Documents disponibles écrits par cet auteur

Constitution d'une biothéque d'ADN équin. Caractérisation généique des races équines en Algérie par l'étude des microsatellites / Naima BERBER 

Public ISBD Titre : Constitution d'une biothéque d'ADN équin. Caractérisation généique des races équines en Algérie par l'étude des microsatellites Type de document : document électronique Auteurs : Naima BERBER, Auteur Année de publication : 2015 Importance : 119 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :biologie moléculaire Mots-clés : Algérie  races équines  marqueurs microsatellites  variabilité génétique. Algeria  horse breeds  microsatellite markers  genetic variability. الجزائر  سلالات الخیول  الواسمات الوراثیة  التنوع الوراثي Résumé : La filière équine occupe une place importante dans l’histoire et l’économie de l’Algérie. Afin d’apporter des outils efficaces à la gestion des races équines algériennes, nous avons réalisé une étude de caractérisation génétique par l’utilisation d’un panel de 14 marqueurs microsatellites. Cette étude préliminaire est la première du genre dans notre pays. Les marqueurs microsatellites ont été utilisés pour génotyper 201 chevaux appartenant à cinq races (55 Arabe- Barbe, 57 Pur-sang Arabe, 41 Barbe, 22 Pur-sang Anglais et 26 Trotteur français). Les résultats obtenus ont montré que tous les marqueurs microsatellites utilisés étaient fortement polymorphes avec un nombre d’allèles par locus variant de 6 pour le marqueur HTG4 à 14 pour le marqueur ASB17. Une forte diversité génétique a été observée avec des valeurs d’hétérozygoties varient de 0.71 chez le Pur-sang Anglais à 0.77 chez l’Arabe-Barbe. Nos résultats ont permis de bien distinguer les races autochtones Barbe et Arabe-Barbe, des autres races, et de montrer que l’Arabe-Barbe était génétiquement plus proche des Barbes que des Pur- sang Arabes. D’une façon concordante, les analyses de structuration (AFC, approche bayésienne de groupement) donnent des informations plus précises sur les relations entre les différentes races, et montrent une proximité génétique entre les deux races autochtones (Barbe et Arabe-Barbe). En conclusion, les données et les informations apportées par cette étude, représentent une base de référence, afin de préserver la variabilité génétique de nos races équines et d’améliorer les méthodes de gestion de l’élevage équin en Algerie. In Algeria, the horse occupies an important space in the history. Genetic structure and breeding practices, in the horse species, were investigated in order to develop some management tools for five horse breeds, by analyzing a panel of 14 microsatellite molecular markers. This preliminary study is the first of this kind realized in Algeria. The 14 microsatellite markers were used to genotype 201 animals (55 Arab-Barb, 57 Arabian, 41 Barb, 22 Thoroughbred and 26 French Trotter). Results showed that all markers were highly polymorphic, with a number of alleles per locus ranging between 6 (HTG4) and 14 (ASB17). High gene diversity was observed; indeed, expected heterozygosity values ranged from 0.71 in the Thoroughbred horses to 0.77 in the Arab-Barb horses. Our results showed a significant genetic variation between the native horse populations (Barb, ArabBarb) and the other breeds, and that the Arab-Barb was genetically closer to the Barb than to the Arabian. Different genetic structure analysis approaches (AFC, Bayesian structuring) consistently highlighted the Barb and Arab-Barb as genetically more related. In conclusion, the data and information delivered by this study provide the preliminary background knowledge needed to preserve genetic variability of the equine breeds in Algeria and improve methods of livestock management قطاع الخیول في الجزائر یحتل مكانا ھاما في تاریخ و اقتصاد البلاد. تھدف ھذه الأطروحة إلى وصف و تحلیل ظروف تربیة الخیول و تنوعھا الوراثي، كما أنھا تھتم أیضا بسبل و آفاق تطویر استغلالھا و تثمین منتجاتھا في إطار نظم إنتاج مستدیمة. تعتبر ھذه الدراسة الأولى من نوعھا على الخیول الجزائریة. في إطار التقییم الوراثي للتنوع البیولوجي قمنا باستعمال 14 واسمات من نوع Microsatellites، شملت ھذه الدراسة 201 خیل تنتمي الى السلالات التالیة (55 Barbe ،57 Arabe sang-Pur ھذه مكنت). Trotteur Français 26و Pur-sang Anglais 22 ،Arabe-Barbe 41 الواسمات من الكشف عن 123 ألیل في العشیرة الكلیة و تحدید التنوع داخل و بین العشائر المدروسة، أظھرت النتائج أن نسبة الواسمات مرتفعة نسبیا فیما یخص التنوع داخل العشیرة الكلیة. كما ان مصفوفة المسافات الوراثیة اعطت قیم (Hnb (تغایر بین 71.0 في الإنجلیزي الاصیل و 77.0 في العربي الاصیل. أظھرت النتائج التي توصلنا الیھا تمییز واضح بین السلالات المحلیة و السلالات الأخرى، وتبین أن Barbe-Arabe أقرب جینیا إلى Barbe منھ إلى العربي الاصیل . باستعمال طرق دراسة تقارب الاجناس (groupement de bayésienne approche, AFC (و التي تعطي معلومات أكثر دقة عن العلاقات بین مختلف الأعراق، تبین ان ھناك قرب جیني كبیر بین السلالتین المحلیة. في الختام، فإن البیانات والمعلومات التي تقدمھا ھذه الدراسة تمثل الأساس للحفاظ على التنوع الجیني لسلالات الخیول لدینا وطرق تحسین إدارة تربیة الخیول في الجزائر. Directeur de thèse : GHOUAR , Samir Bachir souheil Constitution d'une