| Titre : | Etude moléculaire de la maladie Xeroderma Pigmentosum dans la région de l’Ouest Algérien | | Type de document : | document électronique | | Auteurs : | BENSENOUCI Salima, Auteur | | Année de publication : | 2016 / 2017 | | Accompagnement : | CD | | Langues : | Français (fre) | | Catégories : | Biologie
| | Mots-clés : | Xeroderma pigmentosum, XPA, XPC, système
NER, mutation, Ouest Algérien.
جفاف الجلد المصطبغ، XPA، XPC، نظام NER، طفرات، الغرب الجزائري
Xeroderma pigmentosum, XPA, XPC, NER system, mutation, West Algerian. | | Résumé : | Le Xeroderma pigmentosum (XP) est une maladie héréditaire rare, caractérisée par une hypersensibilité aux rayons UV due à des altérations de la voie de réparation par excision de nucléotides (NER). Les patients XP ont un risque élevé de développer des cancers cutanés et ophtalmologiques, certains présentent également des troubles neurologiques.
Sa transmission sur le mode autosomique récessif explique sa relative fréquence dans les pays où la consanguinité est élevée et la taille des familles est grande, tels que les pays du Maghreb
À ce jour, huit gènes (XPA à XPG et XPV) sont responsables de la maladie. Parmi eux, les gènes XPA et XPC décrits comme les plus fréquemment mutés chez les patients XP dans les pays du Maghreb.
Cette présente étude consiste à l’exploration de deux mutations qui par la littérature semblent les plus fréquentes dans les pays du Nord Africain : Mutation non-sens (c.682C> T, p.Arg228X) siégeant au niveau du gène XPA, et une délétion de deux paires de bases (c.1643_1644delTG ou p.Val548Ala fsX25) au niveau du gène XPC. L’étude s’est portée sur 19 familles non apparentées et l’exploration des mutations a été réalisée par différentes techniques de biologie moléculaire (PCR-RFLP, PCR-séquençage).
L’analyse bio-informatique a montré que parmi les 19 cas index, 17 cas présentaient la mutation delTG (délétion de 2pb) à l’état homozygote. Les deux cas restant ne présentaient pas de délétion mais portaient la mutation non-sens R228X à l’état homozygote.
Les résultats obtenus ont révélé que la mutation (p.Val548AlafsX25) est la cause majeure du xeroderma pigmentosum dans les familles Algériennes.
La conception d’une méthode simple pour permettre le diagnostic moléculaire précis, aurait un impact important sur l'amélioration de la prise en charge des patients et de leurs proches. Cela pourrait également contribuer à moyen terme à la mise en place d’un programme « conseil génétique » pour les familles à risque.
A long terme, les résultats obtenus contribueront au dépistage des porteurs asymptomatiques pour diminuer la fréquence d’hétérozygotie ainsi que la fréquence de cette maladie.
Xeroderma pigmentosum (XP) is a rare inherited disease, characterized by hypersensitivity to UV radiation due to deteriorations of the nucleotide excision repair pathway (NER). The XP patients have a high risk to develop skin and eye cancers, some also present neurological disorders.
Its transmission autosomal recessive explains its relative frequency in countries where consanguinity is high and family size is large, such as the Maghreb countries
To date, eight genes (XPA to XPG and XPV) are responsible for the disease. Among them, the XPA and XPC genes described as the most frequently mutated in XP patients in the Maghreb countries.
This present study consists to explore two mutations that appear in literature the most frequent in the countries of North Africa: Nonsense mutation (c.682C> T, p.Arg228X) sitting at the XPA gene and a deletion two base pairs (c.1643_1644delTG or p.Val548Ala fsX25) at the XPC gene. The study included 19 unrelated families and the exploration of mutations was carried out by various molecular biology techniques (PCR-RFLP, PCR-sequencing).
The bioinformatics analysis showed that among the 19 index cases, 17 cases had the mutation delTG (deletion of 2bp) at the homozygous state. The remaining 2 cases showed no deletion but carried the nonsense mutation R228X in the homozygous state.
The results obtained revealed that the mutation (p.Val548AlafsX25) is the major cause of xeroderma pigmentosum in Algerian families.
Design a simple method to allow the precise molecular diagnosis would have a significant impact on improving the care of patients and their relatives, and in the medium term it could contribute to the implementation of a program "genetic counseling" for families at risk.
In the long run, these findings will contribute to screening asymptomatic carriers to reduce the frequency of the heterozygosity and the frequency of this disease.
جفاف الجلد المصطبغ (XP) هو مرض وراثي نادر، يتميز بوجود حساسية مفرطة للأشعة فوق البنفسجية(UV) بسبب خلل في الية إصلاح استئصال النوكليوتيدات (NER)التي تحدث للحمض النووي «DNA». المرضى XP لديهم مخاطر عالية لتطوير سرطان الجلد والعين، وفي بعض الحالات الاضطرابات العصبية.
