Caractérisation de variants génomiques spécifiques de la Spondylarthrite Ankylosante dans la population Algérienne - comparaison avec la Polyarthrite Rhumatoïde, parallèle avec d'autres populations. / AZZOUNE Asmaa 

Public ISBD Titre : Caractérisation de variants génomiques spécifiques de la Spondylarthrite Ankylosante dans la population Algérienne - comparaison avec la Polyarthrite Rhumatoïde, parallèle avec d'autres populations. Type de document : texte imprimé Auteurs : AZZOUNE Asmaa, Auteur Année de publication : 2022-2023 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : Spondylarthrite ankylosante, ERAP1, IL23R, CTLA-4, SNPs, Haplotypes, Ouest Algérien Ankylosing spondylitis, ERAP1, IL23R, CTLA-4, SNPs, Haplotype, West Algeria. Résumé : La Spondylarthrite ankylosante (SA) est une pathologie multifactorielle avec une importante composante génétique. Bien que l’association avec HLA-B27 est bien décrite dans le monde, de nombreux autres gènes de susceptibilité ont été identifiés. L’objectif de ce travail était de rechercher les associations entre la SA et les polymorphismes ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T), IL23R rs11209026 (G>A) et CTLA4 rs231775 (+49) (A>G). Cette étude a été réalisée sur des échantillons composés de 81 patients atteints de la SA et 116 témoins non apparentés et originaires de l’Ouest Algérien. Le génotypage a été réalisé par discrimination allélique en temps réel (TaqMan). La comparaison des fréquences génotypiques et alléliques entre les deux groupes cas et témoins a été établie par un test de Chi2 d’homogénéité. Nos résultats ont montré une absence d’association entre les polymorphismes ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T) et la survenue de la SA. Cependant, après stratification selon le genre, le polymorphisme ERAP1 rs30187 (C>T) semble réduire le risque de développer la SA dans le groupe de femmes. Par ailleurs, les distributions des génotypes et des allèles montrent que le SNP IL23R rs11209026 (G>A) semble être associé à la susceptibilité de développer la SA dans la population Algérienne. Enfin l'haplotype CTLA-4 (+49) /CT60-GG semble être associé à la survenue de la SA. Cette étude suggère également que le polymorphisme IL23R rs11209026 (G>A) confère un effet de prédisposition par rapport à la SA. Par ailleurs, l’étude haplotypique a indiqué que le polymorphisme CTLA4 (+49) (A>G) aurait un effet dépendent du polymorphisme CTLA4 CT60 dans le développement de la maladie. Ankylosing spondylitis (AS) is a complex multifactorial pathology with a genetic component. Although the association with the HLA-B27 system is well described worldwide, many other susceptibility genes have recently been identified. The aim of this work was to investigate associations between candidate genes and susceptibility to AS. We looked for this association with the polymorphisms [ERAP1] rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T), IL23R rs11209026 (G>A) and CTLA4 rs231775 (+49) (A>G) and AS. This study was carried out on samples composed of 81 patients with AS and 116 unrelated controls from Western Algeria. Genotyping was performed by real-time allelic discrimination (TaqMan). The comparison of genotypic and allelic frequencies between the two case and control groups was established by chi-square. Our results showed an absence of association between the polymorphisms ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T) and the occurrence of AS. However, after stratification according to gender and age, the polymorphism ERAP1 rs30187 (C>T) seems to reduce the risk of developing AS in the group of women. Furthermore, the distributions of genotypes and alleles show that the SNP IL23R rs11209026 (G>A) seems to be associated with the susceptibility of developing AS in the Algerian population. Finally, the CTLA-4 (+49)/CT60- GG haplotype seems to be associated with the occurrence of AS. In conclusion, this study suggests that the polymorphism IL23R rs11209026 (G>A) predispose on the onset of AS. On the other hand, the haplotype study suggests that the polymorphism CTLA4 (+49) (A>G) would have an effect dependent on the polymorphism CTLA4 CT60 in the genetics of AS. Directeur de thèse : BOUDJEMA Abdallah Caractérisation de variants génomiques spécifiques de la Spondylarthrite Ankylosante dans la population Algérienne - comparaison avec la Polyarthrite Rhumatoïde, parallèle avec d'autres populations. [texte