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Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie / BOUGOUTAIA Youcef 

Public ISBD Titre : Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie Type de document : texte imprimé Auteurs : BOUGOUTAIA Youcef, Auteur Année de publication : 2017-2018 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : ADN chloroplastique, Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, cytogénétique, hybridation in situ fluorescente, taille du génome, phylogénie, phylogéographie, polyploïdie. Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, chloroplast DNA, cytogenetic, fluorescent in situ hybridization, genome size, phylogeny, phylogeography, polyploidy. Résumé : Le projet d’étude porte sur une caractérisation génétique par des approches de cytogénétique classique et moléculaire et de phylogénie et phylogéographie de différentes populations d’Artemisia herba-alba couvrant toute l’aire de répartition de ce taxon en Algérie Au terme de cette étude, deux nombres chromosomiques 2n = 2x = 18 et 2n = 4x = 36 chez l’espèce Artemisia herba-alba de l’Algérie, ont été révélés, avec une coexistence des deux cytotypes dans la même population dans deux populations, occupant une position géographique plus ou moins centrale dans la zone étudiée. Le cytotype diploïde 2n = 2x = 18 a été détecté pour la première fois en Algérie. Quatre signaux (2 loci) ont été détectés par le FISH dans les cytotypes diploïdes et huit (4 loci) dans des cytotypes tétraploïdes pour les deux gènes d'ADN ribosomique. Les deux gènes se colocalisent sur le même site chromosomique, et présentent en conséquence, une organisation de type L (liée). La taille du génome reflète bien les deux niveaux de ploïdie, avec une réduction relative de la quantité d’ADN nucléaire dans les cytotypes polyploïdes. La température minimale de janvier «tm» semble être le facteur déterminant dans la distribution spatiale des deux cytotypes. L’étude phylogénétique et phylogéographique par l’utilisation des séquences de l’ADNcp, portée sur 17 populations d’Artemisia herba-alba a montré un faible niveau de diversité génétique. Toutefois, il y a suffisamment de variation sur l’ADNcp pour qu’un signal phylogéographique soit détecté. La région du Centre-Est s’est montré la plus diversifiée. L’origine d’Artemisia herba-alba dans le Hoggar est probablement dérivée des populations situées dans la limite sud de la zone étudiée par le biais de corridors biologiques établis à la fin du Miocène entre les écosystèmes méditerranéens et sahariens centraux. Les montagnes du Sahara Central ont constitué ainsi des refuges biogéographiques cruciaux pour ce taxon. The project concerns a genetic characterization by classical and molecular cytogenetic approaches and phylogeny and phylogeography of different populations of Artemisia herbaalba covering the whole range of this taxon in Algeria. At the end of this study, two chromosome numbers 2n = 2x = 18 and 2n = 4x = 36 in the species Artemisia herba-alba from Algeria were revealed, with a coexistence of two cytotypes in the same population in two populations, occupying a more or less central geographic position in the study area. The diploid cytotype 2n = 2x = 18 was detected for the first time in Algeria. Four signals (2 loci) were detected by FISH in diploid cytotypes and eight (4 loci) in tetraploid cytotypes for both ribosomal DNA genes. Both genes are colocalized on the same chromosomal site, and therefore have an L (linked) organization. The genome size reflects both poidy levels, with a relative reduction of nuclear DNA amount in the polyploid cytotypes. The minimum temperature of January "tm" seems to be the determining factor in the spatial distribution of the two cytotypes. The phylogenetic and phylogeographic studies using cpDNA sequences in 17 populations of Artemisia herba-alba showed a low level of genetic diversity. However, there is enough variation on the cpDNA for a phylogeographic signal to be detected. The Central-East region was the most diverse. The origin of Artemisia herba-alba in Hoggar is probably derived from populations in the southern boundary of the study area through late Miocene biological corridors between Mediterranean and central Saharan ecosystems. The mountains of the Central Sahara have thus become crucial biogeographic refuges for this taxon. Directeur de thèse : KAID-HARCHE Meriem Étude du complexe Artemisia herba-alba Asso d’Algérie par des approches pluridisciplinaires: