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Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. / Wahiba HAMZI
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Titre : Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. Type de document : document électronique Auteurs : Wahiba HAMZI, Auteur Année de publication : 16-12-2020 Importance : 156 p. Présentation : ill. Format : A4 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Index. décimale : Biologie Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. [document électronique] / Wahiba HAMZI, Auteur . - 16-12-2020 . - 156 p. : ill. ; A4 + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Index. décimale : Biologie Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 34118 02-34-118 Version numérique et papier Bibliothèque USTOMB Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale.Adobe Acrobat PDFEtude de profil de sensibilisation et du lien avec lespolymorphismes des genes candidats de la réponse immune immédiate de l'allergie aux protéines du lait de vache chez la population pédiatrique de l'Ouest Algérien. / Rahmoune Nesrine
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Titre : Etude de profil de sensibilisation et du lien avec lespolymorphismes des genes candidats de la réponse immune immédiate de l'allergie aux protéines du lait de vache chez la population pédiatrique de l'Ouest Algérien. Type de document : document électronique Auteurs : Rahmoune Nesrine, Auteur Année de publication : 2017-2018 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Génétique moléculaire et cellulaire. Mots-clés : APLV, polymorphismes, IL4, FoxP3, REL. Index. décimale : Biologie Résumé : Résumé
La pathogenèse des allergies aux protéines du lait de vache (APLV) implique des mécanismes immunologiques complexes avec la participation de plusieurs cellules et molécules impliquées dans l'allergie alimentaire. La tolérance aux protéines du lait est généralement atteinte à l'âge de 5 ans mais certaine pourraient persister. Le mécanisme d'action exact par lequel les facteurs génétiques modifient le cours de ces pathologies est encore mal compris. Nous avons utilisés différentes approches moléculaires (immunoenzymatiques et génétiques), dans le but de contribuer à la caractérisation génétique de l’APLV au sein de la population pédiatrique de l’Ouest Algérien.
Ainsi, dans la première partie de notre étude, nous avons analysé les sérums de 58 enfants allergiques aux protéines de lait de vache par dosage Immuno-Enzymatique des IgE spécifiques (IgEs) anti PLV par technique ELISA fluorimétrique. Nous avons remarqué que 50% des cas présentent une forte sensibilisation contre les deux protéines du lactosérum bovin la -lactoglobuline (BLG) et l’-lactalbumine (ALA), et que cette dernière est corrélée avec une clinique sévère de l’APLV.
Dans la seconde partie, nous avons recherché l’association entre trois polymorphismes génétiques sur les gènes de l’interleukine 4 (IL4) (-33 C/T) (rs2070874), FoxP3 (−3279C/A) (rs3761548), REL (+7883G/T) (rs13031237) et le développement de l’APLV, par le biais d’une étude cas/ témoin. Nous avons génotypé 58 sujets (28 témoins sains et 30 cas). Le génotypage a été réalisé par discrimination allélique TaqMan. La comparaison des fréquences alléliques et génotypiques entre les deux groupes a été établi par le calcul de l’Odds ratio (OR) avec un intervalle de confiance de 95%. Aucune différence significative n’a été retrouvé concernant les deux polymorphismes des gènes IL4 (-33 C/T) et FoxP3 (−3279C/A). Cependant notre étude suggère que le polymorphisme du gène REL (+7883G /T) semble être corrélé au risque de développement de l’APLV dans la population pédiatrique de l’Ouest Algérien (p = 0.0001).
En conclusion, l’intérêt certain du dosage des IgE spécifiques anti BLG et anti ALA en vue de sa valeur diagnostique et pronostique, n’est plus a démontré et que le polymorphisme REL (+7883G /T) semble être associé à la survenue de l’APLV. Il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes intervenants dans la réponse allergique ou du mécanisme de tolérance. En outre, il serait important d’augmenter le nombre d’individus étudiés afin de caractériser d’une manière plus précise la composante immunologique et la susceptibilité génétique de l’APLV dans la population pédiatrique Algérienne.
Directeur de thèse : EL MECHERFI Kamel Eddine Etude de profil de sensibilisation et du lien avec lespolymorphismes des genes candidats de la réponse immune immédiate de l'allergie aux protéines du lait de vache chez la population pédiatrique de l'Ouest Algérien. [document électronique] / Rahmoune Nesrine, Auteur . - 2017-2018 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Génétique moléculaire et cellulaire. Mots-clés : APLV, polymorphismes, IL4, FoxP3, REL. Index. décimale : Biologie Résumé : Résumé
La pathogenèse des allergies aux protéines du lait de vache (APLV) implique des mécanismes immunologiques complexes avec la participation de plusieurs cellules et molécules impliquées dans l'allergie alimentaire. La tolérance aux protéines du lait est généralement atteinte à l'âge de 5 ans mais certaine pourraient persister. Le mécanisme d'action exact par lequel les facteurs génétiques modifient le cours de ces pathologies est encore mal compris. Nous avons utilisés différentes approches moléculaires (immunoenzymatiques et génétiques), dans le but de contribuer à la caractérisation génétique de l’APLV au sein de la population pédiatrique de l’Ouest Algérien.
Ainsi, dans la première partie de notre étude, nous avons analysé les sérums de 58 enfants allergiques aux protéines de lait de vache par dosage Immuno-Enzymatique des IgE spécifiques (IgEs) anti PLV par technique ELISA fluorimétrique. Nous avons remarqué que 50% des cas présentent une forte sensibilisation contre les deux protéines du lactosérum bovin la -lactoglobuline (BLG) et l’-lactalbumine (ALA), et que cette dernière est corrélée avec une clinique sévère de l’APLV.
Dans la seconde partie, nous avons recherché l’association entre trois polymorphismes génétiques sur les gènes de l’interleukine 4 (IL4) (-33 C/T) (rs2070874), FoxP3 (−3279C/A) (rs3761548), REL (+7883G/T) (rs13031237) et le développement de l’APLV, par le biais d’une étude cas/ témoin. Nous avons génotypé 58 sujets (28 témoins sains et 30 cas). Le génotypage a été réalisé par discrimination allélique TaqMan. La comparaison des fréquences alléliques et génotypiques entre les deux groupes a été établi par le calcul de l’Odds ratio (OR) avec un intervalle de confiance de 95%. Aucune différence significative n’a été retrouvé concernant les deux polymorphismes des gènes IL4 (-33 C/T) et FoxP3 (−3279C/A). Cependant notre étude suggère que le polymorphisme du gène REL (+7883G /T) semble être corrélé au risque de développement de l’APLV dans la population pédiatrique de l’Ouest Algérien (p = 0.0001).
En conclusion, l’intérêt certain du dosage des IgE spécifiques anti BLG et anti ALA en vue de sa valeur diagnostique et pronostique, n’est plus a démontré et que le polymorphisme REL (+7883G /T) semble être associé à la survenue de l’APLV. Il serait intéressant d’explorer d’autres polymorphismes des gènes intervenants dans la réponse allergique ou du mécanisme de tolérance. En outre, il serait important d’augmenter le nombre d’individus étudiés afin de caractériser d’une manière plus précise la composante immunologique et la susceptibilité génétique de l’APLV dans la population pédiatrique Algérienne.
Directeur de thèse : EL MECHERFI Kamel Eddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 1637 02-34-116 Version numérique et papier Bibliothèque USTOMB Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
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