Bibliothèque de la Faculté des sciences de la nature et de la vie université USTOMB
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Titre : Analyse statistique des séquences biologiques : modélisation markovienne, alignements et motifs Type de document : texte imprimé Auteurs : Grégory Nuel, Auteur ; Bernard Prum (1946-2015), Auteur Editeur : Paris : Hermès science publications-Lavoisier Année de publication : 2007 Collection : Collection Bioinformatique Importance : 1 vol. (361 p.) Présentation : ill., graph. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7462-1491-0 Note générale : Bibliogr. et webliogr. p. 349-357. Index Langues : Français (fre) Index. décimale : 570.1 Résumé : L'ouvrage Analyse statistique des séquences biologiques est le résultat de quinze années de recherche et présente de manière synthétique et didactique une approche nouvelle fondée sur les automates finis.
L'analyse statistique des séquences génomiques – un des points forts de la recherche en bioinformatique ou en biostatistique en France – développe des outils permettant la modélisation des séquences (chaînes de Markov, chaînes de Markov cachées) ainsi que l'étude des occurrences de motifs (par une approche novatrice fondée sur les automates finis déterministes). Elle permet également la recherche automatique de gènes et d'autres signaux biologiques (annotation) et compare des séquences provenant d'espèces différentes (alignement), en particulier pour reconstruire l'histoire de leur évolution (phylogénie).
Une présentation du domaine biologique et des divers modèles markoviens utilisés permet une lecture autonome. Les méthodes sont illustrées par de nombreux exemples et figures, les algorithmes qui leur correspondent sont systématiquement détaillés et l'on donne en référence les sites web et programmes qui permettent leur mise en œuvre pratique.Analyse statistique des séquences biologiques : modélisation markovienne, alignements et motifs [texte imprimé] / Grégory Nuel, Auteur ; Bernard Prum (1946-2015), Auteur . - Paris : Hermès science publications-Lavoisier, 2007 . - 1 vol. (361 p.) : ill., graph. ; 24 cm. - (Collection Bioinformatique) .
ISBN : 978-2-7462-1491-0
Bibliogr. et webliogr. p. 349-357. Index
Langues : Français (fre)
Index. décimale : 570.1 Résumé : L'ouvrage Analyse statistique des séquences biologiques est le résultat de quinze années de recherche et présente de manière synthétique et didactique une approche nouvelle fondée sur les automates finis.
L'analyse statistique des séquences génomiques – un des points forts de la recherche en bioinformatique ou en biostatistique en France – développe des outils permettant la modélisation des séquences (chaînes de Markov, chaînes de Markov cachées) ainsi que l'étude des occurrences de motifs (par une approche novatrice fondée sur les automates finis déterministes). Elle permet également la recherche automatique de gènes et d'autres signaux biologiques (annotation) et compare des séquences provenant d'espèces différentes (alignement), en particulier pour reconstruire l'histoire de leur évolution (phylogénie).
Une présentation du domaine biologique et des divers modèles markoviens utilisés permet une lecture autonome. Les méthodes sont illustrées par de nombreux exemples et figures, les algorithmes qui leur correspondent sont systématiquement détaillés et l'on donne en référence les sites web et programmes qui permettent leur mise en œuvre pratique.Exemplaires (2)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 00826 04-05-23 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres Consultation sur place
Exclu du prêt00827 04-05-23 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres prêt possible
Disponible
Titre : Biologie systémique : standards et modèles Type de document : texte imprimé Auteurs : ECRIN - Échange et coordination, recherche industrie, Auteur ; Magali Roux, Directeur de publication Editeur : Sophia-Antipolis : Omniscience Année de publication : 2007 Importance : 1 vol. (288 p.) Présentation : ill., couv. ill. en coul. Format : 23 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-916097-12-1 Note générale : Index Langues : Français (fre) Index. décimale : 570.1 Résumé : La biologie systémique est une nouvelle approche interdisciplinaire de la biologie qui élargit le champ de la biologie moléculaire pour étudier des ensembles d'éléments en interaction les uns avec les autres, c'est-à -dire des systèmes de molécules (ADN, protéines, complexes moléculaires, édifices supramoléculaires, petites molécules, etc.). Pour observer simultanément tous ces systèmes d'éléments, la biologie systémique a recours aux différents domaines de la biologie à haut débit (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, etc.).
