Caractérisation anthropo-génétique des marqueurs moléculaires dans des populations de l’Ouest algérien : Dermatoglyphes digitaux, Système Duffy / ADDA NEGGAZ Leila 

Public ISBD Titre : Caractérisation anthropo-génétique des marqueurs moléculaires dans des populations de l’Ouest algérien : Dermatoglyphes digitaux, Système Duffy Type de document : document électronique Auteurs : ADDA NEGGAZ Leila, Auteur Année de publication : 2017/2018 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Mots-clés : Groupe sanguin Duffy, Dermatoglyphes, Oran, zenata, reguibates, anthropologie-génétique. Résumé : L'Afrique du Nord a représenté une zone convoitée par de nombreuses civilisations depuis l'Antiquité, en raison de son emplacement stratégique. Afin de définir les différentes histoires démographiques de trois populations Algériennes originaires du Nord Ouest Algérien et du Sud algérien (zenata, reguibates), nous avons utilisé deux approches largement utilisées en anthropologie génétique. En effet, nous nous sommes intéressé d’une part, a analyser les dermatoglyphes de ces trois populations, et de les comparer à différentes ethnies originaires de l’Afrique du Nord, du Moyen Orient et du Nord de la Méditerranée. D’autre part, nous avons caractérisé les polymorphismes génétiques du système Duffy en étudiant 5 versions alléliques du gène: FY*1, FY*2, FY*X et les allèles silencieux FY*1nul et FY*2nul. L’étude des dermatoglyphes a porté sur 315 sujets, 228 (144 hommes et 84 femmes) d'Oran, 46 reguibates (20 hommes et 26 femmes), et 42 zenata (16 hommes et 26 femmes). Les résultats révèlent la prédominance des boucles ulnaires suivies des tourbillons, des arcs et enfin des boucles radiales dans les trois populations étudiées. Ces résultats concordent avec ceux de la plupart des populations humaines. La caractérisation génétique du système Duffy a été réalisée sur 301 individus. (124 sujets résidants à Oran, 83 sujets de la population zenata, 94 sujets de la population reguibates). Les fréquences des allèles Duffy observées dans ces trois populations montrent que une prédominance de l’allèle FY*2 (48,33%) chez les oranais, prédomine suivi de l’allèle FY*1 (29,44%), de l’allèle FY*2nul (21,67%) de l’allèle FY*1nul (0,56%). Par contre l’allèle FY*X n’est pas présent. Par ailleurs, la population zenata est caractérisée par une fréquence élevée des allèles silencieux : de 65,91% pour l’allèle FY*2nul et de 12,12% pour l’allèle FY*1nul, alors que les fréquences des allèles FY*1 et FY*2 sont de 10,61% et 11,36% respectivement. Concernant les fréquences alléliques observées dans la population reguibates, elles sont de 43,28 % pour l’allèle FY*2, de 32,09% pour le FY*2nul, et de 23,13% pour le FY*1. Par ailleurs les allèles FY*1nul et FY*X ont une fréquence de 0,75%. D’après les données de la littérature, le présent travail est la première étude qui s’intéresse à établir les fréquences alléliques et génotypiques du système Duffy de la population de l’Ouest et du Sud Algérien. Finalement, en raison de l’effectif réduit des populations zenata et reguibates, il sera intéressant d’une part, d’élargir la taille de l’échantillon de ces deux populations, et d’autres part, étudier d’autres marqueurs génétiques et d’établir une base de données afin de retracer l’origine et l’histoire génétique de la population algérienne. Directeur de thèse : MEROUFEL Djabaria Naima Caractérisation anthropo-génétique des marqueurs moléculaires dans des populations de l’Ouest algérien : Dermatoglyphes digitaux, Système Duffy [document électronique] / ADDA NEGGAZ Leila, Auteur . - 2017/2018 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Mots-clés : Groupe sanguin Duffy, Dermatoglyphes, Oran, zenata, reguibates, anthropologie-génétique. Résumé : L'Afrique du Nord a représenté une zone convoitée par de nombreuses civilisations depuis l'Antiquité, en raison de son emplacement stratégique. Afin de définir les différentes histoires démographiques de trois populations Algériennes originaires du Nord Ouest Algérien et du Sud algérien (zenata, reguibates), nous avons utilisé deux approches largement utilisées en anthropologie génétique. En effet, nous nous sommes