imprimé] / AZZOUNE Asmaa, Auteur . - 2022-2023 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : Spondylarthrite ankylosante, ERAP1, IL23R, CTLA-4, SNPs, Haplotypes, Ouest Algérien Ankylosing spondylitis, ERAP1, IL23R, CTLA-4, SNPs, Haplotype, West Algeria. Résumé : La Spondylarthrite ankylosante (SA) est une pathologie multifactorielle avec une importante composante génétique. Bien que l’association avec HLA-B27 est bien décrite dans le monde, de nombreux autres gènes de susceptibilité ont été identifiés. L’objectif de ce travail était de rechercher les associations entre la SA et les polymorphismes ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T), IL23R rs11209026 (G>A) et CTLA4 rs231775 (+49) (A>G). Cette étude a été réalisée sur des échantillons composés de 81 patients atteints de la SA et 116 témoins non apparentés et originaires de l’Ouest Algérien. Le génotypage a été réalisé par discrimination allélique en temps réel (TaqMan). La comparaison des fréquences génotypiques et alléliques entre les deux groupes cas et témoins a été établie par un test de Chi2 d’homogénéité. Nos résultats ont montré une absence d’association entre les polymorphismes ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T) et la survenue de la SA. Cependant, après stratification selon le genre, le polymorphisme ERAP1 rs30187 (C>T) semble réduire le risque de développer la SA dans le groupe de femmes. Par ailleurs, les distributions des génotypes et des allèles montrent que le SNP IL23R rs11209026 (G>A) semble être associé à la susceptibilité de développer la SA dans la population Algérienne. Enfin l'haplotype CTLA-4 (+49) /CT60-GG semble être associé à la survenue de la SA. Cette étude suggère également que le polymorphisme IL23R rs11209026 (G>A) confère un effet de prédisposition par rapport à la SA. Par ailleurs, l’étude haplotypique a indiqué que le polymorphisme CTLA4 (+49) (A>G) aurait un effet dépendent du polymorphisme CTLA4 CT60 dans le développement de la maladie. Ankylosing spondylitis (AS) is a complex multifactorial pathology with a genetic component. Although the association with the HLA-B27 system is well described worldwide, many other susceptibility genes have recently been identified. The aim of this work was to investigate associations between candidate genes and susceptibility to AS. We looked for this association with the polymorphisms [ERAP1] rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T), IL23R rs11209026 (G>A) and CTLA4 rs231775 (+49) (A>G) and AS. This study was carried out on samples composed of 81 patients with AS and 116 unrelated controls from Western Algeria. Genotyping was performed by real-time allelic discrimination (TaqMan). The comparison of genotypic and allelic frequencies between the two case and control groups was established by chi-square. Our results showed an absence of association between the polymorphisms ERAP1 rs30187 (C>T) & rs10050860 (C>T) and the occurrence of AS. However, after stratification according to gender and age, the polymorphism ERAP1 rs30187 (C>T) seems to reduce the risk of developing AS in the group of women. Furthermore, the distributions of genotypes and alleles show that the SNP IL23R rs11209026 (G>A) seems to be associated with the susceptibility of developing AS in the Algerian population. Finally, the CTLA-4 (+49)/CT60- GG haplotype seems to be associated with the occurrence of AS. In conclusion, this study suggests that the polymorphism IL23R rs11209026 (G>A) predispose on the onset of AS. On the other hand, the haplotype study suggests that the polymorphism CTLA4 (+49) (A>G) would have an effect dependent on the polymorphism CTLA4 CT60 in the genetics of AS. Directeur de thèse : BOUDJEMA Abdallah

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Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne / ABID Ghania 