Face à ce déluge d'information, sa première vocation est de réaliser l'intégration des données dans des modèles conceptuels. L'objet de tels modèles est d'expliquer les mécanismes de fonctionnement des systèmes étudiés et de prédire leur comportement et leur évolution. Pour répondre au défi de la biologie systémique, et afin de faciliter et d'assurer un meilleur partage des données entre chercheurs, la communauté scientifique internationale a engagé différentes initiatives de standardisation.
Cet ouvrage pionnier a été rédigé par plus de 25 spécialistes internationaux. Il traite, en 12 chapitres, des enjeux de ces procédures de standardisation : standardisation des domaines technologiques (transcriptome, protéome, etc.), standardisation des langages (ontologies, langages d'échange, langages spécifiques de domaine), standardisation des formalismes de représentation (graphiques, mathématiques), etc.
La " preuve du concept " est illustrée, notamment, par le modèle de la cellule cardiaque et par son application au traitement de l'arythmie. Enfin, une théorie de l'intégration basée sur l'ingénierie dirigée par les modèles (IDM) fournit les outils nécessaires pour organiser les modèles multivue, multiéchelle, multireprésentation et multiformalisme qui rendent compte de la complexité des systèmes biologiques.Note de contenu : MIAME, MAGE et transcriptome
MIAPE, PSI et protéomique
XML, RDF, OWL : langages de description et d'échanges de données
BFO : pour la standardisation des ontologies biomédicales OBO
GO : annotation fonctionnelle
Le paradigme IMGT-ONTOLOGY
SBML : langage de modélisation des réseaux biochimiques
SBNG : notation graphique des réseaux biochimiques
Formalismes mathématiques : des standards de fait
Physiome : de la molécule à l'organisme
CellML : de la cellule au médicament
IDM : des standards à une architecture de modèlesBiologie systémique : standards et modèles [texte imprimé] / ECRIN - Échange et coordination, recherche industrie, Auteur ; Magali Roux, Directeur de publication . - Sophia-Antipolis : Omniscience, 2007 . - 1 vol. (288 p.) : ill., couv. ill. en coul. ; 23 cm.
ISBN : 978-2-916097-12-1
Index
Langues : Français (fre)
Index. décimale : 570.1 Résumé : La biologie systémique est une nouvelle approche interdisciplinaire de la biologie qui élargit le champ de la biologie moléculaire pour étudier des ensembles d'éléments en interaction les uns avec les autres, c'est-à -dire des systèmes de molécules (ADN, protéines, complexes moléculaires, édifices supramoléculaires, petites molécules, etc.). Pour observer simultanément tous ces systèmes d'éléments, la biologie systémique a recours aux différents domaines de la biologie à haut débit (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, etc.).
Face à ce déluge d'information, sa première vocation est de réaliser l'intégration des données dans des modèles conceptuels. L'objet de tels modèles est d'expliquer les mécanismes de fonctionnement des systèmes étudiés et de prédire leur comportement et leur évolution. Pour répondre au défi de la biologie systémique, et afin de faciliter et d'assurer un meilleur partage des données entre chercheurs, la communauté scientifique internationale a engagé différentes initiatives de standardisation.
Cet ouvrage pionnier a été rédigé par plus de 25 spécialistes internationaux. Il traite, en 12 chapitres, des enjeux de ces procédures de standardisation : standardisation des domaines technologiques (transcriptome, protéome, etc.), standardisation des langages (ontologies, langages d'échange, langages spécifiques de domaine), standardisation des formalismes de représentation (graphiques, mathématiques), etc.
