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Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne / ABID Ghania
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Titre : Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne Type de document : texte imprimé Auteurs : ABID Ghania, Auteur Année de publication : 2022-2023 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : DMLA néovasculaire, polymorphismes, PCR-RFLP, TaqMan, Population Algérienne.
Neovascular AMD, polymorphisms, PCR-RFLP, TaqMan, Algerian population.Résumé :
nAMD is a degenerative macular disease that leads to a progressive decline in vision and then
to a loss of central vision. It is a complex pathology which results from the interaction of
various environmental factors on a predisposing genetic ground.
The objective of our study was first to study the impact of certain environmental factors on
the predisposition to the development of nAMD and then we were interested in the search for
an association between four SNP polymorphisms located on 3 different genes [CFI]
rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and the ARMS2 gene rs3750846 (T>C) and
rs10490924 (T>G) and two insertion/deletion (I/D) polymorphisms in two different genes
(ACE rs4340 and VEGF rs35569394) and the risk of AMD development. All of these factors
were explored using Cox regression analysis to take into account the impact of these factors
on the age of onset of the disease. Finally, we are also interested in studying the impact of the
ARMS2 gene haplotype on the onset of this disease.
The present study was performed on two samples, 72 patients with AMDn and 124 controls,
all from Algeria. Genotyping was performed by the real-time allelic discrimination technique
(TaqMan) for the exploration of the SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378
and ARMS2 rs3750846 (T>C). In addition, we used multiplex PCR for genotyping the [ACE]
rs4340 polymorphism and standard PCR for the VEGF rs35569394 (I/D) polymorphism.
Finally, the rs10490924 (T>G) polymorphism of the ARMS2 gene was explored by PCRRFLP. Statistical analyses were performed by SPSS 1.0
Our results showed, on the one hand, that there is an association between environmental risk
factors such as age, iris color, smoking, alcohol consumption, sun exposure, hypertension and
hyperlipidemia with the development of AMD. Moreover, we demonstrated that the thyroid is
associated not only with the development of AMDn, but also, they accelerated the onset of
AMDn in subjects with this disease. On the other hand, we confirmed the association between
the [CX3CR1] rs3732378 (G>A) polymorphism and the occurrence of AMDn in the Algerian
population. Thus, after stratification according to age and sex, the AA genotype of this
polymorphism was associated with AMDn in the female group. On the other hand, our study
showed that the I/D polymorphism of the VEGF gene seems to be associated with the
occurrence of AMDn in the group of subjects with more than 60 years.
In conclusion, it would be necessary to confirm our results on a larger sample and to explore
other polymorphisms of new candidate genes.
La DMLA néovasculaire (DMLAn) est une atteinte maculaire dégénérative qui conduit à une
baisse progressive de la vision, puis à une perte de la vision centrale. C’est une pathologie
complexe qui résulte de l’interaction de différents facteurs environnementaux sur un terrain
génétique prédisposant.
L’objectif de notre étude a été tout d’abord d’étudier l’impact de certains facteurs
environnementaux sur la prédisposition au développement de la DMLAn et par la suite, nous
nous sommes intéressés à la recherche d’une association entre quatre polymorphismes de type
SNP situés sur 3 gènes différents [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et le gène
ARMS2 rs3750846 (T>C) et rs10490924 (T>G) et de deux polymorphismes de type
insertion/délétion (I/D) dans deux gènes différents (ACE rs4340 et VEGF rs35569394) et le
risque du développement de la DMLAn. L’ensemble de ces facteurs ont été par la suite
exploré à l'aide de l'analyse de régression de Cox afin de prendre en compte l’impact de ces
facteurs sur l’âge de l’apparition de la maladie. En fin, nous nous sommes intéressé à
étudier l’impact de l’haplotype [rs10490924-rs3750846] du gène ARMS2 sur la
survenue de cette maladie.