المرض هو وراثي جسمي متنحي وهذا ما يفسر التردد النسبي في البلدان التي تكون فيها زواج الأقارب عالية وحجم الأسرة كبير، مثل دول المغرب العربي.
حتى الآن، ثمانية مورثات (XPA إلى XPG وXPV) هي المسؤولة عن هذا المرض. من بينها، جينات XPA وXPC وصفها في معظم الأحيان تحور في XP المرضى في بلدان المغرب العربي.
ترمي هذه الدراسة إلى استكشاف اثنين من الطفرات التي تظهر في البحوث الأكثر شيوعا في ودول شمال أفريقيا: طفرة (c.682C> T، p.Arg228X) المتواجدة في الجين XPA وحذف زوجي قاعدتين (c.1643_1644delTG أو p.Val548Ala fsX25) على مستوى المورثة XPC. وشملت الدراسة 19 عائلة غير ذات قرابة و تم البحث عن الطفرات عن طريق استعمال مختلف تقنيات البيولوجيا الجزيئية (PCR-RFLP, PCR-sequencing).
أظهر التحاليل المعلوماتية الحيوية أن من بين 19حالة مؤشرة، كانت 17 حالة حاملة للطفرةdelTG (حذف 2pb) بشكل متماثل. أما الحالتيت المتبقيتين لم تكونا حاملتين للحذف بل اشارت الى وجود الطفرة R228X بشكل متماثل.
وكشفت نتائج الدراسة المتحصل عليها أن الطفرة (p.Val548AlafsX25) هي السبب الرئيسي لمرض الجلد المصطبغ عند الأسر الجزائرية.
تصميم طريقة بسيطة للسماح بالتشخيص الجزيئي الدقيق سيكون لها تأثير كبير على تحسين رعاية المرضى وذويهم، وعلى المدى المتوسط يمكن أن تساهم في تنفيذ برنامج "الاستشارة الوراثية" للأسر المعرضة للخطر.
على المدى الطويل سوف تساهم هذه النتائج لفحص الناقلين بدون أعراض، للحد من وتيرة تغاير وتردد هذا المرض.
| | Directeur de thèse : | SAIDI-MEHTAR Nadhira |
Etude moléculaire de la maladie Xeroderma Pigmentosum dans la région de l’Ouest Algérien [document électronique] / BENSENOUCI Salima, Auteur . - 2016 / 2017 . - + CD. Langues : Français ( fre) | Catégories : | Biologie
| | Mots-clés : | Xeroderma pigmentosum, XPA, XPC, système
NER, mutation, Ouest Algérien.
جفاف الجلد المصطبغ، XPA، XPC، نظام NER، طفرات، الغرب الجزائري
Xeroderma pigmentosum, XPA, XPC, NER system, mutation, West Algerian. | | Résumé : | Le Xeroderma pigmentosum (XP) est une maladie héréditaire rare, caractérisée par une hypersensibilité aux rayons UV due à des altérations de la voie de réparation par excision de nucléotides (NER). Les patients XP ont un risque élevé de développer des cancers cutanés et ophtalmologiques, certains présentent également des troubles neurologiques.
Sa transmission sur le mode autosomique récessif explique sa relative fréquence dans les pays où la consanguinité est élevée et la taille des familles est grande, tels que les pays du Maghreb
À ce jour, huit gènes (XPA à XPG et XPV) sont responsables de la maladie. Parmi eux, les gènes XPA et XPC décrits comme les plus fréquemment mutés chez les patients XP dans les pays du Maghreb.
Cette présente étude consiste à l’exploration de deux mutations qui par la littérature semblent les plus fréquentes dans les pays du Nord Africain : Mutation non-sens (c.682C> T, p.Arg228X) siégeant au niveau du gène XPA, et une délétion de deux paires de bases (c.1643_1644delTG ou p.Val548Ala fsX25) au niveau du gène XPC. L’étude s’est portée sur 19 familles non apparentées et l’exploration des mutations a été réalisée par différentes techniques de biologie moléculaire (PCR-RFLP, PCR-séquençage).
L’analyse bio-informatique a montré que parmi les 19 cas index, 17 cas présentaient la mutation delTG (délétion de 2pb) à l’état homozygote. Les deux cas restant ne présentaient pas de délétion mais portaient la mutation non-sens R228X à l’état homozygote.
Les résultats obtenus ont révélé que la mutation (p.Val548AlafsX25) est la cause majeure du xeroderma pigmentosum dans les familles Algériennes.