La " preuve du concept " est illustrée, notamment, par le modèle de la cellule cardiaque et par son application au traitement de l'arythmie. Enfin, une théorie de l'intégration basée sur l'ingénierie dirigée par les modèles (IDM) fournit les outils nécessaires pour organiser les modèles multivue, multiéchelle, multireprésentation et multiformalisme qui rendent compte de la complexité des systèmes biologiques.Note de contenu : MIAME, MAGE et transcriptome
MIAPE, PSI et protéomique
XML, RDF, OWL : langages de description et d'échanges de données
BFO : pour la standardisation des ontologies biomédicales OBO
GO : annotation fonctionnelle
Le paradigme IMGT-ONTOLOGY
SBML : langage de modélisation des réseaux biochimiques
SBNG : notation graphique des réseaux biochimiques
Formalismes mathématiques : des standards de fait
Physiome : de la molécule à l'organisme
CellML : de la cellule au médicament
IDM : des standards à une architecture de modèlesExemplaires (2)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 01850 20bm-02-13 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres Consultation sur place
Exclu du prêt01851 20bm-02-13 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres prêt possible
Disponible
Titre : Biostastistique : une approche intuitive Type de document : texte imprimé Auteurs : Motulsky, Harvey, Auteur ; Michèle Dramaix-Wilmet, Traducteur ; Fabienne Nackers, Traducteur Editeur : Paris : De Boeck université Année de publication : 2002 Collection : Sciences & méthodes, ISSN 1376-2281 Importance : 484 p. Présentation : graph. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7445-0092-3 Note générale : Index Langues : Français (fre) Langues originales : Anglais (eng) Index. décimale : 570.1 Résumé : Cet ouvrage présente les principales méthodes de statistique médicale utilisées dans la pratique quotidienne et dans la littérature théorique. Par une approche claire et synthétique, il aborde de manière détaillée les concepts et les techniques de base tels qu'intervalle de confiance, test d'hypothèse, P-valeur, test t, test X², corrélation et régression. Il introduit également les tests non paramétriques, la survie, l'analyse de variance à un facteur et des techniques plus poussées telles que la régression linéaire multiple, logistique et non linéaire. L'auteur insiste tout particulièrement sur l'interprétation des résultats, les conditions et situations d'application des méthodes et il met l'accent sur les aspects pratiques. Les sections plus techniques ou avancées sont Note de contenu : Les intervalles de confiance
La comparaison de groupes au moyen d'intervalles de confiance
Introduction aux P-valeurs
La logique bayésienne
La corrélation et la régression
Le design des essais cliniques
Les tests statistiques usuels
Introduction aux tests statistiques avancés
Vue d'ensembleBiostastistique : une approche intuitive [texte imprimé] / Motulsky, Harvey, Auteur ; Michèle Dramaix-Wilmet, Traducteur ; Fabienne Nackers, Traducteur . - Paris : De Boeck université, 2002 . - 484 p. : graph. ; 24 cm. - (Sciences & méthodes, ISSN 1376-2281) .
ISBN : 978-2-7445-0092-3
Index
Langues : Français (fre) Langues originales : Anglais (eng)
Index. décimale : 570.1 Résumé : Cet ouvrage présente les principales méthodes de statistique médicale utilisées dans la pratique quotidienne et dans la littérature théorique. Par une approche claire et synthétique, il aborde de manière détaillée les concepts et les techniques de base tels qu'intervalle de confiance, test d'hypothèse, P-valeur, test t, test X², corrélation et régression. Il introduit également les tests non paramétriques, la survie, l'analyse de variance à un facteur et des techniques plus poussées telles que la régression linéaire multiple, logistique et non linéaire. L'auteur insiste tout particulièrement sur l'interprétation des résultats, les conditions et situations d'application des méthodes et il met l'accent sur les aspects pratiques. Les sections plus techniques ou avancées sont Note de contenu : Les intervalles de confiance
La comparaison de groupes au moyen d'intervalles de confiance
Introduction aux P-valeurs
La logique bayésienne
La corrélation et la régression
Le design des essais cliniques
Les tests statistiques usuels
Introduction aux tests statistiques avancés
Vue d'ensembleExemplaires (3)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 00565 04-00-03 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres Consultation sur place
Exclu du prêt00566 04-00-03 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres prêt possible
Disponible00567 04-00-03 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres prêt possible
Disponible
Titre : Biostatistique Type de document : texte imprimé Auteurs : Beuscart (1951-....), Directeur de publication ; Pascal Roy (19..-....), Directeur de publication ; Catherine Quantin (19..-....), Directeur de publication ; Alain-Jacques Valleron (1943-....), Préfacier, etc. Editeur : Montreuil : Omniscience Année de publication : 2010 Importance : 1 vol. (397 p.) Présentation : ill. Format : 25 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-916097-18-3 Langues : Français (fre) Index. décimale : 570.1 Résumé : Ce manuel est le fruit de l'expérience pédagogique de trente-sept enseignants du premier cycle des professions de santé. Structuré selon des exigences très strictes en treize chapitres reflétant fidèlement la réalité de l'enseignement médical de première année, il contient tous les éléments nécessaires à une bonne compréhension des méthodes biostatistiques de base par les futurs médecins, pharmaciens, sages-femmes, kinésithérapeutes et autres professionnels de santé.