intéressé d’une part, a analyser les dermatoglyphes de ces trois populations, et de les comparer à différentes ethnies originaires de l’Afrique du Nord, du Moyen Orient et du Nord de la Méditerranée. D’autre part, nous avons caractérisé les polymorphismes génétiques du système Duffy en étudiant 5 versions alléliques du gène: FY*1, FY*2, FY*X et les allèles silencieux FY*1nul et FY*2nul. L’étude des dermatoglyphes a porté sur 315 sujets, 228 (144 hommes et 84 femmes) d'Oran, 46 reguibates (20 hommes et 26 femmes), et 42 zenata (16 hommes et 26 femmes). Les résultats révèlent la prédominance des boucles ulnaires suivies des tourbillons, des arcs et enfin des boucles radiales dans les trois populations étudiées. Ces résultats concordent avec ceux de la plupart des populations humaines. La caractérisation génétique du système Duffy a été réalisée sur 301 individus. (124 sujets résidants à Oran, 83 sujets de la population zenata, 94 sujets de la population reguibates). Les fréquences des allèles Duffy observées dans ces trois populations montrent que une prédominance de l’allèle FY*2 (48,33%) chez les oranais, prédomine suivi de l’allèle FY*1 (29,44%), de l’allèle FY*2nul (21,67%) de l’allèle FY*1nul (0,56%). Par contre l’allèle FY*X n’est pas présent. Par ailleurs, la population zenata est caractérisée par une fréquence élevée des allèles silencieux : de 65,91% pour l’allèle FY*2nul et de 12,12% pour l’allèle FY*1nul, alors que les fréquences des allèles FY*1 et FY*2 sont de 10,61% et 11,36% respectivement. Concernant les fréquences alléliques observées dans la population reguibates, elles sont de 43,28 % pour l’allèle FY*2, de 32,09% pour le FY*2nul, et de 23,13% pour le FY*1. Par ailleurs les allèles FY*1nul et FY*X ont une fréquence de 0,75%. D’après les données de la littérature, le présent travail est la première étude qui s’intéresse à établir les fréquences alléliques et génotypiques du système Duffy de la population de l’Ouest et du Sud Algérien. Finalement, en raison de l’effectif réduit des populations zenata et reguibates, il sera intéressant d’une part, d’élargir la taille de l’échantillon de ces deux populations, et d’autres part, étudier d’autres marqueurs génétiques et d’établir une base de données afin de retracer l’origine et l’histoire génétique de la population algérienne. Directeur de thèse : MEROUFEL Djabaria Naima

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1608	02-34-110	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt
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Caractérisation zootechnique et génétique des populations de dromadaire dans le sud Algérien / CHERIFI Youcef Amine

Public ISBD Titre : Caractérisation zootechnique et génétique des populations de dromadaire dans le sud Algérien Type de document : document électronique Auteurs : CHERIFI Youcef Amine, Auteur Année de publication : 2018-2019 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Mots-clés : Dromadaire, microsatellite, structure génétique, Algérie. Résumé : La gestion des ressources génétiques animales est capitale pour le développement des filières de production durables. L'élevage camelin en Algérie est concentré dans trois grandes aires de distribution, arrive à fournir toute une gamme de produits et de services grâce aux facultés d'adaptation qu'a développées le dromadaire dans un milieu où la vie est extrêmement difficile. La caractérisation des ressources génétiques animales révèle un intérêt considérable ces dernières années. Les connaissances sur la diversité génétique et la structuration des populations de dromadaire restent encore fragmentaires, malgré leurs importances socio-économiques dans les régions arides (sud Algérien). L'objectif de cette thèse est de décrire les conditions d'élevage des dromadaires, analyser leur diversité génétique intra et inter populationnel et de mettre en évidence les perspectives d'exploitation et de valorisation de leurs produits dans des systèmes d'élevage durables. Un total de 198 dromadaires provenant de sept zones d'échantillonnages du sud algérien, et représentatif de trois populations tribales (Azawad, Reguibi et Targui) ont été génotypés avec