cytogénétique classique, cytogénétique moléculaire, phylogénie et phylogéographie [texte imprimé] / BOUGOUTAIA Youcef, Auteur . - 2017-2018 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : Biotechnologie :Biotechnologie Mots-clés : ADN chloroplastique, Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, cytogénétique, hybridation in situ fluorescente, taille du génome, phylogénie, phylogéographie, polyploïdie. Anthemideae, Artemisia herba-alba, Asteraceae, chloroplast DNA, cytogenetic, fluorescent in situ hybridization, genome size, phylogeny, phylogeography, polyploidy. Résumé : Le projet d’étude porte sur une caractérisation génétique par des approches de cytogénétique classique et moléculaire et de phylogénie et phylogéographie de différentes populations d’Artemisia herba-alba couvrant toute l’aire de répartition de ce taxon en Algérie Au terme de cette étude, deux nombres chromosomiques 2n = 2x = 18 et 2n = 4x = 36 chez l’espèce Artemisia herba-alba de l’Algérie, ont été révélés, avec une coexistence des deux cytotypes dans la même population dans deux populations, occupant une position géographique plus ou moins centrale dans la zone étudiée. Le cytotype diploïde 2n = 2x = 18 a été détecté pour la première fois en Algérie. Quatre signaux (2 loci) ont été détectés par le FISH dans les cytotypes diploïdes et huit (4 loci) dans des cytotypes tétraploïdes pour les deux gènes d'ADN ribosomique. Les deux gènes se colocalisent sur le même site chromosomique, et présentent en conséquence, une organisation de type L (liée). La taille du génome reflète bien les deux niveaux de ploïdie, avec une réduction relative de la quantité d’ADN nucléaire dans les cytotypes polyploïdes. La température minimale de janvier «tm» semble être le facteur déterminant dans la distribution spatiale des deux cytotypes. L’étude phylogénétique et phylogéographique par l’utilisation des séquences de l’ADNcp, portée sur 17 populations d’Artemisia herba-alba a montré un faible niveau de diversité génétique. Toutefois, il y a suffisamment de variation sur l’ADNcp pour qu’un signal phylogéographique soit détecté. La région du Centre-Est s’est montré la plus diversifiée. L’origine d’Artemisia herba-alba dans le Hoggar est probablement dérivée des populations situées dans la limite sud de la zone étudiée par le biais de corridors biologiques établis à la fin du Miocène entre les écosystèmes méditerranéens et sahariens centraux. Les montagnes du Sahara Central ont constitué ainsi des refuges biogéographiques cruciaux pour ce taxon. The project concerns a genetic characterization by classical and molecular cytogenetic approaches and phylogeny and phylogeography of different populations of Artemisia herbaalba covering the whole range of this taxon in Algeria. At the end of this study, two chromosome numbers 2n = 2x = 18 and 2n = 4x = 36 in the species Artemisia herba-alba from Algeria were revealed, with a coexistence of two cytotypes in the same population in two populations, occupying a more or less central geographic position in the study area. The diploid cytotype 2n = 2x = 18 was detected for the first time in Algeria. Four signals (2 loci) were detected by FISH in diploid cytotypes and eight (4 loci) in tetraploid cytotypes for both ribosomal DNA genes. Both genes are colocalized on the same chromosomal site, and therefore have an L (linked) organization. The genome size reflects both poidy levels, with a relative reduction of nuclear DNA amount in the polyploid cytotypes. The minimum temperature of January "tm" seems to be the determining factor in the spatial distribution of the two cytotypes. The phylogenetic and phylogeographic studies using cpDNA sequences in 17 populations of Artemisia herba-alba showed a low level of genetic diversity. However, there is enough variation on the cpDNA for a phylogeographic signal to be detected. The Central-East region was the most diverse. The origin of Artemisia herba-alba in Hoggar is probably derived from populations in the southern boundary of the study area through late Miocene biological corridors between Mediterranean and central Saharan ecosystems. The mountains of the Central Sahara have thus become crucial biogeographic refuges for this taxon. Directeur de thèse : KAID-HARCHE Meriem

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Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
1527	02-34-103	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

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