La conception d’une méthode simple pour permettre le diagnostic moléculaire précis, aurait un impact important sur l'amélioration de la prise en charge des patients et de leurs proches. Cela pourrait également contribuer à moyen terme à la mise en place d’un programme « conseil génétique » pour les familles à risque.
A long terme, les résultats obtenus contribueront au dépistage des porteurs asymptomatiques pour diminuer la fréquence d’hétérozygotie ainsi que la fréquence de cette maladie.
Xeroderma pigmentosum (XP) is a rare inherited disease, characterized by hypersensitivity to UV radiation due to deteriorations of the nucleotide excision repair pathway (NER). The XP patients have a high risk to develop skin and eye cancers, some also present neurological disorders.
Its transmission autosomal recessive explains its relative frequency in countries where consanguinity is high and family size is large, such as the Maghreb countries
To date, eight genes (XPA to XPG and XPV) are responsible for the disease. Among them, the XPA and XPC genes described as the most frequently mutated in XP patients in the Maghreb countries.
This present study consists to explore two mutations that appear in literature the most frequent in the countries of North Africa: Nonsense mutation (c.682C> T, p.Arg228X) sitting at the XPA gene and a deletion two base pairs (c.1643_1644delTG or p.Val548Ala fsX25) at the XPC gene. The study included 19 unrelated families and the exploration of mutations was carried out by various molecular biology techniques (PCR-RFLP, PCR-sequencing).
The bioinformatics analysis showed that among the 19 index cases, 17 cases had the mutation delTG (deletion of 2bp) at the homozygous state. The remaining 2 cases showed no deletion but carried the nonsense mutation R228X in the homozygous state.
The results obtained revealed that the mutation (p.Val548AlafsX25) is the major cause of xeroderma pigmentosum in Algerian families.
Design a simple method to allow the precise molecular diagnosis would have a significant impact on improving the care of patients and their relatives, and in the medium term it could contribute to the implementation of a program "genetic counseling" for families at risk.
In the long run, these findings will contribute to screening asymptomatic carriers to reduce the frequency of the heterozygosity and the frequency of this disease.
جفاف الجلد المصطبغ (XP) هو مرض وراثي نادر، يتميز بوجود حساسية مفرطة للأشعة فوق البنفسجية(UV) بسبب خلل في الية إصلاح استئصال النوكليوتيدات (NER)التي تحدث للحمض النووي «DNA». المرضى XP لديهم مخاطر عالية لتطوير سرطان الجلد والعين، وفي بعض الحالات الاضطرابات العصبية.
المرض هو وراثي جسمي متنحي وهذا ما يفسر التردد النسبي في البلدان التي تكون فيها زواج الأقارب عالية وحجم الأسرة كبير، مثل دول المغرب العربي.
حتى الآن، ثمانية مورثات (XPA إلى XPG وXPV) هي المسؤولة عن هذا المرض. من بينها، جينات XPA وXPC وصفها في معظم الأحيان تحور في XP المرضى في بلدان المغرب العربي.
ترمي هذه الدراسة إلى استكشاف اثنين من الطفرات التي تظهر في البحوث الأكثر شيوعا في ودول شمال أفريقيا: طفرة (c.682C> T، p.Arg228X) المتواجدة في الجين XPA وحذف زوجي قاعدتين (c.1643_1644delTG أو p.Val548Ala fsX25) على مستوى المورثة XPC. وشملت الدراسة 19 عائلة غير ذات قرابة و تم البحث عن الطفرات عن طريق استعمال مختلف تقنيات البيولوجيا الجزيئية (PCR-RFLP, PCR-sequencing).
أظهر التحاليل المعلوماتية الحيوية أن من بين 19حالة مؤشرة، كانت 17 حالة حاملة للطفرةdelTG (حذف 2pb) بشكل متماثل. أما الحالتيت المتبقيتين لم تكونا حاملتين للحذف بل اشارت الى وجود الطفرة R228X بشكل متماثل.
وكشفت نتائج الدراسة المتحصل عليها أن الطفرة (p.Val548AlafsX25) هي السبب الرئيسي لمرض الجلد المصطبغ عند الأسر الجزائرية.
تصميم طريقة بسيطة للسماح بالتشخيص الجزيئي الدقيق سيكون لها تأثير كبير على تحسين رعاية المرضى وذويهم، وعلى المدى المتوسط يمكن أن تساهم في تنفيذ برنامج "الاستشارة الوراثية" للأسر المعرضة للخطر.
على المدى الطويل سوف تساهم هذه النتائج لفحص الناقلين بدون أعراض، للحد من وتيرة تغاير وتردد هذا المرض.
| | Directeur de thèse : | SAIDI-MEHTAR Nadhira |
|
Affiner la rechercheEtude moléculaire de la maladie Xeroderma Pigmentosum dans la région de l’Ouest Algérien / BENSENOUCI Salima