Public ISBD Titre : Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne Type de document : texte imprimé Auteurs : ABID Ghania, Auteur Année de publication : 2022-2023 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : DMLA néovasculaire, polymorphismes, PCR-RFLP, TaqMan, Population Algérienne. Neovascular AMD, polymorphisms, PCR-RFLP, TaqMan, Algerian population. Résumé : nAMD is a degenerative macular disease that leads to a progressive decline in vision and then to a loss of central vision. It is a complex pathology which results from the interaction of various environmental factors on a predisposing genetic ground. The objective of our study was first to study the impact of certain environmental factors on the predisposition to the development of nAMD and then we were interested in the search for an association between four SNP polymorphisms located on 3 different genes [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and the ARMS2 gene rs3750846 (T>C) and rs10490924 (T>G) and two insertion/deletion (I/D) polymorphisms in two different genes (ACE rs4340 and VEGF rs35569394) and the risk of AMD development. All of these factors were explored using Cox regression analysis to take into account the impact of these factors on the age of onset of the disease. Finally, we are also interested in studying the impact of the ARMS2 gene haplotype on the onset of this disease. The present study was performed on two samples, 72 patients with AMDn and 124 controls, all from Algeria. Genotyping was performed by the real-time allelic discrimination technique (TaqMan) for the exploration of the SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and ARMS2 rs3750846 (T>C). In addition, we used multiplex PCR for genotyping the [ACE] rs4340 polymorphism and standard PCR for the VEGF rs35569394 (I/D) polymorphism. Finally, the rs10490924 (T>G) polymorphism of the ARMS2 gene was explored by PCRRFLP. Statistical analyses were performed by SPSS 1.0 Our results showed, on the one hand, that there is an association between environmental risk factors such as age, iris color, smoking, alcohol consumption, sun exposure, hypertension and hyperlipidemia with the development of AMD. Moreover, we demonstrated that the thyroid is associated not only with the development of AMDn, but also, they accelerated the onset of AMDn in subjects with this disease. On the other hand, we confirmed the association between the [CX3CR1] rs3732378 (G>A) polymorphism and the occurrence of AMDn in the Algerian population. Thus, after stratification according to age and sex, the AA genotype of this polymorphism was associated with AMDn in the female group. On the other hand, our study showed that the I/D polymorphism of the VEGF gene seems to be associated with the occurrence of AMDn in the group of subjects with more than 60 years. In conclusion, it would be necessary to confirm our results on a larger sample and to explore other polymorphisms of new candidate genes. La DMLA néovasculaire (DMLAn) est une atteinte maculaire dégénérative qui conduit à une baisse progressive de la vision, puis à une perte de la vision centrale. C’est une pathologie complexe qui résulte de l’interaction de différents facteurs environnementaux sur un terrain génétique prédisposant. L’objectif de notre étude a été tout d’abord d’étudier l’impact de certains facteurs environnementaux sur la prédisposition au développement de la DMLAn et par la suite, nous nous sommes intéressés à la recherche d’une association entre quatre polymorphismes de type SNP situés sur 3 gènes différents [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et le gène ARMS2 rs3750846 (T>C) et rs10490924 (T>G) et de deux polymorphismes de type insertion/délétion (I/D) dans deux gènes différents (ACE rs4340 et VEGF rs35569394) et le risque du développement de la DMLAn. L’ensemble de ces facteurs ont été par la suite exploré à l'aide de l'analyse de régression de Cox afin de prendre en compte l’impact de ces facteurs sur l’âge de l’apparition de la maladie. En fin, nous nous sommes intéressé à étudier l’impact de l’haplotype [rs10490924-rs3750846] du gène ARMS2 sur la survenue de cette maladie. La présente étude a été réalisée sur deux échantillons, 72 patients atteints de la DMLAn et124 contrôles, tous originaire de l’Algérie. Le génotypage a été réalisé par la technique de discrimination allélique en temps réel (TaqMan) pour l’exploration des SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et ARMS2 rs3750846 (T>C). Par ailleurs, nous avons utilisé la technique de la PCR multiplex pour le génotypage du polymorphisme [ACE] rs4340 et la PCR standard pour le polymorphisme VEGF rs35569394 (I/D). Enfin, le polymorphisme rs10490924 (T>G) du gène ARMS2 été exploré par la technique de PCRRFLP. Les analyses statistiques ont été effectuées par SPSS 1.0 Nos résultats ont montré, d’une part, qu’il existerait une association entre les facteurs de risques environnementaux tels que l’âge, la couleur de l’iris, la consommation de