Il s'appuie sur un texte concis, sur plus de 100 illustrations et près de 170 exemples et encadrés pédagogiques, qui proposent en permanence, au fil des pages, un lien direct avec la réalité du futur praticien. Plus de 120 QCM, rédigés dans l'esprit du concours de première année, permettent au lecteur de s'entraîner et d'évaluer sa compréhension du cours. Toutes les réponses à ces questions et des tests interactifs sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Un ouvrage absolument indispensable pour réussir son concours !Note de contenu : Les probabilités
Sensibilité, spécificité et valeurs prédictives
L'analyse descriptive
Estimation et intervalle de confiance
Les principes des tests d'hypothèse
Comparaison de fréquences
Les tests de comparaison des moyennes
Les tests non paramétriques
Corrélation et régression
Les principes méthodologiques des essais cliniques
Les statistiques pour l'épidémiologie
L'analyse de la survie
L'analyse de décision médicaleBiostatistique [texte imprimé] / Beuscart (1951-....), Directeur de publication ; Pascal Roy (19..-....), Directeur de publication ; Catherine Quantin (19..-....), Directeur de publication ; Alain-Jacques Valleron (1943-....), Préfacier, etc. . - Montreuil : Omniscience, 2010 . - 1 vol. (397 p.) : ill. ; 25 cm.
ISBN : 978-2-916097-18-3
Langues : Français (fre)
Index. décimale : 570.1 Résumé : Ce manuel est le fruit de l'expérience pédagogique de trente-sept enseignants du premier cycle des professions de santé. Structuré selon des exigences très strictes en treize chapitres reflétant fidèlement la réalité de l'enseignement médical de première année, il contient tous les éléments nécessaires à une bonne compréhension des méthodes biostatistiques de base par les futurs médecins, pharmaciens, sages-femmes, kinésithérapeutes et autres professionnels de santé.
Il s'appuie sur un texte concis, sur plus de 100 illustrations et près de 170 exemples et encadrés pédagogiques, qui proposent en permanence, au fil des pages, un lien direct avec la réalité du futur praticien. Plus de 120 QCM, rédigés dans l'esprit du concours de première année, permettent au lecteur de s'entraîner et d'évaluer sa compréhension du cours. Toutes les réponses à ces questions et des tests interactifs sont disponibles sur le site de l'éditeur.
Un ouvrage absolument indispensable pour réussir son concours !Note de contenu : Les probabilités
Sensibilité, spécificité et valeurs prédictives
L'analyse descriptive
Estimation et intervalle de confiance
Les principes des tests d'hypothèse
Comparaison de fréquences
Les tests de comparaison des moyennes
Les tests non paramétriques
Corrélation et régression
Les principes méthodologiques des essais cliniques
Les statistiques pour l'épidémiologie
L'analyse de la survie
L'analyse de décision médicaleExemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 00568 04-00-04 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres Consultation sur place
Exclu du prêt
Titre : Biostatistique : une approche intuitive Type de document : texte imprimé Auteurs : Harvey Motulsky, Auteur ; Michèle Dramaix-Wilmet, Traducteur Mention d'édition : 2e éd. Editeur : Bruxelles : De Boeck Année de publication : 2013 Importance : 1 vol. (XIII-492 p.) Présentation : ill. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-8041-6376-1 Note générale : Bibliogr. p. 465-471. Index Langues : Français (fre) Langues originales : Anglais (eng) Index. décimale : 570.1 Résumé : Présente les principales méthodes de statistique médicale utilisées dans la pratique quotidienne et dans la littérature théorique. Aborde de manière détaillée les concepts et les techniques de base : intervalle de confiance, test d'hypothèse, p-valeur, test t, corrélation et régression. Insiste sur l'interprétation des résultats, les conditions et situations d'application des méthodes. Biostatistique : une approche intuitive [texte imprimé] / Harvey Motulsky, Auteur ; Michèle Dramaix-Wilmet, Traducteur . - 2e éd. . - Bruxelles : De Boeck, 2013 . - 1 vol. (XIII-492 p.) : ill. ; 24 cm.
ISBN : 978-2-8041-6376-1
Bibliogr. p. 465-471. Index
Langues : Français (fre) Langues originales : Anglais (eng)
Index. décimale : 570.1 Résumé : Présente les principales méthodes de statistique médicale utilisées dans la pratique quotidienne et dans la littérature théorique. Aborde de manière détaillée les concepts et les techniques de base : intervalle de confiance, test d'hypothèse, p-valeur, test t, corrélation et régression. Insiste sur l'interprétation des résultats, les conditions et situations d'application des méthodes. Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 00572 04-00-07 livres Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* livres Consultation sur place
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