La présente étude a été réalisée sur deux échantillons, 72 patients atteints de la DMLAn et124
contrôles, tous originaire de l’Algérie. Le génotypage a été réalisé par la technique de
discrimination allélique en temps réel (TaqMan) pour l’exploration des SNPs [CFI]
rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et ARMS2 rs3750846 (T>C). Par ailleurs, nous
avons utilisé la technique de la PCR multiplex pour le génotypage du polymorphisme [ACE]
rs4340 et la PCR standard pour le polymorphisme VEGF rs35569394 (I/D). Enfin, le
polymorphisme rs10490924 (T>G) du gène ARMS2 été exploré par la technique de PCRRFLP. Les analyses statistiques ont été effectuées par SPSS 1.0
Nos résultats ont montré, d’une part, qu’il existerait une association entre les facteurs de
risques environnementaux tels que l’âge, la couleur de l’iris, la consommation de tabac,
d’alcool, l’exposition au soleil, l’hypertension et l’hyperlipidémie avec le développement de la
DMLAn. De plus, nous avons démontré que la thyroïde est associée non seulement au
développement de la DMLAn, mais aussi, elles accéléraient l'apparition de la DMLAn chez
les sujets atteints de cette maladie. D’autre part, nous avons confirmé l’association entre le
polymorphisme [CX3CR1] rs3732378 (G>A) et la survenue de la DMLAn dans la
population Algérienne. Ainsi, après stratification selon l’âge et le sexe, le génotype AA de ce
polymorphisme a été associé à la DMLAn dans le groupe de femmes. Par ailleurs, notre étude
a montré que le polymorphisme I/D du gène VEGF semble être associé à la survenue de la
DMLAn dans le groupe des sujets avec plus de 60 ans.
En conclusion, il serait nécessaire de confirmer nos résultats sur un échantillon plus large et
d’explorer d’autres polymorphismes de nouveaux gènes candidats.
Directeur de thèse : MESSAL DJELTI Ahlam Nora Etude de la prédisposition génétique au développement de la DMLA dans un échantillon de la population Algérienne [texte imprimé] / ABID Ghania, Auteur . - 2022-2023 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Génétique Moléculaire Mots-clés : DMLA néovasculaire, polymorphismes, PCR-RFLP, TaqMan, Population Algérienne.
Neovascular AMD, polymorphisms, PCR-RFLP, TaqMan, Algerian population.Résumé :
nAMD is a degenerative macular disease that leads to a progressive decline in vision and then
to a loss of central vision. It is a complex pathology which results from the interaction of
various environmental factors on a predisposing genetic ground.
The objective of our study was first to study the impact of certain environmental factors on
the predisposition to the development of nAMD and then we were interested in the search for
an association between four SNP polymorphisms located on 3 different genes [CFI]
rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 and the ARMS2 gene rs3750846 (T>C) and
rs10490924 (T>G) and two insertion/deletion (I/D) polymorphisms in two different genes
(ACE rs4340 and VEGF rs35569394) and the risk of AMD development. All of these factors
were explored using Cox regression analysis to take into account the impact of these factors
on the age of onset of the disease. Finally, we are also interested in studying the impact of the
ARMS2 gene haplotype on the onset of this disease.
The present study was performed on two samples, 72 patients with AMDn and 124 controls,
all from Algeria. Genotyping was performed by the real-time allelic discrimination technique
(TaqMan) for the exploration of the SNPs [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378
and ARMS2 rs3750846 (T>C). In addition, we used multiplex PCR for genotyping the [ACE]
rs4340 polymorphism and standard PCR for the VEGF rs35569394 (I/D) polymorphism.
