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Caractérisation moléculaire et morphologique du figuier (Ficus carica L.) d’Algérie / BENETTAYEB Zine-Eddine
Titre : Caractérisation moléculaire et morphologique du figuier (Ficus carica L.) d’Algérie Type de document : document électronique Auteurs : BENETTAYEB Zine-Eddine, Auteur Année de publication : 2017-2018 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Algeria, characterization, genetic diversity, Ficus carica L., valuation.
Algérie, caractérisation, diversité génétique, Ficus carica L., valorisation.Résumé : The objective of this research is to evaluate the genetic diversity of 73
common fig tree accessions, Ficus carica L. (2n = 26) using five specific microsatellite
markers (MFC2, MFC4, MFC5, MFC7 and MFC8) and 66 international morphological
descriptors (26 quantitative and 40 qualitative). Molecular analysis revealed a number of
alleles per locus of between 2.2 and 3.0 depending on the population, as well as an average
total number per population of 2.64. Two homozygous loci (MFC5 and MFC7) were detected
while the observed average heterozygosity was higher (0.730) than the expected
heterozygosity (0.593). Phylogenetic relationships have divided the five populations into three
groups that are characterized by spatial genetic structuring due to the membership of the
accessions to a common ancestor and their selection from pre-existing plant material. The
analysis of the clustering made it possible to detect several cases of homonymies and
synonymies among the accessions, whose structuring is independent of the type of tree or its
origin but probably the consequence of the human factor. A list of varieties can hardly be
exhaustive, especially since the exchange of plant material from one region to another has
been facilitated through cuttings.
The results of the analysis of variance, at the threshold of 0.0001, revealed that among the
25 quantitative morphological characters studied, only the number of lobes per leaf and the
thickness of the petiole were not significant and not useful for differentiation varietal. Soluble
solids content of between 15.33 - 28.23% is a high quality index for most varieties. The
evaluation of chemical pomological properties revealed an excellent fruit quality and very
good scores in 18 varieties that can thus compete with the best genotypes of fig tree in the
world. Among these varieties, 'Meroudji', 'Chetoui' and 'Harcha' offer new opportunities for
fig producers and need to be planted on a large scale. The varieties 'Enk El H'mam' and
'Ramliya' record the best qualitative performances with respective scores of 824 and 770 and
deserve to be candidates for the labeling.
The molecular and morphological markers used in this study have been shown to be
efficient for genetic polymorphism analysis of fig tree resources. Their conservation will be
used for future research as well as for the establishment of a national database.
La présente recherche a pour objectif l’évaluation de la diversité génétique de
73 accessions de figuier commun, Ficus carica L. (2n = 26) à l’aide de cinq marqueurs
microsatellites spécifiques (MFC2, MFC4, MFC5, MFC7 et MFC8) et de 66 descripteurs
morphologiques internationaux (26 quantitatifs et 40 qualitatifs). L’analyse moléculaire a
révélé un nombre d’allèles par locus compris entre 2,2 et 3,0 selon la population ainsi qu’un
nombre total moyen par population de 2,64. Deux locus homozygotes (MFC5 et MFC7) ont
été détectés alors que l’hétérozygotie moyenne observée est plus élevée (0,730) que
l’hétérozygotie attendue (0,593). Les relations phylogénétiques ont répartit les cinq
populations en trois groupes qui sont caractérisés par une structuration génétique spatiale en
raison de l’appartenance des accessions à un ancêtre commun et à leur sélection à partir d’un
matériel végétal préexistant. L’analyse du regroupement a permis de détecter plusieurs cas
d’homonymies et de synonymies parmi les accessions, dont la structuration est indépendante
du sexe de l’arbre ou de son origine mais probablement la conséquence du facteur humain. Un
listing de variétés peut difficilement être exhaustif, surtout que l’échange du matériel végétal
d’une région à une autre a été facilité grâce au bouturage.
Les résultats de l’analyse de variance ont révélé au seuil de 0,0001 que, parmi les 25
caractères morphologiques quantitatifs étudiés, seuls le nombre de lobes par feuille et
l’épaisseur du pétiole se sont pas significatifs pour la différenciation variétale. L’obtention de
teneurs en extrait sec soluble comprises entre 15,33 et 28,23 % constitue un indice de qualité
élevée chez la plupart des variétés. L’évaluation des propriétés pomologiques chimiques a
révélé une excellente qualité des fruits et de très bons scores chez 18 variétés.Parmi ces
variétés, ‘Meroudji’, ‘Chetoui’ et ‘Harcha’ offrent de nouvelles opportunités aux producteurs
de figues et doivent être plantées à grande échelle. Les variétés ‘Enk El H’mam’ et ‘Ramliya’
enregistrent les meilleures performances qualitatives avec des scores respectifs de 824 et 770
et méritent d’être candidats à la labellisation.
