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Auteur Samira SALAH
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Faire une suggestion Affiner la rechercheÉtude théorique de l’effet de quelques pénicillines sur des bactéries Gram positif et Gram négatif / Samira SALAH
Titre : Étude théorique de l’effet de quelques pénicillines sur des bactéries Gram positif et Gram négatif Type de document : document électronique Auteurs : Samira SALAH, Auteur Année de publication : 2014 Importance : 78 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Cytochimie, Structure, Modélisation et Simulation des Macromolécules à Intérêt Agronomique et Médical Mots-clés : Amoxicilline, PLP (Protéines Liant la Pénicilline), complexe Amoxicilline-enzyme, ADF, Spartan, réactivité.
Amoxicillin, PBP (protein binding penicillin), complex Amoxicillin-enzyme, ADF, Spartan, reactivityRésumé : Afin de rationaliser au mieux l’effet de l’Amoxicilline sur le site actif de l’enzyme PLP de la membrane cytoplasmique bactérienne et voir l’arrangement structural du complexe Amoxicilline-enzyme, nous nous sommes alors naturellement tournés vers les approches de chimie quantique en utilisant différents logiciels (Spartan, ADF). L’intérêt majeur de ce travail a été de permettre la caractérisation des grandeurs électroniques, structurales et énergétiques de l’Amoxicilline et dans un deuxième lieu le complexe Amoxicilline-enzyme.
Cette étude, nous a permis de mieux comprendre la réactivité de l’Amoxicilline et d’affirmer la nécessité de la présence de la sérine au sein du site actif de l’enzyme, de part l’analyse des orbitales moléculaires (HOMO et LUMO), le diagramme orbitalaire, le potentiel électrostatique, le spectre infrarouge et le spectre ultraviolet.
Du fait que les chaines latérales rattachées au noyau modifient les propriétés antibactériennes et pharmacocinétiques, cette étude théorique a permis d’établir une relation structure-activité qui pourrait s’avérer très utile à la mise au point de nouvelles molécules à noyau bêta-lactames présentant un meilleur effet sur les bactéries.
To streamline the effect of Amoxicillin on the active site of the enzyme PBP of bacterial cytoplasmic membrane and see the structural arrangement of Amoxicillin-enzyme complex, we sum then naturally oriented to the quantum chemistry approaches using different software (Spartan ADF). The main interest of this work was to allow the characterization of electronic, structural and energetic quantities of Amoxicillin and the complex Amoxicillin-enzyme.
This study has allowed us to understand the reactivity of Amoxicillin and affirm the necessity of the presence of serine in the active site of the enzyme, from the analysis of the molecular orbital (HOMO and LUMO) the orbital diagram, the electrostatic potential, the infrared spectrum and ultraviolet spectrum.
Because the side chains attached to the core modify antibacterial and pharmacokinetic properties, this theoretical study has allowed to establish a relationship structure-activity which could prove very useful to the development of new molecules with beta-lactam nucleus with better effect on bacteria
Directeur de thèse : TCHOUAR ,Noureddine Étude théorique de l’effet de quelques pénicillines sur des bactéries Gram positif et Gram négatif [document électronique] / Samira SALAH, Auteur . - 2014 . - 78 p. + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Cytochimie, Structure, Modélisation et Simulation des Macromolécules à Intérêt Agronomique et Médical Mots-clés : Amoxicilline, PLP (Protéines Liant la Pénicilline), complexe Amoxicilline-enzyme, ADF, Spartan, réactivité.
Amoxicillin, PBP (protein binding penicillin), complex Amoxicillin-enzyme, ADF, Spartan, reactivityRésumé : Afin de rationaliser au mieux l’effet de l’Amoxicilline sur le site actif de l’enzyme PLP de la membrane cytoplasmique bactérienne et voir l’arrangement structural du complexe Amoxicilline-enzyme, nous nous sommes alors naturellement tournés vers les approches de chimie quantique en utilisant différents logiciels (Spartan, ADF). L’intérêt majeur de ce travail a été de permettre la caractérisation des grandeurs électroniques, structurales et énergétiques de l’Amoxicilline et dans un deuxième lieu le complexe Amoxicilline-enzyme.
Cette étude, nous a permis de mieux comprendre la réactivité de l’Amoxicilline et d’affirmer la nécessité de la présence de la sérine au sein du site actif de l’enzyme, de part l’analyse des orbitales moléculaires (HOMO et LUMO), le diagramme orbitalaire, le potentiel électrostatique, le spectre infrarouge et le spectre ultraviolet.
Du fait que les chaines latérales rattachées au noyau modifient les propriétés antibactériennes et pharmacocinétiques, cette étude théorique a permis d’établir une relation structure-activité qui pourrait s’avérer très utile à la mise au point de nouvelles molécules à noyau bêta-lactames présentant un meilleur effet sur les bactéries.
To streamline the effect of Amoxicillin on the active site of the enzyme PBP of bacterial cytoplasmic membrane and see the structural arrangement of Amoxicillin-enzyme complex, we sum then naturally oriented to the quantum chemistry approaches using different software (Spartan ADF). The main interest of this work was to allow the characterization of electronic, structural and energetic quantities of Amoxicillin and the complex Amoxicillin-enzyme.
This study has allowed us to understand the reactivity of Amoxicillin and affirm the necessity of the presence of serine in the active site of the enzyme, from the analysis of the molecular orbital (HOMO and LUMO) the orbital diagram, the electrostatic potential, the infrared spectrum and ultraviolet spectrum.
Because the side chains attached to the core modify antibacterial and pharmacokinetic properties, this theoretical study has allowed to establish a relationship structure-activity which could prove very useful to the development of new molecules with beta-lactam nucleus with better effect on bacteria
Directeur de thèse : TCHOUAR ,Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 4638 02-34-71 Version numérique et papier Bibliothèque Centrale Mémoire de Magister Exclu du prêt Documents numériques
Étude théorique de l’effet de quelques pénicillines sur des bactéries Gram positif et Gram négatifAdobe Acrobat PDF
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