Titre :	Etude de l’implication des polymorphismes des gènes de réparation de l’ADN dans la survenue du cancer colorectal dans la population de l’Ouest Algérien
Type de document :	document électronique
Auteurs :	Fatima Zohra MOGHTIT, Auteur
Année de publication :	2014
Importance :	134 p.
Accompagnement :	CD
Langues :	Français (fre)
Catégories :	Biotechnologie :biologie moléculaire
Mots-clés :	CCR- XRCC1- XRCC3- ERCC1- ERCC2- polymorphisme- association- Ouest Algérien. CRC- XRCC1- XRCC3- ERCC1- ERCC2- polymorphism- association- West Algerian. سرطان القولون-ERCC2- ERCC1- XRCC3- XRCC1 - تعدد أشكال النيوكليوتيدة-العالقة- الغرب الجزائري
Résumé :	En Algérie, le cancer colorectal (CCR) représente un réel problème de santé publique. Celui-ci combine l’implication de facteurs génétiques et environnementaux. De nombreux gènes sont associés au risque de survenue de cette pathologie dont certains codent pour des protéines intervenant dans les mécanismes de réparation de l’ADN. Afin de rechercher une éventuelle association entre les polymorphismes des gènes de réparation et la survenue du CCR sporadique dans la population de l’Ouest Algérien, nous avons développé une étude d’association cas/témoins portant sur les variants génétiques suivants : le SNP c.1196G>A du gène XRCC1 (p.Arg399Gln, rs25487), le SNP c.722C>T du gène XRCC3 (p.Thr241Met, rs861539), le SNP c.354C>T du gène ERCC1 (p.Asn118=, rs11615) et le SNP c.2251A>C du gène ERCC2 (p.Lys751Gln, rs13181). Cette étude préliminaire est la première du genre sur une population algérienne. Cette étude de type cas/témoins a concerné 129 sujets atteints de CCR et 148 sujets normaux non apparentés. Le génotypage des différents polymorphismes a été réalisé par pyroséquençage. La comparaison des fréquences alléliques, génotypiques et haplotypiques entre les deux groupes a été établie par le calcul de l’odds ratio avec un intervalle de confiance à 95%. L’analyse statistique a montré qu’il n’existait aucune différence significative de distribution des fréquences alléliques et génotypiques des polymorphismes explorés entre les cas et les contrôles (p>0,05). Par ailleurs, nous avons noté une association significative entre le génotype combiné XRCC3 (CT) et ERCC2 (CC) avec le risque du CCR (OR = 7,33, p = 0,02). En conclusion, il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes de réparation de l’ADN afin de caractériser d’une manière plus précise le déterminisme génétique du CCR dans notre population. De plus, des études ultérieures sur l’implication des facteurs environnementaux au sein d’une population à effectif plus large seront nécessaires afin de proposer les stratégies de prévention du CCR les mieux adaptées à notre population. In Algeria, colorectal cancer (CRC) constitutes a real problem of public health. Both genetic and environmental factors are involved in the etiology of CRC. Several genes have been associated with increased risk of CRC; such as those encoding DNA repair proteins. To search for a possible association between DNA repair genes polymorphisms and the occurrence of sporadic CRC in the West Algerian population, a case/control study was conducted exploring the following genetic variants: SNP c.1196G> A of the XRCC1 gene (p.Arg399Gln, rs25487) SNP c.722C>T gene XRCC3 (p.Thr241Met, rs861539) SNP c.354C>T of the ERCC1 gene (p.Asn118=, rs11615) and SNP c.2251A> C ERCC2 gene (p.Lys751Gln, rs13181). This preliminary study is the first of its kind conducted on an Algerian population. A total of 129 patients with CRC and 148 unrelated normal subjects were enrolled in our case/control study. The genotyping was performed by pyrosequencing method. The allele, genotype and haplotype distributions were compared between cases and controls by the calculation of the odds ratio with a confidence interval of 95%. Statistical analysis showed that there were no significant differences in the distribution of allele and genotype frequencies between cases and controls (p> 0.05). Furthermore, a significant