Les marqueurs moléculaires et morphologiques utilisés dans cette étude se sont avérés
efficients pour l’analyse du polymorphisme génétique des ressources du figuier. Leur
conservation servira pour de futurs travaux de recherches ainsi que pour la constitution d’une
base de données nationale.
Directeur de thèse : BENCHEIKH Mohamed Caractérisation moléculaire et morphologique du figuier (Ficus carica L.) d’Algérie [document électronique] / BENETTAYEB Zine-Eddine, Auteur . - 2017-2018 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Algeria, characterization, genetic diversity, Ficus carica L., valuation.
Algérie, caractérisation, diversité génétique, Ficus carica L., valorisation.Résumé : The objective of this research is to evaluate the genetic diversity of 73
common fig tree accessions, Ficus carica L. (2n = 26) using five specific microsatellite
markers (MFC2, MFC4, MFC5, MFC7 and MFC8) and 66 international morphological
descriptors (26 quantitative and 40 qualitative). Molecular analysis revealed a number of
alleles per locus of between 2.2 and 3.0 depending on the population, as well as an average
total number per population of 2.64. Two homozygous loci (MFC5 and MFC7) were detected
while the observed average heterozygosity was higher (0.730) than the expected
heterozygosity (0.593). Phylogenetic relationships have divided the five populations into three
groups that are characterized by spatial genetic structuring due to the membership of the
accessions to a common ancestor and their selection from pre-existing plant material. The
analysis of the clustering made it possible to detect several cases of homonymies and
synonymies among the accessions, whose structuring is independent of the type of tree or its
origin but probably the consequence of the human factor. A list of varieties can hardly be
exhaustive, especially since the exchange of plant material from one region to another has
been facilitated through cuttings.
The results of the analysis of variance, at the threshold of 0.0001, revealed that among the
25 quantitative morphological characters studied, only the number of lobes per leaf and the
thickness of the petiole were not significant and not useful for differentiation varietal. Soluble
solids content of between 15.33 - 28.23% is a high quality index for most varieties. The
evaluation of chemical pomological properties revealed an excellent fruit quality and very
good scores in 18 varieties that can thus compete with the best genotypes of fig tree in the
world. Among these varieties, 'Meroudji', 'Chetoui' and 'Harcha' offer new opportunities for
fig producers and need to be planted on a large scale. The varieties 'Enk El H'mam' and
'Ramliya' record the best qualitative performances with respective scores of 824 and 770 and
deserve to be candidates for the labeling.
The molecular and morphological markers used in this study have been shown to be
efficient for genetic polymorphism analysis of fig tree resources. Their conservation will be
used for future research as well as for the establishment of a national database.
La présente recherche a pour objectif l’évaluation de la diversité génétique de
73 accessions de figuier commun, Ficus carica L. (2n = 26) à l’aide de cinq marqueurs
microsatellites spécifiques (MFC2, MFC4, MFC5, MFC7 et MFC8) et de 66 descripteurs
morphologiques internationaux (26 quantitatifs et 40 qualitatifs). L’analyse moléculaire a
révélé un nombre d’allèles par locus compris entre 2,2 et 3,0 selon la population ainsi qu’un
nombre total moyen par population de 2,64. Deux locus homozygotes (MFC5 et MFC7) ont
été détectés alors que l’hétérozygotie moyenne observée est plus élevée (0,730) que
l’hétérozygotie attendue (0,593). Les relations phylogénétiques ont répartit les cinq
populations en trois groupes qui sont caractérisés par une structuration génétique spatiale en
raison de l’appartenance des accessions à un ancêtre commun et à leur sélection à partir d’un
matériel végétal préexistant. L’analyse du regroupement a permis de détecter plusieurs cas
d’homonymies et de synonymies parmi les accessions, dont la structuration est indépendante
du sexe de l’arbre ou de son origine mais probablement la conséquence du facteur humain. Un
listing de variétés peut difficilement être exhaustif, surtout que l’échange du matériel végétal
d’une région à une autre a été facilité grâce au bouturage.