un panel de 20 marqueurs microsatellites. La variabilité intra-populationnel a été quantifié par le calcul du nombre d'allèles, les taux d'hétérozygotie observés et théoriques. Les résultats obtenus ont montré que le système d'élevage et les pratiques exercées sont archaïques. Tous les marqueurs microsatellites utilisés étaient fortement polymorphes à l'exception du marqueur (CMS17) et présentaient une moyenne de 8,53 ± 5,34 allèles, allant de 2 (YWLL59, CVRL8, VOLP32) à 23 (CVRL1D). Avec une moyenne du taux d'hétérozygotie de 0,64 ± 0,19. Quatre loci (CMS121, CMS9, VOLP10 et CMS32) ont dévié significativement de l'équilibre de Hardy-Weinberg (P <0,01) en raison d'un déficit en hétérozygotes. Aucune structuration génétique n'a été observée au sein des populations de dromadaires algériens en utilisant l'approche bayésienne non supervisée et supervisée. Ce type de structuration témoigne d'une faible différenciation et d'un niveau élevé de flux de gènes. On a aussi remarqué que beaucoup de sous-produits de l'élevage ne sont pas valorisés économiquement. Pour ce qui est de la génétique d'autre approche moléculaire plus puissante tel que les SNP chip pourrait nous permettre d'avoir une vue plus claire sur la structure génétique des populations de dromadaire locales. Directeur de thèse : GAOUAR Semir Bechir Suheil Caractérisation zootechnique et génétique des populations de dromadaire dans le sud Algérien [document électronique] / CHERIFI Youcef Amine, Auteur . - 2018-2019 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire et Cellulaire Mots-clés : Dromadaire, microsatellite, structure génétique, Algérie. Résumé : La gestion des ressources génétiques animales est capitale pour le développement des filières de production durables. L'élevage camelin en Algérie est concentré dans trois grandes aires de distribution, arrive à fournir toute une gamme de produits et de services grâce aux facultés d'adaptation qu'a développées le dromadaire dans un milieu où la vie est extrêmement difficile. La caractérisation des ressources génétiques animales révèle un intérêt considérable ces dernières années. Les connaissances sur la diversité génétique et la structuration des populations de dromadaire restent encore fragmentaires, malgré leurs importances socio-économiques dans les régions arides (sud Algérien). L'objectif de cette thèse est de décrire les conditions d'élevage des dromadaires, analyser leur diversité génétique intra et inter populationnel et de mettre en évidence les perspectives d'exploitation et de valorisation de leurs produits dans des systèmes d'élevage durables. Un total de 198 dromadaires provenant de sept zones d'échantillonnages du sud algérien, et représentatif de trois populations tribales (Azawad, Reguibi et Targui) ont été génotypés avec un panel de 20 marqueurs microsatellites. La variabilité intra-populationnel a été quantifié par le calcul du nombre d'allèles, les taux d'hétérozygotie observés et théoriques. Les résultats obtenus ont montré que le système d'élevage et les pratiques exercées sont archaïques. Tous les marqueurs microsatellites utilisés étaient fortement polymorphes à l'exception du marqueur (CMS17) et présentaient une moyenne de 8,53 ± 5,34 allèles, allant de 2 (YWLL59, CVRL8, VOLP32) à 23 (CVRL1D). Avec une moyenne du taux d'hétérozygotie de 0,64 ± 0,19. Quatre loci (CMS121, CMS9, VOLP10 et CMS32) ont dévié significativement de l'équilibre de Hardy-Weinberg (P <0,01) en raison d'un déficit en hétérozygotes. Aucune structuration génétique n'a été observée au sein des populations de dromadaires algériens en utilisant l'approche bayésienne non supervisée et supervisée. Ce type de structuration témoigne d'une faible différenciation et d'un niveau élevé de flux de gènes. On a aussi remarqué que beaucoup de sous-produits de l'élevage ne sont pas valorisés économiquement. Pour ce qui est de la génétique d'autre approche moléculaire plus puissante tel que les SNP chip pourrait nous permettre d'avoir une vue plus claire sur la structure génétique des populations de dromadaire locales. Directeur de thèse : GAOUAR Semir Bechir Suheil

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