tabac, d’alcool, l’exposition au soleil, l’hypertension et l’hyperlipidémie avec le développement de la DMLAn. De plus, nous avons démontré que la thyroïde est associée non seulement au développement de la DMLAn, mais aussi, elles accéléraient l'apparition de la DMLAn chez les sujets atteints de cette maladie. D’autre part, nous avons confirmé l’association entre le polymorphisme [CX3CR1] rs3732378 (G>A) et la survenue de la DMLAn dans la population Algérienne. Ainsi, après stratification selon l’âge et le sexe, le génotype AA de ce polymorphisme a été associé à la DMLAn dans le groupe de femmes. Par ailleurs, notre étude a montré que le polymorphisme I/D du gène VEGF semble être associé à la survenue de la DMLAn dans le groupe des sujets avec plus de 60 ans. En conclusion, il serait nécessaire de confirmer nos résultats sur un échantillon plus large et d’explorer d’autres polymorphismes de nouveaux gènes candidats. Directeur de thèse : MESSAL DJELTI Ahlam Nora Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne [texte imprimé] / ABID Ghania, Auteur . - 2022-2023 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : DMLA néovasculaire, polymorphismes, PCR-RFLP, TaqMan, Population Algérienne. Neovascular AMD, polymorphisms, PCR-RFLP, TaqMan, Algerian population. Résumé : nAMD is a degenerative macular disease that leads to a progressive decline in vision and then to a loss of central vision. It is a complex pathology which results from the interaction of various environmental factors on a predisposing genetic ground. The objective of our study was first to study the impact of certain environmental factors on the predisposition to the development of nAMD and then we were interested in the search for an association between four SNP polymorphisms located on 3 different genes [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and the ARMS2 gene rs3750846 (T>C) and rs10490924 (T>G) and two insertion/deletion (I/D) polymorphisms in two different genes (ACE rs4340 and VEGF rs35569394) and the risk of AMD development. All of these factors were explored using Cox regression analysis to take into account the impact of these factors on the age of onset of the disease. Finally, we are also interested in studying the impact of the ARMS2 gene haplotype on the onset of this disease. The present study was performed on two samples, 72 patients with AMDn and 124 controls, all from Algeria. Genotyping was performed by the real-time allelic discrimination technique (TaqMan) for the exploration of the SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and ARMS2 rs3750846 (T>C). In addition, we used multiplex PCR for genotyping the [ACE] rs4340 polymorphism and standard PCR for the VEGF rs35569394 (I/D) polymorphism. Finally, the rs10490924 (T>G) polymorphism of the ARMS2 gene was explored by PCRRFLP. Statistical analyses were performed by SPSS 1.0 Our results showed, on the one hand, that there is an association between environmental risk factors such as age, iris color, smoking, alcohol consumption, sun exposure, hypertension and hyperlipidemia with the development of AMD. Moreover, we demonstrated that the thyroid is associated not only with the development of AMDn, but also, they accelerated the onset of AMDn in subjects with this disease. On the other hand, we confirmed the association between the [CX3CR1] rs3732378 (G>A) polymorphism and the occurrence of AMDn in the Algerian population. Thus, after stratification according to age and sex, the AA genotype of this polymorphism was associated with AMDn in the female group. On the other hand, our study showed that the I/D polymorphism of the VEGF gene seems to be associated with the occurrence of AMDn in the group of subjects with more than 60 years. In conclusion, it would be necessary to confirm our results on a larger sample and to explore other polymorphisms of new candidate genes. La DMLA néovasculaire (DMLAn) est une atteinte maculaire dégénérative qui conduit à une baisse progressive de la vision, puis à une perte de la vision centrale. C’est une pathologie complexe qui résulte de l’interaction de différents facteurs environnementaux sur un terrain génétique prédisposant. L’objectif de notre étude a été tout d’abord d’étudier l’impact de certains facteurs environnementaux sur la prédisposition au développement de la DMLAn et par la suite, nous nous sommes intéressés à la recherche d’une association entre quatre polymorphismes de