Les résultats de l’analyse de variance ont révélé au seuil de 0,0001 que, parmi les 25
caractères morphologiques quantitatifs étudiés, seuls le nombre de lobes par feuille et
l’épaisseur du pétiole se sont pas significatifs pour la différenciation variétale. L’obtention de
teneurs en extrait sec soluble comprises entre 15,33 et 28,23 % constitue un indice de qualité
élevée chez la plupart des variétés. L’évaluation des propriétés pomologiques chimiques a
révélé une excellente qualité des fruits et de très bons scores chez 18 variétés.Parmi ces
variétés, ‘Meroudji’, ‘Chetoui’ et ‘Harcha’ offrent de nouvelles opportunités aux producteurs
de figues et doivent être plantées à grande échelle. Les variétés ‘Enk El H’mam’ et ‘Ramliya’
enregistrent les meilleures performances qualitatives avec des scores respectifs de 824 et 770
et méritent d’être candidats à la labellisation.
Les marqueurs moléculaires et morphologiques utilisés dans cette étude se sont avérés
efficients pour l’analyse du polymorphisme génétique des ressources du figuier. Leur
conservation servira pour de futurs travaux de recherches ainsi que pour la constitution d’une
base de données nationale.
Directeur de thèse : BENCHEIKH Mohamed Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 1528 02-34-104 Version numérique et papier Bibliothèque Centrale Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
02-34-104.pdfAdobe Acrobat PDF Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie / BOUGOUTAIA Youcef
Titre : Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie Type de document : document électronique Auteurs : BOUGOUTAIA Youcef, Auteur Année de publication : 2017-2018 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : ADN chloroplastique, Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, cytogénétique, hybridation in situ fluorescente, taille du génome, phylogénie, phylogéographie, polyploïdie. Résumé : Le projet d’étude porte sur une caractérisation génétique par des approches de cytogénétique classique et moléculaire et de phylogénie et phylogéographie de différentes populations d’Artemisia herba-alba couvrant toute l’aire de répartition de ce taxon en Algérie
Au terme de cette étude, deux nombres chromosomiques 2n = 2x = 18 et 2n = 4x = 36 chez l’espèce Artemisia herba-alba de l’Algérie, ont été révélés, avec une coexistence des deux cytotypes dans la même population dans deux populations, occupant une position géographique plus ou moins centrale dans la zone étudiée. Le cytotype diploïde 2n = 2x = 18 a été détecté pour la première fois en Algérie. Quatre signaux (2 loci) ont été détectés par le FISH dans les cytotypes diploïdes et huit (4 loci) dans des cytotypes tétraploïdes pour les deux gènes d'ADN ribosomique. Les deux gènes se colocalisent sur le même site chromosomique, et présentent en conséquence, une organisation de type L (liée). La taille du génome reflète bien les deux niveaux de ploïdie, avec une réduction relative de la quantité d’ADN nucléaire dans les cytotypes polyploïdes. La température minimale de janvier «tm» semble être le facteur déterminant dans la distribution spatiale des deux cytotypes. L’étude phylogénétique et phylogéographique par l’utilisation des séquences de l’ADNcp, portée sur 17 populations d’Artemisia herba-alba a montré un faible niveau de diversité génétique. Toutefois, il y a suffisamment de variation sur l’ADNcp pour qu’un signal phylogéographique soit détecté. La région du Centre-Est s’est montré la plus diversifiée. L’origine d’Artemisia herba-alba dans le Hoggar est probablement dérivée des populations situées dans la limite sud de la zone étudiée par le biais de corridors biologiques établis à la fin du Miocène entre les écosystèmes méditerranéens et sahariens centraux. Les montagnes du Sahara Central ont constitué ainsi des refuges biogéographiques cruciaux pour ce taxon.