association was found between the combined heterozygous of XRCC3 and homozygous variant of ERCC2 gene and CRC (OR = 7.33, p = 0.02). In conclusion, it would be very interesting to explore other polymorphisms of DNA repair genes in order to fully characterize the genetic determinism of the CRC in our population. In addition, further studies examining the role of environmental factors on a larger sample size will be needed to propose the best preventive strategies for CRC in our population. مرض سرطان القولون مشكلة صحية عمومية واسعة االنتشار في الجزائر ويحدث بسبب تآلف عدد من العوامل الجينية والبيئية. العديد من الجينات ارتبطت بخطر االصابة بالسرطان من بينها تلك التي ترمز لبروتينات مشاركة في اصالح الحمض النووي. لتقييم العالقة بين تعدد أشكال النيوكليوتيدة لجينات اصالح الحمض النووي و سرطان القولون في المجتمع الجزائري أجرينا في هذا البحث دراسة حالة/شاهد على سكان غرب الجزائر و قد تم دراسة تعدد أشكال النيوكليوتيدة التالية: (p.Arg399Gln, rs25487) XRCC1 لجين c.1196G>A (p.Thr241Met, rs861539( XRCC3 لجين c.722C>T (p.Asn118=, rs11615) ERCC1 لجين c.354C>T (p.Lys751Gln, rs13181) ERCC2 لجين c.2251A>C لعلمنا أن هذه الدراسة هي األولى من نوعها على الجزائريين. شملت هذه الدراسة 921 مريض مصابين بسرطان القولون و 941 شخص عادي. تم تحديد النمط الجيني باستخدام تقنية pyrosequencing .تم تحديد مقارنة الترددات األليلية، األنماط الجينية واألنماط الفردانية بين المجموعتين عن طريق حساب نسبة األرجحية (OR (مع مجال الثقة 19.٪ أظهر التحليل اإلحصائي أنه ال يوجد فرق في توزيع ترددات األليالت و األنماط الجينية بين الحاالت و العاديين )05.0> p .)من ناحية أخرى، وجدنا عالقة وثيقة بين النمط الجيني المتشكل من )CT (XRCC3 و )CC (ERCC2 و .)p = 0.02 ،OR = 7.33( القولون سرطان خطر في الختام، سيكون من المثير لالهتمام استكشاف تعدد أشكال النيوكليوتيدة األخرى لجينات اصالح الحمض النووي من أجل توصيف وراثي أكثر دقة لسرطان القولون في مجتمعنا. باإلضافة إلى ذلك، هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات مع إشراك العوامل البيئية على عدد أكبر من السكان التخاذ التدابير الالزمة واألنسب لسكاننا للوقاية من هذا المرض.
Directeur de thèse :	ABERKANE , Meriem Samia

Etude de l’implication des polymorphismes des gènes de réparation de l’ADN dans la survenue du cancer colorectal dans la population de l’Ouest Algérien [document électronique] / Fatima Zohra MOGHTIT, Auteur . - 2014 . - 134 p. + CD.
Langues : Français (fre)

Catégories :	Biotechnologie :biologie moléculaire
Mots-clés :	CCR- XRCC1- XRCC3- ERCC1- ERCC2- polymorphisme- association- Ouest Algérien. CRC- XRCC1- XRCC3- ERCC1- ERCC2- polymorphism- association- West Algerian. سرطان القولون-ERCC2- ERCC1- XRCC3- XRCC1 - تعدد أشكال النيوكليوتيدة-العالقة- الغرب الجزائري
Résumé :	En Algérie, le cancer colorectal (CCR) représente un réel problème de santé publique. Celui-ci combine l’implication de facteurs génétiques et environnementaux. De nombreux gènes sont associés au risque de survenue de cette pathologie dont certains codent pour des protéines intervenant dans les mécanismes de réparation de l’ADN. Afin de rechercher une éventuelle association entre les polymorphismes des gènes de réparation et la survenue du CCR sporadique dans la population de l’Ouest Algérien, nous avons développé une étude d’association cas/témoins portant sur les variants génétiques suivants : le SNP c.1196G>A du gène XRCC1 (p.Arg399Gln, rs25487), le SNP c.722C>T du gène XRCC3 (p.Thr241Met, rs861539), le SNP c.354C>T du gène ERCC1 (p.Asn118=, rs11615) et le SNP c.2251A>C du gène ERCC2 (p.Lys751Gln, rs13181). Cette étude préliminaire est la première du genre sur une population algérienne. Cette étude de type cas/témoins a concerné 129 sujets atteints de CCR et 148 sujets normaux non apparentés. Le génotypage des différents polymorphismes a été réalisé par pyroséquençage. La comparaison des fréquences alléliques, génotypiques et haplotypiques entre les deux groupes a été établie par le calcul de l’odds ratio avec un intervalle de confiance à 95%. L’analyse statistique a montré qu’il n’existait aucune différence significative de distribution des fréquences alléliques et