Finally, the rs10490924 (T>G) polymorphism of the ARMS2 gene was explored by PCRRFLP. Statistical analyses were performed by SPSS 1.0
Our results showed, on the one hand, that there is an association between environmental risk
factors such as age, iris color, smoking, alcohol consumption, sun exposure, hypertension and
hyperlipidemia with the development of AMD. Moreover, we demonstrated that the thyroid is
associated not only with the development of AMDn, but also, they accelerated the onset of
AMDn in subjects with this disease. On the other hand, we confirmed the association between
the [CX3CR1] rs3732378 (G>A) polymorphism and the occurrence of AMDn in the Algerian
population. Thus, after stratification according to age and sex, the AA genotype of this
polymorphism was associated with AMDn in the female group. On the other hand, our study
showed that the I/D polymorphism of the VEGF gene seems to be associated with the
occurrence of AMDn in the group of subjects with more than 60 years.
In conclusion, it would be necessary to confirm our results on a larger sample and to explore
other polymorphisms of new candidate genes.
La DMLA néovasculaire (DMLAn) est une atteinte maculaire dégénérative qui conduit à une
baisse progressive de la vision, puis à une perte de la vision centrale. C’est une pathologie
complexe qui résulte de l’interaction de différents facteurs environnementaux sur un terrain
génétique prédisposant.
L’objectif de notre étude a été tout d’abord d’étudier l’impact de certains facteurs
environnementaux sur la prédisposition au développement de la DMLAn et par la suite, nous
nous sommes intéressés à la recherche d’une association entre quatre polymorphismes de type
SNP situés sur 3 gènes différents [CFI] rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et le gène
ARMS2 rs3750846 (T>C) et rs10490924 (T>G) et de deux polymorphismes de type
insertion/délétion (I/D) dans deux gènes différents (ACE rs4340 et VEGF rs35569394) et le
risque du développement de la DMLAn. L’ensemble de ces facteurs ont été par la suite
exploré à l'aide de l'analyse de régression de Cox afin de prendre en compte l’impact de ces
facteurs sur l’âge de l’apparition de la maladie. En fin, nous nous sommes intéressé à
étudier l’impact de l’haplotype [rs10490924-rs3750846] du gène ARMS2 sur la
survenue de cette maladie.
La présente étude a été réalisée sur deux échantillons, 72 patients atteints de la DMLAn et124
contrôles, tous originaire de l’Algérie. Le génotypage a été réalisé par la technique de
discrimination allélique en temps réel (TaqMan) pour l’exploration des SNPs [CFI]
rs10033900 (T>C), [CX3CR1] rs3732378 et ARMS2 rs3750846 (T>C). Par ailleurs, nous
avons utilisé la technique de la PCR multiplex pour le génotypage du polymorphisme [ACE]
rs4340 et la PCR standard pour le polymorphisme VEGF rs35569394 (I/D). Enfin, le
polymorphisme rs10490924 (T>G) du gène ARMS2 été exploré par la technique de PCRRFLP. Les analyses statistiques ont été effectuées par SPSS 1.0
Nos résultats ont montré, d’une part, qu’il existerait une association entre les facteurs de
risques environnementaux tels que l’âge, la couleur de l’iris, la consommation de tabac,
d’alcool, l’exposition au soleil, l’hypertension et l’hyperlipidémie avec le développement de la
DMLAn. De plus, nous avons démontré que la thyroïde est associée non seulement au
développement de la DMLAn, mais aussi, elles accéléraient l'apparition de la DMLAn chez
les sujets atteints de cette maladie. D’autre part, nous avons confirmé l’association entre le
polymorphisme [CX3CR1] rs3732378 (G>A) et la survenue de la DMLAn dans la
population Algérienne. Ainsi, après stratification selon l’âge et le sexe, le génotype AA de ce
polymorphisme a été associé à la DMLAn dans le groupe de femmes. Par ailleurs, notre étude
a montré que le polymorphisme I/D du gène VEGF semble être associé à la survenue de la
DMLAn dans le groupe des sujets avec plus de 60 ans.
En conclusion, il serait nécessaire de confirmer nos résultats sur un échantillon plus large et
d’explorer d’autres polymorphismes de nouveaux gènes candidats.
Directeur de thèse : MESSAL DJELTI Ahlam Nora Exemplaires
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