Thème 4

valorisations des microorganismes à intérêt agro- pastoral et environnemental

Chef  d’équipe Dr. Selami Nawel

Thématique : Identification et caractérisation d’endophytes avec des propriétés de bio-fertilisation  et de bio-contrôle chez les plantes cultivées

Objectifs

Exploiter les avantages naturels que présentent certains microorganismes isolés à partir de fabacées  spontanées des dunes côtières et des régions arides

Méthodologie (i) Isoler un maximum de microorganisme endophytiques à l’aide de plusieurs milieux microbiologiques composés de différentes sources de carbone et ajustés à différents pH à la suite d’une stérilisation de surface. (ii) Identification des différents endophytes isolés via le séquençage et la comparaison des régions de l’ITS de ADNr des bactéries et champignons isolés.  (iii) Évaluer le potentiel agronomique des différents endophytes bactériens par la  détermination de leur capacité à solubiliser le phosphore inorganique, à produire certaines enzymes (chitinase, cellulase et pectinase), leur capacité antifongique, leur résistance aux antibiotiques, leur habilité à recoloniser la plante étudiée et leur effet sur sa croissance.

-Les bactéries endophytes de type Rhizobia : Nutrition azotée -Forte spécificité d’hôte -Organogenèse (Formation de nodules)

-Les bactéries endophytes Non nodulantes : Promotion de la croissance des plantes -Importante diversité d’espèces -Pas d’organogenèse.

1) Facteurs de croissance hormonaux

2) Bio-fertilisation (solubilisation des nutriments, fixation d’azote)

3) Bio-contrôle de pathogènes (production d’antibiotiques, fongicides, insecticides …)

Quelques exemples de propriétés utiles

Exemple de Bio-fertilisation

• Gènes bactérien  de l’opéron Nod
• Organismes : Rhizobium sp, Bradyrhizobium sp. Augmentation du nombre de nodules : Fixation de l’azote

Exemples de Bio-contrôle

• Formation de biofilm
• Contrôle de différents agents pathogène

Résultats attendus

1 –Diversité microbienne

2 –Propriétés bénéfiques

3-constitution d’un souchier de bactéries endophytes

Soutenance de Doctorats et magisters

1-Thèse de doctorat LMD

-Hannane Fatima Zohra 2017- Sélection et caractérisation des souches de rhizobia isolées de Retama monosperma (L.) Boiss. à haute capacité de nodulation. Thèse de doctorat LMD.USTO-MB.Encadreur Pr Kacem Mourad