type SNP situés sur 3 gènes différents [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et le gène ARMS2 rs3750846 (T>C) et rs10490924 (T>G) et de deux polymorphismes de type insertion/délétion (I/D) dans deux gènes différents (ACE rs4340 et VEGF rs35569394) et le risque du développement de la DMLAn. L’ensemble de ces facteurs ont été par la suite exploré à l'aide de l'analyse de régression de Cox afin de prendre en compte l’impact de ces facteurs sur l’âge de l’apparition de la maladie. En fin, nous nous sommes intéressé à étudier l’impact de l’haplotype [rs10490924-rs3750846] du gène ARMS2 sur la survenue de cette maladie. La présente étude a été réalisée sur deux échantillons, 72 patients atteints de la DMLAn et124 contrôles, tous originaire de l’Algérie. Le génotypage a été réalisé par la technique de discrimination allélique en temps réel (TaqMan) pour l’exploration des SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et ARMS2 rs3750846 (T>C). Par ailleurs, nous avons utilisé la technique de la PCR multiplex pour le génotypage du polymorphisme [ACE] rs4340 et la PCR standard pour le polymorphisme VEGF rs35569394 (I/D). Enfin, le polymorphisme rs10490924 (T>G) du gène ARMS2 été exploré par la technique de PCRRFLP. Les analyses statistiques ont été effectuées par SPSS 1.0 Nos résultats ont montré, d’une part, qu’il existerait une association entre les facteurs de risques environnementaux tels que l’âge, la couleur de l’iris, la consommation de tabac, d’alcool, l’exposition au soleil, l’hypertension et l’hyperlipidémie avec le développement de la DMLAn. De plus, nous avons démontré que la thyroïde est associée non seulement au développement de la DMLAn, mais aussi, elles accéléraient l'apparition de la DMLAn chez les sujets atteints de cette maladie. D’autre part, nous avons confirmé l’association entre le polymorphisme [CX3CR1] rs3732378 (G>A) et la survenue de la DMLAn dans la population Algérienne. Ainsi, après stratification selon l’âge et le sexe, le génotype AA de ce polymorphisme a été associé à la DMLAn dans le groupe de femmes. Par ailleurs, notre étude a montré que le polymorphisme I/D du gène VEGF semble être associé à la survenue de la DMLAn dans le groupe des sujets avec plus de 60 ans. En conclusion, il serait nécessaire de confirmer nos résultats sur un échantillon plus large et d’explorer d’autres polymorphismes de nouveaux gènes candidats. Directeur de thèse : MESSAL DJELTI Ahlam Nora

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Typologie et caractérisation des populations de poules locales dans le Sud-Ouest algérien / BOUDALI Selma Farah 

Public ISBD Titre : Typologie et caractérisation des populations de poules locales dans le Sud-Ouest algérien Type de document : document électronique Auteurs : BOUDALI Selma Farah, Auteur Année de publication : 2020-2021 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire Mots-clés : ADN mitochondrial, caractérisation phénotypique, caractérisation moléculaire, diversité génétique, extraction d’ADN, poules locales. Résumé : Le but de ce travail est de contribuer à la caractérisation phénotypique et moléculaire des populations de poules locales algériennes ainsi que de clarifier leur origine maternelle et leurs voies de dispersion. D’après nos enquêtes sur le terrain réalisées dans trois wilayas du Sud-Ouest algérien, les femmes sont en majeur partie responsables des élevages de poulets en milieu rural (56 %) et elles sont presque toutes illettrées. Ces femmes utilisent le maigre revenu des ventes d’œufs et d’oiseaux pour subvenir aux besoins de leurs familles. Une grande diversité phénotypique a été observée chez les 83 poules locales échantillonnées. Les mensurations corporelles étudiées confirment le dimorphisme sexuel en faveur des mâles. La valeur moyenne du poids corporel est significativement plus élevée chez les coqs (1462 g) que chez les poules (1159 g). Par la suite, une étude d’optimisation du protocole d’extraction de l’ADN génomique par la technique de NaCl (Salting out) à partir du sang de volailles a été réalisée dans le but d’une amélioration de la qualité et la quantité de l’ADN extrait. Le nouveau protocole proposé permet d’avoir une plus grande quantité d’ADN avec une meilleure pureté et ceci à partir d’un plus petit volume de sang et est applicable pour les différentes espèces de volailles. Afin d’approfondir les connaissances sur la diversité génétique du poulet domestique