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L'acide D-glucarique et ses formes D-glucaro-lactones:Etude théorique et mise à profit du mécanisme de lactonisation pour la formation d'analogues de nucléosides / AMARA Sarah

Public ISBD Titre : L'acide D-glucarique et ses formes D-glucaro-lactones:Etude théorique et mise à profit du mécanisme de lactonisation pour la formation d'analogues de nucléosides Type de document : document électronique Auteurs : AMARA Sarah, Auteur Année de publication : 2018-2019 Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : CHIMIE:Chimie physique Mots-clés : Acide D-glucarique  D-glucaro-dilactones  D-glucaro-1,4-lactone  D-glucaro-6,3-lactone  Mécanisme de lactonisation  Analogues de nucléosides  Modélisation moléculaire. D-glucaric acid  D-glucaro-dilactones  D-glucaro-1,4-lactone  D-glucaro-6,3-lactone  Mechanism of lactonization  Nucleoside analogues  Molecular modeling. حمض Dـ غلوكارك ؛D ـ غلوكارو-ثنائي اللاكتون ؛D ـ غلوكارو1-،-4 لاكتون ؛D ـ غلوكارو6-،-3 لاكتون ؛ آلية تكوين اللاكتونات ؛ مضاهئ نوكليوزيد ؛ النمذجة الجزيئية. Résumé : Cette thèse présente une étude théorique et une mise à profit du mécanisme de lactonisation de l’acide D-glucarique en faveur de la formation d’une nouvelle classe d’analogues de nucléosides. Pour commencer, une étude comparative entre les deux D-glucaro-dilactones a pu expliquer la stabilité prononcée de la D-glucaro-1,4:6,3-dilactone par rapport à son isomère la D-glucaro-1,5:6,3-dilactone. Ensuite, une approche théorique pour la résolution de l’équilibre de l’acide D-glucarique en milieu aqueux a été réalisée. Pour cela, nous avons envisagé deux mécanismes réactionnels et proposé 4 modèles à simuler. Nos résultats ont indiqué que l’intervention de molécules d’eau facilite considérablement le mécanisme de lactonisation, et qu’une microsolvatation aqueuse appliquée sur la fonction acide carboxylique permet de reproduire les observations expérimentales rapportées dans la littérature. Pour finir, nous avons proposé une nouvelle classe d’analogues de nucléosides dérivés de l’acide D-glucarique avant leurs synthèses. Ainsi, nous avons conçu des molécules de type « Acyclo-C-nucléoside à une seule tête » capables d’être en équilibre avec leur forme cyclique correspondante en milieu biologique grâce à une lactonisation, et avons comparé ces molécules à l’acide D-glucarique et ses monolactones pris comme référence. Les résultats de cette étude encouragent fortement cette synthèse qui pourrait s’avérer biologiquement bénéfique. This thesis presents a theoretical study and a profit taking of the mechanism of lactonization of D-glucaric acid in favor of the formation of a new class of nucleoside analogues. To begin with, a comparative study between the two D-glucaro-dilactones explained the pronounced stability of D-glucaro-1,4:6,3-dilactone compared to its isomer the D-glucaro-1,5:6,3-dilactone. Next, a theoretical approach to the resolution of the equilibrium of D-glucaric acid in an aqueous medium was carried out. For that, we have considered two reaction mechanisms and proposed four models to simulate. Our results indicated that the intervention of water molecules considerably facilitates the mechanism of