Directeur de thèse : KAID-HARCHE Meriem Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie [document électronique] / BOUGOUTAIA Youcef, Auteur . - 2017-2018 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : ADN chloroplastique, Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, cytogénétique, hybridation in situ fluorescente, taille du génome, phylogénie, phylogéographie, polyploïdie. Résumé : Le projet d’étude porte sur une caractérisation génétique par des approches de cytogénétique classique et moléculaire et de phylogénie et phylogéographie de différentes populations d’Artemisia herba-alba couvrant toute l’aire de répartition de ce taxon en Algérie
Au terme de cette étude, deux nombres chromosomiques 2n = 2x = 18 et 2n = 4x = 36 chez l’espèce Artemisia herba-alba de l’Algérie, ont été révélés, avec une coexistence des deux cytotypes dans la même population dans deux populations, occupant une position géographique plus ou moins centrale dans la zone étudiée. Le cytotype diploïde 2n = 2x = 18 a été détecté pour la première fois en Algérie. Quatre signaux (2 loci) ont été détectés par le FISH dans les cytotypes diploïdes et huit (4 loci) dans des cytotypes tétraploïdes pour les deux gènes d'ADN ribosomique. Les deux gènes se colocalisent sur le même site chromosomique, et présentent en conséquence, une organisation de type L (liée). La taille du génome reflète bien les deux niveaux de ploïdie, avec une réduction relative de la quantité d’ADN nucléaire dans les cytotypes polyploïdes. La température minimale de janvier «tm» semble être le facteur déterminant dans la distribution spatiale des deux cytotypes. L’étude phylogénétique et phylogéographique par l’utilisation des séquences de l’ADNcp, portée sur 17 populations d’Artemisia herba-alba a montré un faible niveau de diversité génétique. Toutefois, il y a suffisamment de variation sur l’ADNcp pour qu’un signal phylogéographique soit détecté. La région du Centre-Est s’est montré la plus diversifiée. L’origine d’Artemisia herba-alba dans le Hoggar est probablement dérivée des populations situées dans la limite sud de la zone étudiée par le biais de corridors biologiques établis à la fin du Miocène entre les écosystèmes méditerranéens et sahariens centraux. Les montagnes du Sahara Central ont constitué ainsi des refuges biogéographiques cruciaux pour ce taxon.
Directeur de thèse : KAID-HARCHE Meriem Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 1527 02-34-103 Version numérique et papier Bibliothèque Centrale Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
02-34-103.pdfAdobe Acrobat PDF Etude éxpérimentale et in-silico de l'activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale / HAMZI Wahiba
Titre : Etude éxpérimentale et in-silico de l'activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale Type de document : document électronique Auteurs : HAMZI Wahiba, Auteur Année de publication : 2019/2020 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Résumé :
En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Etude éxpérimentale et in-silico de l'activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale [document électronique] / HAMZI Wahiba, Auteur . - 2019/2020 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Résumé :
En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité aucun exemplaire Documents numériques
02-34-118.pdfAdobe Acrobat PDF Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. / Wahiba HAMZI
Titre : Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. Type de document : document électronique Auteurs : Wahiba HAMZI, Auteur Année de publication : 16-12-2020 Importance : 156 p. Présentation : ill. Format : A4 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Index. décimale : Biologie Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale. [document électronique] / Wahiba HAMZI, Auteur . - 16-12-2020 . - 156 p. : ill. ; A4 + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Virus de la grippe, Antivirale, Camphre, Dérivés de diimines, DFT, RSA, RQSA. Index. décimale : Biologie Résumé : En raison de la capacité du virus de la grippe à développer une résistance aux médicaments, la mise au point de nouveaux antiviraux est un objectif important de la science médicale et des systèmes de soins de santé. Le but de cette thèse est d’étudier l’activité antivirale in vitro et in silico de la molécule du Camphre 1,7,7-triméthylbicyclo,heptan-2-one. Nous avons évalué l'activité antivirale in vitro avec trois différentes concentrations, le calcul de la DCIT50 à donner les valeurs suivantes 104,83 ,104 pour les concentrations choisies, un faible pourcentage d'effet cytopathogène de 5% a révélé l'absence de l'effet antiviral du Camphre sur les cellules MDCK inoculées avec le virus de la grippe (G243/12AH1N1pdm09). Dans le but de réaliser une étude in-silico, on a utilisé des méthodes de modélisation moléculaire dans notre travail Hartree-Fock et la théorie de la densité Fonctionnelle afin de déterminer les paramètres structuraux, électroniques et énergétiques associés aux molécules étudiées. La nature de type du substituant influe sur les paramètres électroniques et énergétiques de la molécule du Camphre. En effet, cette étude nous permet de prédire la réactivité chimique des dérivés du Camphre, nous concluons aussi que la méthode DFT (B3LYP) avec la base 6-311G+(d,p) est la meilleure méthode pour approfondir notre recherche.
Nous avons également effectué une analyse des relations structure-activité(RSA) appliquée à vingt-cinq molécules de diimines symétriques à base de camphre, un modèle de régression linéaire multiple a été utilisé pour corréler les relations entre l'activité biologique des dérivés de diimines symétriques à base de camphre, la prédiction du modèle est estimée par validation croisée avec la méthode d'exclusion.