biothéque d'ADN équin. Caractérisation généique des races équines en Algérie par l'étude des microsatellites [document électronique] / Naima BERBER, Auteur . - 2015 . - 119 p. + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :biologie moléculaire Mots-clés : Algérie  races équines  marqueurs microsatellites  variabilité génétique. Algeria  horse breeds  microsatellite markers  genetic variability. الجزائر  سلالات الخیول  الواسمات الوراثیة  التنوع الوراثي Résumé : La filière équine occupe une place importante dans l’histoire et l’économie de l’Algérie. Afin d’apporter des outils efficaces à la gestion des races équines algériennes, nous avons réalisé une étude de caractérisation génétique par l’utilisation d’un panel de 14 marqueurs microsatellites. Cette étude préliminaire est la première du genre dans notre pays. Les marqueurs microsatellites ont été utilisés pour génotyper 201 chevaux appartenant à cinq races (55 Arabe- Barbe, 57 Pur-sang Arabe, 41 Barbe, 22 Pur-sang Anglais et 26 Trotteur français). Les résultats obtenus ont montré que tous les marqueurs microsatellites utilisés étaient fortement polymorphes avec un nombre d’allèles par locus variant de 6 pour le marqueur HTG4 à 14 pour le marqueur ASB17. Une forte diversité génétique a été observée avec des valeurs d’hétérozygoties varient de 0.71 chez le Pur-sang Anglais à 0.77 chez l’Arabe-Barbe. Nos résultats ont permis de bien distinguer les races autochtones Barbe et Arabe-Barbe, des autres races, et de montrer que l’Arabe-Barbe était génétiquement plus proche des Barbes que des Pur- sang Arabes. D’une façon concordante, les analyses de structuration (AFC, approche bayésienne de groupement) donnent des informations plus précises sur les relations entre les différentes races, et montrent une proximité génétique entre les deux races autochtones (Barbe et Arabe-Barbe). En conclusion, les données et les informations apportées par cette étude, représentent une base de référence, afin de préserver la variabilité génétique de nos races équines et d’améliorer les méthodes de gestion de l’élevage équin en Algerie. In Algeria, the horse occupies an important space in the history. Genetic structure and breeding practices, in the horse species, were investigated in order to develop some management tools for five horse breeds, by analyzing a panel of 14 microsatellite molecular markers. This preliminary study is the first of this kind realized in Algeria. The 14 microsatellite markers were used to genotype 201 animals (55 Arab-Barb, 57 Arabian, 41 Barb, 22 Thoroughbred and 26 French Trotter). Results showed that all markers were highly polymorphic, with a number of alleles per locus ranging between 6 (HTG4) and 14 (ASB17). High gene diversity was observed; indeed, expected heterozygosity values ranged from 0.71 in the Thoroughbred horses to 0.77 in the Arab-Barb horses. Our results showed a significant genetic variation between the native horse populations (Barb, ArabBarb) and the other breeds, and that the Arab-Barb was genetically closer to the Barb than to the Arabian. Different genetic structure analysis approaches (AFC, Bayesian structuring) consistently highlighted the Barb and Arab-Barb as genetically more related. In conclusion, the data and information delivered by this study provide the preliminary background knowledge needed to preserve genetic variability of the equine breeds in Algeria and improve methods of livestock management قطاع الخیول في الجزائر یحتل مكانا ھاما في تاریخ و اقتصاد البلاد. تھدف ھذه الأطروحة إلى وصف و تحلیل ظروف تربیة الخیول و تنوعھا الوراثي، كما أنھا تھتم أیضا بسبل و آفاق تطویر استغلالھا و تثمین منتجاتھا في إطار نظم إنتاج مستدیمة. تعتبر ھذه الدراسة الأولى من نوعھا على الخیول الجزائریة. في إطار التقییم الوراثي للتنوع البیولوجي قمنا باستعمال 14 واسمات من نوع Microsatellites، شملت ھذه الدراسة 201 خیل تنتمي الى السلالات التالیة (55 Barbe ،57 Arabe sang-Pur ھذه مكنت). Trotteur Français 26و Pur-sang Anglais 22 ،Arabe-Barbe 41 الواسمات من الكشف عن 123 ألیل في العشیرة الكلیة و تحدید التنوع داخل و بین العشائر المدروسة، أظھرت النتائج أن نسبة الواسمات مرتفعة نسبیا فیما یخص التنوع داخل العشیرة الكلیة. كما ان مصفوفة المسافات الوراثیة اعطت قیم (Hnb (تغایر بین 71.0 في الإنجلیزي الاصیل و 77.0 في العربي الاصیل. أظھرت النتائج التي توصلنا الیھا تمییز واضح بین السلالات المحلیة و السلالات الأخرى، وتبین أن Barbe-Arabe أقرب جینیا إلى Barbe منھ إلى العربي الاصیل . باستعمال طرق دراسة تقارب الاجناس (groupement de bayésienne approche, AFC (و التي تعطي معلومات أكثر دقة عن العلاقات بین مختلف الأعراق، تبین ان ھناك قرب جیني كبیر بین السلالتین المحلیة. في الختام، فإن البیانات والمعلومات التي تقدمھا ھذه الدراسة تمثل الأساس للحفاظ على التنوع الجیني لسلالات الخیول لدینا وطرق تحسین إدارة تربیة الخیول في الجزائر. Directeur de thèse : GHOUAR , Samir Bachir souheil

Exemplaires

Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
4646	02-34-63	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

Documents numériques

Constitution d'une biothéque d'ADN équin. Caractérisation généique des races équines en Algérie par l'étude des microsatellites Adobe Acrobat PDF