lactonisation, and that an aqueous microsolvatation applied on the carboxylic acid function makes it possible to reproduce the experimental observations reported in the literature. Finally, we proposed a new class of nucleoside analogues derived from D-glucaric acid before their syntheses. Thus, we designed molecules of the type « Single-headed acyclo-C-nucleoside » able to be in equilibrium with their corresponding cyclic form in biological medium through lactonization, and compared these molecules with D-glucaric acid and its monolactones taken as a reference. The results of this study strongly encourage this synthesis which could prove to be biologically beneficial. تقدم رسالة الدكتوراه هذه دراسة نظرية وطريقة لاستغلال آلية تكوين اللاكتونات لحمض Dـ غلوكارك لصالح تشكيل فئة جديدة من مضاهئ نوكليوزيد. في البداية، قمنا بالمقارنة بين اثنين من Dـ غلوكارو-ثنائي اللاكتون لشرح الاستقرار الواضح ل -D : غلوكارو1-،6:4،-3 ثنائي اللاكتون بالمقارنة مع ال : -Dغلوكارو1-،6:5،-3 ثنائي اللاكتون .بعد ذلك، تم تنفيذ مقاربة نظرية لحل توازن حمض Dـ غلوكارك في الوسط المائي. فقد قمنا باقتراح آليتين للتفاعل و أربعة نماذج للمحاكاة .أشارت نتائجنا إلى أن تدخل جزيئة الماء يسهّل إلى حد كبير عملية تكوين اللاكتونات، وأنّ إضافة جزيئة ماء أخرى قرب حمض الكربوكسيليك يجعل من الممكن محاكاة الملاحظات التجريبية الواردة في المجلّات العلمية . و في الأخير، إقترحنا نوع جديدة من مضاهئ نوكليوزيد المشتقة من حمض Dـ غلوكارك قبل التوليف، وهي جزيئات » أحادية الرأس من نوع سلاسل مفتوحة بارتباط كاربوني « قادرة على أن تكون متوازنة مع شكلها الدوري المقابل في وسط بيولوجي من خلال تكوين لاكتونات، و قارنا هذه الجزيئات الجديدة مع حمض Dـ غلوكارك و لاكتوناته التي أخذناها كمرجع. نتائج هذه الدراسة تشجع بقوة صناعة هذه المركّبات التي يمكن أن تكون مفيدة جدا بيولوجيا. Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine L'acide D-glucarique et ses formes D-glucaro-lactones:Etude théorique et mise à profit du mécanisme de lactonisation pour la formation d'analogues de nucléosides [document électronique] / AMARA Sarah, Auteur . - 2018-2019 . -  + CD. Langues : Français (fre) Catégories : CHIMIE:Chimie physique Mots-clés : Acide D-glucarique  D-glucaro-dilactones  D-glucaro-1,4-lactone  D-glucaro-6,3-lactone  Mécanisme de lactonisation  Analogues de nucléosides  Modélisation moléculaire. D-glucaric acid  D-glucaro-dilactones  D-glucaro-1,4-lactone  D-glucaro-6,3-lactone  Mechanism of lactonization  Nucleoside analogues  Molecular modeling. حمض Dـ غلوكارك ؛D ـ غلوكارو-ثنائي اللاكتون ؛D ـ غلوكارو1-،-4 لاكتون ؛D ـ غلوكارو6-،-3 لاكتون ؛ آلية تكوين اللاكتونات ؛ مضاهئ نوكليوزيد ؛ النمذجة الجزيئية. Résumé : Cette thèse présente une étude théorique et une mise à profit du mécanisme de lactonisation de l’acide D-glucarique en faveur de la formation d’une nouvelle classe d’analogues de nucléosides. Pour commencer, une étude comparative entre les deux D-glucaro-dilactones a pu expliquer la stabilité prononcée de la D-glucaro-1,4:6,3-dilactone par rapport à son isomère la D-glucaro-1,5:6,3-dilactone. Ensuite, une approche théorique pour la résolution de l’équilibre de l’acide D-glucarique en milieu aqueux a été réalisée. Pour cela, nous avons envisagé deux mécanismes réactionnels et proposé 4 modèles à simuler. Nos résultats ont indiqué que l’intervention de molécules