algérien, une étude moléculaire a été réalisée sur 88 poulets locaux appartenant à 5 wilayas de l’Ouest de l’Algérie qui représentent 5 zones agro-écologiques : Littoral (LT), plaines intérieures (PI), hauts plateaux (HP), montagnes (MT) et le Sahara (SH, y compris les régions des Oasis, Req et Erg). L’analyse de la région hypervariable (HV1) de l’ADN mitochondrial a été réalisée afin d’étudier l’origine maternelle de ces oiseaux. Au total, 20 sites variables définissant 13 haplotypes ont été identifiés chez la poule locale d’Algérie. La diversité des haplotypes et des nucléotides a été estimée à 0,597 et 0,003 respectivement. Les résultats d’analyses phylogénétiques indiquent la présence de deux clades (A et E) et suggèrent que les poulets algériens dérivent de l'haplogroupe le plus répandu qui a sa racine dans le sous-continent Indien. Nos résultats fournissent des informations importantes sur l'origine du poulet du Nord-Ouest de l’Afrique et la dispersion historique des premières populations de poules sur le continent Africain. Ces résultats nous permettent d’établir un programme de gestion et d’amélioration des ressources génétiques efficace pour les poules locales algériennes et de ce fait de meilleure application économique. Directeur de thèse : GAOUAR Samir Bachir Souheil Typologie et caractérisation des populations de poules locales dans le Sud-Ouest algérien [document électronique] / BOUDALI Selma Farah, Auteur . - 2020-2021 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biologie Génétique Moléculaire Mots-clés : ADN mitochondrial, caractérisation phénotypique, caractérisation moléculaire, diversité génétique, extraction d’ADN, poules locales. Résumé : Le but de ce travail est de contribuer à la caractérisation phénotypique et moléculaire des populations de poules locales algériennes ainsi que de clarifier leur origine maternelle et leurs voies de dispersion. D’après nos enquêtes sur le terrain réalisées dans trois wilayas du Sud-Ouest algérien, les femmes sont en majeur partie responsables des élevages de poulets en milieu rural (56 %) et elles sont presque toutes illettrées. Ces femmes utilisent le maigre revenu des ventes d’œufs et d’oiseaux pour subvenir aux besoins de leurs familles. Une grande diversité phénotypique a été observée chez les 83 poules locales échantillonnées. Les mensurations corporelles étudiées confirment le dimorphisme sexuel en faveur des mâles. La valeur moyenne du poids corporel est significativement plus élevée chez les coqs (1462 g) que chez les poules (1159 g). Par la suite, une étude d’optimisation du protocole d’extraction de l’ADN génomique par la technique de NaCl (Salting out) à partir du sang de volailles a été réalisée dans le but d’une amélioration de la qualité et la quantité de l’ADN extrait. Le nouveau protocole proposé permet d’avoir une plus grande quantité d’ADN avec une meilleure pureté et ceci à partir d’un plus petit volume de sang et est applicable pour les différentes espèces de volailles. Afin d’approfondir les connaissances sur la diversité génétique du poulet domestique algérien, une étude moléculaire a été réalisée sur 88 poulets locaux appartenant à 5 wilayas de l’Ouest de l’Algérie qui représentent 5 zones agro-écologiques : Littoral (LT), plaines intérieures (PI), hauts plateaux (HP), montagnes (MT) et le Sahara (SH, y compris les régions des Oasis, Req et Erg). L’analyse de la région hypervariable (HV1) de l’ADN mitochondrial a été réalisée afin d’étudier l’origine maternelle de ces oiseaux. Au total, 20 sites variables définissant 13 haplotypes ont été identifiés chez la poule locale d’Algérie. La diversité des haplotypes et des nucléotides a été estimée à 0,597 et 0,003 respectivement. Les résultats d’analyses phylogénétiques indiquent la présence de deux clades (A et E) et suggèrent que les poulets algériens dérivent de l'haplogroupe le plus répandu qui a sa racine dans le sous-continent Indien. Nos résultats fournissent des informations importantes sur l'origine du poulet du Nord-Ouest de l’Afrique et la dispersion historique des premières populations de poules sur le continent Africain. Ces résultats nous permettent d’établir un programme de gestion et d’amélioration des ressources génétiques efficace pour les poules locales algériennes et de ce fait de meilleure application économique. Directeur de thèse : GAOUAR Samir Bachir Souheil

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