Les résultats que nous avons obtenus suggèrent un modèle relation quantitative structure-activité (RQSA) basé sur différents les descripteurs parmi eux le volume moléculaire (VM), l’énergie d’hydratation (EH) la polarisabilité (POL), réfractivité molaire (RM), énergie totale (Et) pour l'inhibition de la reproduction du virus de la grippe afin de confirmer le pouvoir prédictif des modèles. La forte corrélation entre les données expérimentales et les données prévues a été observée, ce qui indique la bonne qualité du modèle RQSA.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 34118 02-34-118 Version numérique et papier Bibliothèque Centrale Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
Étude expérimentale et in-silico de l’activité biologique de certains dérivés de la molécule du Camphre et son activité antivirale.Adobe Acrobat PDF
Titre : Etude in sillico de la thalidomide :Apport de la modélisation moléculaire Type de document : document électronique Auteurs : DERMECHE Keltoum, Auteur Année de publication : 14-12-2017 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Thalidomide, Enantiomère, Modélisation moléculaire, HF, DFT, QSAR, MLR Résumé : La thalidomide a été commercialisée comme sédatif hypnotique destinée aux femmes enceintes en 1957, puis retirée dans les années 60 due aux malformations congénitales qui ont conduit aux graves problèmes tératogènes provoqués par l’énantiomère S de la thalidomide alors que l’énantiomère R de la thalidomide avait l’effet thérapeutique recherché.
Ce travail a pour objectif de discuter les différentes méthodes et approches computationnelles; utilisées dans la conception des médicaments assistée par ordinateur.
Les paramètres structuraux, électroniques, énergétiques et les fréquences de vibration des énantiomères S et R de la thalidomide ont été calculés par les méthodes de la modélisation moléculaire: ab initio / HF et DFT/B3LYP. Une étude qualitative de la relation structure-activité a été effectuée également pour une série de dérivés de la thalidomide.
La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier les relations entre les descripteurs moléculaires et la propriété de l’activité anti inflammatoire des dérivés de la thalidomide ; La prédiction des modèles obtenus a été confirmé par la méthode de validation croisée LOO.
Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites de l’activité spécifique, ce qui indique la validité et la qualité des modèles QSAR obtenus.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Etude in sillico de la thalidomide :Apport de la modélisation moléculaire [document électronique] / DERMECHE Keltoum, Auteur . - 14-12-2017 . - + CD.
Langues : Français (fre)
Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : Thalidomide, Enantiomère, Modélisation moléculaire, HF, DFT, QSAR, MLR Résumé : La thalidomide a été commercialisée comme sédatif hypnotique destinée aux femmes enceintes en 1957, puis retirée dans les années 60 due aux malformations congénitales qui ont conduit aux graves problèmes tératogènes provoqués par l’énantiomère S de la thalidomide alors que l’énantiomère R de la thalidomide avait l’effet thérapeutique recherché.
Ce travail a pour objectif de discuter les différentes méthodes et approches computationnelles; utilisées dans la conception des médicaments assistée par ordinateur.
Les paramètres structuraux, électroniques, énergétiques et les fréquences de vibration des énantiomères S et R de la thalidomide ont été calculés par les méthodes de la modélisation moléculaire: ab initio / HF et DFT/B3LYP. Une étude qualitative de la relation structure-activité a été effectuée également pour une série de dérivés de la thalidomide.
La régression linéaire multiple (MLR) a été utilisée pour quantifier les relations entre les descripteurs moléculaires et la propriété de l’activité anti inflammatoire des dérivés de la thalidomide ; La prédiction des modèles obtenus a été confirmé par la méthode de validation croisée LOO.
Une forte corrélation a été observée entre les valeurs expérimentales et prédites de l’activité spécifique, ce qui indique la validité et la qualité des modèles QSAR obtenus.
Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité 1448 02-34-101 Version numérique et papier Bibliothèque Centrale Thèse de Doctorat Exclu du prêt Documents numériques
Etude in sillico de la thalidomide :Apport de la modélisation moléculaireAdobe Acrobat PDF Recherche d’activité biologique de molécules végétales pour la lutte contre Fusarium oxysporum f. sp. albedinis / MEBARKI Lakhdar
PermalinkValorisation du Figuier de Barbarie (Opuntia ficus-indica L.) : Isolement et Identification Moléculaire des Bactéries Endophytes à caractère PGPR et Caractérisation des Polysaccharides Pariétaux des Raquettes. / DRAOU Nassima
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