d’eau facilite considérablement le mécanisme de lactonisation, et qu’une microsolvatation aqueuse appliquée sur la fonction acide carboxylique permet de reproduire les observations expérimentales rapportées dans la littérature. Pour finir, nous avons proposé une nouvelle classe d’analogues de nucléosides dérivés de l’acide D-glucarique avant leurs synthèses. Ainsi, nous avons conçu des molécules de type « Acyclo-C-nucléoside à une seule tête » capables d’être en équilibre avec leur forme cyclique correspondante en milieu biologique grâce à une lactonisation, et avons comparé ces molécules à l’acide D-glucarique et ses monolactones pris comme référence. Les résultats de cette étude encouragent fortement cette synthèse qui pourrait s’avérer biologiquement bénéfique. This thesis presents a theoretical study and a profit taking of the mechanism of lactonization of D-glucaric acid in favor of the formation of a new class of nucleoside analogues. To begin with, a comparative study between the two D-glucaro-dilactones explained the pronounced stability of D-glucaro-1,4:6,3-dilactone compared to its isomer the D-glucaro-1,5:6,3-dilactone. Next, a theoretical approach to the resolution of the equilibrium of D-glucaric acid in an aqueous medium was carried out. For that, we have considered two reaction mechanisms and proposed four models to simulate. Our results indicated that the intervention of water molecules considerably facilitates the mechanism of lactonisation, and that an aqueous microsolvatation applied on the carboxylic acid function makes it possible to reproduce the experimental observations reported in the literature. Finally, we proposed a new class of nucleoside analogues derived from D-glucaric acid before their syntheses. Thus, we designed molecules of the type « Single-headed acyclo-C-nucleoside » able to be in equilibrium with their corresponding cyclic form in biological medium through lactonization, and compared these molecules with D-glucaric acid and its monolactones taken as a reference. The results of this study strongly encourage this synthesis which could prove to be biologically beneficial. تقدم رسالة الدكتوراه هذه دراسة نظرية وطريقة لاستغلال آلية تكوين اللاكتونات لحمض Dـ غلوكارك لصالح تشكيل فئة جديدة من مضاهئ نوكليوزيد. في البداية، قمنا بالمقارنة بين اثنين من Dـ غلوكارو-ثنائي اللاكتون لشرح الاستقرار الواضح ل -D : غلوكارو1-،6:4،-3 ثنائي اللاكتون بالمقارنة مع ال : -Dغلوكارو1-،6:5،-3 ثنائي اللاكتون .بعد ذلك، تم تنفيذ مقاربة نظرية لحل توازن حمض Dـ غلوكارك في الوسط المائي. فقد قمنا باقتراح آليتين للتفاعل و أربعة نماذج للمحاكاة .أشارت نتائجنا إلى أن تدخل جزيئة الماء يسهّل إلى حد كبير عملية تكوين اللاكتونات، وأنّ إضافة جزيئة ماء أخرى قرب حمض الكربوكسيليك يجعل من الممكن محاكاة الملاحظات التجريبية الواردة في المجلّات العلمية . و في الأخير، إقترحنا نوع جديدة من مضاهئ نوكليوزيد المشتقة من حمض Dـ غلوكارك قبل التوليف، وهي جزيئات » أحادية الرأس من نوع سلاسل مفتوحة بارتباط كاربوني « قادرة على أن تكون متوازنة مع شكلها الدوري المقابل في وسط بيولوجي من خلال تكوين لاكتونات، و قارنا هذه الجزيئات الجديدة مع حمض Dـ غلوكارك و لاكتوناته التي أخذناها كمرجع. نتائج هذه الدراسة تشجع بقوة صناعة هذه المركّبات التي يمكن أن تكون مفيدة جدا بيولوجيا. Directeur de thèse : TCHOUAR Noureddine