génotypiques des polymorphismes explorés entre les cas et les contrôles (p>0,05). Par ailleurs, nous avons noté une association significative entre le génotype combiné XRCC3 (CT) et ERCC2 (CC) avec le risque du CCR (OR = 7,33, p = 0,02). En conclusion, il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes de réparation de l’ADN afin de caractériser d’une manière plus précise le déterminisme génétique du CCR dans notre population. De plus, des études ultérieures sur l’implication des facteurs environnementaux au sein d’une population à effectif plus large seront nécessaires afin de proposer les stratégies de prévention du CCR les mieux adaptées à notre population. In Algeria, colorectal cancer (CRC) constitutes a real problem of public health. Both genetic and environmental factors are involved in the etiology of CRC. Several genes have been associated with increased risk of CRC; such as those encoding DNA repair proteins. To search for a possible association between DNA repair genes polymorphisms and the occurrence of sporadic CRC in the West Algerian population, a case/control study was conducted exploring the following genetic variants: SNP c.1196G> A of the XRCC1 gene (p.Arg399Gln, rs25487) SNP c.722C>T gene XRCC3 (p.Thr241Met, rs861539) SNP c.354C>T of the ERCC1 gene (p.Asn118=, rs11615) and SNP c.2251A> C ERCC2 gene (p.Lys751Gln, rs13181). This preliminary study is the first of its kind conducted on an Algerian population. A total of 129 patients with CRC and 148 unrelated normal subjects were enrolled in our case/control study. The genotyping was performed by pyrosequencing method. The allele, genotype and haplotype distributions were compared between cases and controls by the calculation of the odds ratio with a confidence interval of 95%. Statistical analysis showed that there were no significant differences in the distribution of allele and genotype frequencies between cases and controls (p> 0.05). Furthermore, a significant association was found between the combined heterozygous of XRCC3 and homozygous variant of ERCC2 gene and CRC (OR = 7.33, p = 0.02). In conclusion, it would be very interesting to explore other polymorphisms of DNA repair genes in order to fully characterize the genetic determinism of the CRC in our population. In addition, further studies examining the role of environmental factors on a larger sample size will be needed to propose the best preventive strategies for CRC in our population. مرض سرطان القولون مشكلة صحية عمومية واسعة االنتشار في الجزائر ويحدث بسبب تآلف عدد من العوامل الجينية والبيئية. العديد من الجينات ارتبطت بخطر االصابة بالسرطان من بينها تلك التي ترمز لبروتينات مشاركة في اصالح الحمض النووي. لتقييم العالقة بين تعدد أشكال النيوكليوتيدة لجينات اصالح الحمض النووي و سرطان القولون في المجتمع الجزائري أجرينا في هذا البحث دراسة حالة/شاهد على سكان غرب الجزائر و قد تم دراسة تعدد أشكال النيوكليوتيدة التالية: (p.Arg399Gln, rs25487) XRCC1 لجين c.1196G>A (p.Thr241Met, rs861539( XRCC3 لجين c.722C>T (p.Asn118=, rs11615) ERCC1 لجين c.354C>T (p.Lys751Gln, rs13181) ERCC2 لجين c.2251A>C لعلمنا أن هذه الدراسة هي األولى من نوعها على الجزائريين. شملت هذه الدراسة 921 مريض مصابين بسرطان القولون و 941 شخص عادي. تم تحديد النمط الجيني باستخدام تقنية pyrosequencing .تم تحديد مقارنة الترددات األليلية، األنماط الجينية واألنماط الفردانية بين المجموعتين عن طريق حساب نسبة األرجحية (OR (مع مجال الثقة 19.٪ أظهر التحليل اإلحصائي أنه ال يوجد فرق في توزيع ترددات األليالت و األنماط الجينية بين الحاالت و العاديين )05.0> p .)من ناحية أخرى، وجدنا عالقة وثيقة بين النمط الجيني المتشكل من )CT (XRCC3 و )CC (ERCC2 و .)p = 0.02 ،OR = 7.33( القولون سرطان خطر في الختام، سيكون من المثير لالهتمام استكشاف تعدد أشكال النيوكليوتيدة األخرى لجينات اصالح الحمض النووي من أجل توصيف وراثي أكثر دقة لسرطان القولون في مجتمعنا. باإلضافة إلى ذلك، هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات مع إشراك العوامل البيئية على عدد أكبر من السكان التخاذ التدابير الالزمة واألنسب لسكاننا للوقاية من هذا المرض.
Directeur de thèse :	ABERKANE , Meriem Samia