de volailles.
Afin d’approfondir les connaissances sur la diversité génétique du poulet domestique algérien, une étude moléculaire a été réalisée sur 88 poulets locaux appartenant à 5 wilayas de l’Ouest de l’Algérie qui représentent 5 zones agro-écologiques : Littoral (LT), plaines intérieures (PI), hauts plateaux (HP), montagnes (MT) et le Sahara (SH, y compris les régions des Oasis, Req et Erg). L’analyse de la région hypervariable (HV1) de l’ADN mitochondrial a été réalisée afin d’étudier l’origine maternelle de ces oiseaux. Au total, 20 sites variables définissant 13 haplotypes ont été identifiés chez la poule locale d’Algérie. La diversité des haplotypes et des nucléotides a été estimée à 0,597 et 0,003 respectivement. Les résultats d’analyses phylogénétiques indiquent la présence de deux clades (A et E) et suggèrent que les poulets algériens dérivent de l'haplogroupe le plus répandu qui a sa racine dans le sous-continent Indien. Nos résultats fournissent des informations importantes sur l'origine du poulet du Nord-Ouest de l’Afrique et la dispersion historique des premières populations de poules sur le continent Africain. Ces résultats nous permettent d’établir un programme de gestion et d’amélioration des ressources génétiques efficace pour les poules locales algériennes et de ce fait de meilleure application économique.
| Directeur de thèse : | GAOUAR Samir Bachir Souheil |
Typologie et caractérisation des populations de poules locales dans le Sud-Ouest algérien [document électronique] / BOUDALI Selma Farah, Auteur . - 2020-2021 . - + CD. Langues : Français ( fre) Catégories : | Biologie Génétique Moléculaire
| Mots-clés : | ADN mitochondrial, caractérisation phénotypique, caractérisation moléculaire, diversité génétique, extraction d’ADN, poules locales. | Résumé : | Le but de ce travail est de contribuer à la caractérisation phénotypique et moléculaire des populations de poules locales algériennes ainsi que de clarifier leur origine maternelle et leurs voies de dispersion.
D’après nos enquêtes sur le terrain réalisées dans trois wilayas du Sud-Ouest algérien, les femmes sont en majeur partie responsables des élevages de poulets en milieu rural (56 %) et elles sont presque toutes illettrées. Ces femmes utilisent le maigre revenu des ventes d’œufs et d’oiseaux pour subvenir aux besoins de leurs familles. Une grande diversité phénotypique a été observée chez les 83 poules locales échantillonnées. Les mensurations corporelles étudiées confirment le dimorphisme sexuel en faveur des mâles. La valeur moyenne du poids corporel est significativement plus élevée chez les coqs (1462 g) que chez les poules (1159 g).
Par la suite, une étude d’optimisation du protocole d’extraction de l’ADN génomique par la technique de NaCl (Salting out) à partir du sang de volailles a été réalisée dans le but d’une amélioration de la qualité et la quantité de l’ADN extrait. Le nouveau protocole proposé permet d’avoir une plus grande quantité d’ADN avec une meilleure pureté et ceci à partir d’un plus petit volume de sang et est applicable pour les différentes espèces de volailles.
Afin d’approfondir les connaissances sur la diversité génétique du poulet domestique algérien, une étude moléculaire a été réalisée sur 88 poulets locaux appartenant à 5 wilayas de l’Ouest de l’Algérie qui représentent 5 zones agro-écologiques : Littoral (LT), plaines intérieures (PI), hauts plateaux (HP), montagnes (MT) et le Sahara (SH, y compris les régions des Oasis, Req et Erg). L’analyse de la région hypervariable (HV1) de l’ADN mitochondrial a été réalisée afin d’étudier l’origine maternelle de ces oiseaux. Au total, 20 sites variables définissant 13 haplotypes ont été identifiés chez la poule locale d’Algérie. La diversité des haplotypes et des nucléotides a été estimée à 0,597 et 0,003 respectivement. Les résultats d’analyses phylogénétiques indiquent la présence de deux clades (A et E) et suggèrent que les poulets algériens dérivent de l'haplogroupe le plus répandu qui a sa racine dans le sous-continent Indien. Nos résultats fournissent des informations importantes sur l'origine du poulet du Nord-Ouest de l’Afrique et la dispersion historique des premières populations de poules sur le continent Africain. Ces résultats nous permettent d’établir un programme de gestion et d’amélioration des ressources génétiques efficace pour les poules locales algériennes et de ce fait de meilleure application économique.
| Directeur de thèse : | GAOUAR Samir Bachir Souheil |
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