Exemplaires

Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
1596	02-06-831	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Thèse de Doctorat	Exclu du prêt

Synthèse, caractérisation et évaluation de l’activité antibactérienne de nouveaux C-Nucléosides à double s base s dérivant du D -Glucose / AMARA Sarah 

Public ISBD Titre : Synthèse, caractérisation et évaluation de l’activité antibactérienne de nouveaux C-Nucléosides à double s base s dérivant du D -Glucose Type de document : document électronique Auteurs : AMARA Sarah, Auteur ; ALI -OTHMANE Adel, Directeur de thèse Année de publication : 2009-2010 Importance : 94 p. Accompagnement : CD Langues : Français (fre) Catégories : CHIMIE:Option : Ingénierie Biomoléculaire Mots-clés : Synthèse  nucléosides  C-Nucléosides  Glucose  dilacération  Tf  IR  RMN-1H et RMN-13C. Résumé : Le travail présenté dans ce mémoire est basé sur la synthèse de nouveaux analogues de nucléosides à doubles bases dérivant du D-Glucose. Ces derniers sont : Le 5,5'-(1,2,3,4-tetrahydroxybutane-1,4-diyl)bis(1,3,4-oxadiazole-2(3H)-thione), le 1,4-bis(4- amino-5-mercapto-4H-1,2,4-triazol-3-yl)butane-1,2,3,4-tetrol et le 1,4-bis(5-mercapto-4H- 1,2,4-triazol-3-yl)butane-1,2,3,4-tetrol. Différents exemples de synthèse d’analogues nucléosidiques, obtenus par greffage d’un ose (ou dérivés) sur une base azotée (ou dérivés) ou inversement, ont été largement étudiés. Ces synthèses nécessitaient des réactions de protection et de déprotection pas toujours facile à réaliser et qui diminuent le rendement. La particularité de ce travail repose sur le fait que l’analogue nucléosidique à double base est synthétisé à partir du monosaccharide lui-même. Il n’y a donc pas nécessité de greffage. Ceci a été possible grâce à la formation d’une dilactone qui confère la protection nécessaire à la molécule et permet donc le bon déroulement de la réaction. Les étapes de protection et de déprotection sont donc évitées. La préparation de ces nouveaux composés a nécessité le passage par plusieurs intermédiaires, et leur caractérisation a été réalisée par des méthodes physico-chimiques telles que : Tf, IR, RMN-1H et RMN-13C. Ces analogues ont montré une efficacité prouvée sur un ensemble de bactéries (gram + et gram -). Il serait donc intéressant de réaliser des tests antiviraux et antifongiques afin de compléter l’analyse antimicrobienne. Il serait également possible d’effectuer la synthèse d’autres analogues nucléosidiques à partir des différents monosaccharides, qu’ils soient sous forme de pentoses, hexoses ou même heptoses. Synthèse, caractérisation et évaluation de l’activité antibactérienne de nouveaux C-Nucléosides à double s base s dérivant du D -Glucose [document électronique] / AMARA Sarah, Auteur ; ALI -OTHMANE Adel, Directeur de thèse . - 2009-2010 . - 94 p. + CD. Langues : Français (fre) Catégories : CHIMIE:Option : Ingénierie Biomoléculaire Mots-clés : Synthèse  nucléosides  C-Nucléosides  Glucose  dilacération  Tf  IR  RMN-1H et RMN-13C. Résumé : Le travail présenté dans ce mémoire est basé sur la synthèse de nouveaux analogues de nucléosides à doubles bases dérivant du D-Glucose. Ces derniers sont : Le 5,5'-(1,2,3,4-tetrahydroxybutane-1,4-diyl)bis(1,3,4-oxadiazole-2(3H)-thione), le 1,4-bis(4- amino-5-mercapto-4H-1,2,4-triazol-3-yl)butane-1,2,3,4-tetrol et le 1,4-bis(5-mercapto-4H- 1,2,4-triazol-3-yl)butane-1,2,3,4-tetrol. Différents exemples de synthèse d’analogues nucléosidiques, obtenus par greffage d’un ose (ou dérivés) sur une base azotée (ou dérivés) ou inversement, ont été largement étudiés. Ces synthèses nécessitaient des réactions de protection et de déprotection pas toujours facile à réaliser et qui diminuent le rendement. La particularité de ce travail repose sur le fait que l’analogue nucléosidique à double base est synthétisé à partir du monosaccharide lui-même. Il n’y a donc pas nécessité de greffage. Ceci a été possible grâce à la formation d’une dilactone qui confère la protection nécessaire à la molécule et permet donc le bon déroulement de la réaction. Les étapes de protection et de déprotection sont donc évitées. La préparation de ces nouveaux composés a nécessité le passage par plusieurs intermédiaires, et leur caractérisation a été réalisée par des méthodes physico-chimiques telles que : Tf, IR, RMN-1H et RMN-13C. Ces analogues ont montré une efficacité prouvée sur un ensemble de bactéries (gram + et gram -). Il serait donc intéressant de réaliser des tests antiviraux et antifongiques afin de compléter l’analyse antimicrobienne. Il serait également possible d’effectuer la synthèse d’autres analogues nucléosidiques à partir des différents monosaccharides, qu’ils soient sous forme de pentoses, hexoses ou même heptoses.

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Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
5476	02-06-492	Version numérique et papier	Bibliothèque USTOMB	Mémoire de Magister	Exclu du prêt

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