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Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. / Wahiba HAMZI 

Public ISBD Titre : Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. Type de document : texte imprimé Auteurs : Wahiba HAMZI, Auteur Année de publication : 16-12-2020 Importance : 156 p. Présentation : ill. Format : A4 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche. Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion. Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA. Due to the influenza virus ability to improve resistance to drugs, the development of new antivirals is an important goal of medical science and health care systems. The aim of this thesis is to study the antiviral activity in vitro and in silico of the molecule of Camphor 1,7,7trimethylbicyclo, heptan-2-one. We evaluated the antiviral activity in vitro with three different concentrations, the calculation of the DCIT50 to give the following values 104.83, 104 for the selected concentrations, a low percentage of cytopathogenic effect of 5% revealed the absence of the antiviral effect of Camphor on MDCK cells inoculated with influenza virus (G243 / 12AH1N1pdm09). In order to carry out an in-silico study, we used molecular modeling methods used in our work are: Hartree-Fock and Functional density theory in order to determine the structural, electronic and energy parameters associated with the molecules studied. The nature of the type of substituent influences the electronic and energetic parameters of the Camphor molecule. Indeed, this study allows us to predict the chemical reactivity of camphor derivatives, we have also concluded that the DFT method (B3LYP) with the base 6-311G + (d, p) is the best method to deepen our research.We also performed a structure-activity relationship (SAR) analysis applied to twenty-five symmetrical camphor-based diimine molecules, a multiple linear regression model was used to correlate the relationships between the biological activity of diimine derivatives symmetrical based on camphor, the model prediction is estimated by crossvalidation with the exclusion method. The results we obtained suggest a quantitative structure-activity relationship (QSAR) model based on different descriptors among them molecular volume (MV), energy of hydration (EH) polarizability (POL), molar refractivity (MR ), total energy (Et) for inhibition of influenza virus reproduction in order to confirm the predictive power of the models. The strong correlation between the experimental data and the predicted data was observed, indicating the good quality of the QSAR model. Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. [texte imprimé] / Wahiba HAMZI, Auteur . - 16-12-2020 . - 156 p. : ill. ; A4 + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche. Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion. Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA. Due to the influenza virus ability to improve resistance to drugs, the development of new antivirals is an important goal of medical science and health care systems. The aim of this thesis is to study the antiviral activity in vitro and in silico of the molecule of Camphor 1,7,7trimethylbicyclo, heptan-2-one. We evaluated the antiviral activity in vitro with three different concentrations, the calculation of the DCIT50 to give the following values 104.83, 104 for the selected concentrations, a low percentage of cytopathogenic effect of 5% revealed the absence of the antiviral effect of Camphor on MDCK cells inoculated with influenza virus (G243 / 12AH1N1pdm09). In order to carry out an in-silico study, we used molecular modeling methods used in our work are: Hartree-Fock and Functional density theory in order to determine the structural, electronic and energy parameters associated with the molecules studied. The nature of the type of substituent influences the electronic and energetic parameters of the Camphor molecule. Indeed, this study allows us to predict the chemical reactivity of camphor derivatives, we have also concluded that the DFT method (B3LYP) with the base 6-311G + (d, p) is the best method to deepen our research.We also performed a structure-activity relationship (SAR) analysis applied to twenty-five symmetrical camphor-based diimine molecules, a multiple linear regression model was used to correlate the relationships between the biological activity of diimine derivatives symmetrical based on camphor, the model prediction is estimated by crossvalidation with the exclusion method. The results we obtained suggest a quantitative structure-activity relationship (QSAR) model based on different descriptors among them molecular volume (MV), energy of hydration (EH) polarizability (POL), molar refractivity (MR ), total energy (Et) for inhibition of influenza virus reproduction in order to confirm the predictive power of the models. The strong correlation between the experimental data and the predicted data was observed, indicating the good quality of the QSAR model. Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine

Exemplaires

Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
34118	02-34-118	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

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